Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2PTM9

Protein Details
Accession A0A0D2PTM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-194HMAKDCPKKRSNPPRSDKPWWKEQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR045358  Ty3_capsid  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
Amino Acid Sequences MSTAIAATTTTTEKGELKFTIKPFDGKRENYSAFEASAAIYLKLNADKYNNDEKQILWVLGHLSEGTASTWRNDYLRLHQTAGVFDISNQKIADFMRDLKAAFDSTTEETDAENELRILKQGTMPAEEFFTEFELLCGRAKIIDDKHKIELLKQTMNQRLLTKIVYSESHMAKDCPKKRSNPPRSDKPWWKEQEPRSGNNNYARSSNRSTENSEHAARKFTKDSARKFIREIEWENEDEKEAFLNEYDPEDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.22
3 0.22
4 0.24
5 0.29
6 0.31
7 0.36
8 0.35
9 0.4
10 0.4
11 0.48
12 0.52
13 0.5
14 0.54
15 0.55
16 0.56
17 0.52
18 0.52
19 0.43
20 0.35
21 0.31
22 0.25
23 0.17
24 0.17
25 0.15
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.14
31 0.15
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.24
36 0.34
37 0.34
38 0.34
39 0.34
40 0.32
41 0.35
42 0.35
43 0.29
44 0.18
45 0.18
46 0.16
47 0.15
48 0.15
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.22
63 0.29
64 0.3
65 0.3
66 0.31
67 0.31
68 0.29
69 0.28
70 0.21
71 0.14
72 0.13
73 0.19
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.18
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.13
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.11
129 0.15
130 0.23
131 0.27
132 0.3
133 0.32
134 0.34
135 0.34
136 0.32
137 0.34
138 0.29
139 0.29
140 0.3
141 0.35
142 0.38
143 0.4
144 0.4
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.26
149 0.2
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.15
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.2
158 0.2
159 0.25
160 0.34
161 0.38
162 0.41
163 0.45
164 0.5
165 0.61
166 0.71
167 0.75
168 0.76
169 0.79
170 0.81
171 0.85
172 0.88
173 0.87
174 0.81
175 0.8
176 0.76
177 0.72
178 0.71
179 0.68
180 0.69
181 0.64
182 0.64
183 0.6
184 0.57
185 0.57
186 0.56
187 0.54
188 0.44
189 0.44
190 0.42
191 0.42
192 0.45
193 0.44
194 0.42
195 0.41
196 0.45
197 0.45
198 0.48
199 0.47
200 0.46
201 0.46
202 0.41
203 0.45
204 0.41
205 0.42
206 0.39
207 0.4
208 0.45
209 0.49
210 0.55
211 0.58
212 0.64
213 0.62
214 0.61
215 0.63
216 0.6
217 0.58
218 0.56
219 0.51
220 0.48
221 0.47
222 0.45
223 0.38
224 0.34
225 0.27
226 0.22
227 0.18
228 0.14
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.12