FuNGI

A0A0D2LD41

Protein Details

Accession

A0A0D2LD41

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-32	STTAPVHTKPSKTRKEKEKEREKAERKASLP	Hydrophilic
67-92	AVWKIYCPGKLRKKLNKENIPSRAYI	Hydrophilic
439-462	PAKAHVPPSPRKEKARRGGRGGAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-29	KPSKTRKEKEKEREKAERKA
223-232	EEKKKATAAP
252-257	AKKGKK
298-309	AKPAKPSRPPRG
437-465	PPPAKAHVPPSPRKEKARRGGRGGAAGGG
519-543	GAGRGGRRGRGGGRGRGGAVANAPR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTTAPVHTKPSKTRKEKEKEREKAERKASLPQQNERLKTVVRRLPPNLPEEIFWNSVQVWVSDDTAVWKIYCPGKLRKKLNKENIPSRAYIAFKDEDQLAAFSRGYDGHVFRDKAGVESQAVVEFAPYPKIPSEKRKADPRNGTIEKDEDYISFLETLKAAENAEPVSLETLIASAQPTPHPKTTPLLEALKAEKSANKDKEAILRNHAHYNNMSVAALRKEEKKKATAAPPPKADANGNAAAANSAQPSAKKGKKAAAAAAAAATATQNAKNAPQGAAAANAKNAPNTGAPGAQPAKPAKPSRPPRGSQNKAAAAAAKDAARTDTPTILSAPSTQPNASTSGTSAPASVAAPAAGAAGGGRRTRPVVGLASRQFEAALSGVSGLANAATERKRRERERDTQGAAANGGGGTPVPPTPTTAGSFARIDGSDTERPPPPAKAHVPPSPRKEKARRGGRGGAAGGGGGGAPPSTPQVKVPSILQRAPEPAQKDAPAASATAAPNGEGSVPPAEGSASGGGAGRGGRRGRGGGRGRGGAVANAPRGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.83
3	0.87
4	0.91
5	0.92
6	0.92
7	0.91
8	0.91
9	0.92
10	0.89
11	0.88
12	0.85
13	0.83
14	0.74
15	0.74
16	0.74
17	0.72
18	0.71
19	0.69
20	0.7
21	0.7
22	0.71
23	0.64
24	0.58
25	0.54
26	0.54
27	0.56
28	0.53
29	0.52
30	0.57
31	0.59
32	0.64
33	0.65
34	0.61
35	0.57
36	0.51
37	0.44
38	0.4
39	0.4
40	0.33
41	0.28
42	0.26
43	0.2
44	0.22
45	0.21
46	0.18
47	0.15
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.16
54	0.16
55	0.14
56	0.13
57	0.17
58	0.21
59	0.26
60	0.29
61	0.38
62	0.48
63	0.57
64	0.67
65	0.73
66	0.79
67	0.85
68	0.9
69	0.9
70	0.89
71	0.89
72	0.87
73	0.8
74	0.7
75	0.62
76	0.56
77	0.47
78	0.39
79	0.34
80	0.27
81	0.23
82	0.25
83	0.22
84	0.18
85	0.17
86	0.17
87	0.14
88	0.14
89	0.14
90	0.12
91	0.12
92	0.12
93	0.13
94	0.16
95	0.16
96	0.19
97	0.26
98	0.27
99	0.26
100	0.3
101	0.28
102	0.26
103	0.26
104	0.22
105	0.16
106	0.17
107	0.17
108	0.14
109	0.13
110	0.11
111	0.1
112	0.09
113	0.09
114	0.11
115	0.1
116	0.12
117	0.14
118	0.2
119	0.25
120	0.33
121	0.42
122	0.48
123	0.55
124	0.64
125	0.7
126	0.75
127	0.79
128	0.74
129	0.75
130	0.69
131	0.65
132	0.56
133	0.5
134	0.42
135	0.34
136	0.29
137	0.19
138	0.18
139	0.15
140	0.13
141	0.12
142	0.11
143	0.1
144	0.09
145	0.1
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.06
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.06
163	0.05
164	0.06
165	0.1
166	0.15
167	0.19
168	0.22
169	0.23
170	0.25
171	0.28
172	0.29
173	0.3
174	0.29
175	0.28
176	0.26
177	0.26
178	0.27
179	0.25
180	0.23
181	0.2
182	0.18
183	0.21
184	0.29
185	0.3
186	0.31
187	0.31
188	0.32
189	0.39
190	0.43
191	0.4
192	0.37
193	0.39
194	0.39
195	0.44
196	0.43
197	0.37
198	0.31
199	0.31
200	0.26
201	0.22
202	0.19
203	0.12
204	0.14
205	0.13
206	0.14
207	0.13
208	0.19
209	0.24
210	0.3
211	0.33
212	0.33
213	0.37
214	0.41
215	0.47
216	0.48
217	0.52
218	0.52
219	0.51
220	0.51
221	0.47
222	0.42
223	0.35
224	0.28
225	0.25
226	0.2
227	0.18
228	0.16
229	0.15
230	0.14
231	0.13
232	0.11
233	0.06
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.09
238	0.17
239	0.2
240	0.22
241	0.24
242	0.29
243	0.34
244	0.35
245	0.34
246	0.31
247	0.28
248	0.25
249	0.22
250	0.17
251	0.12
252	0.1
253	0.07
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.08
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.09
266	0.12
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.17
284	0.18
285	0.2
286	0.25
287	0.28
288	0.29
289	0.37
290	0.45
291	0.52
292	0.58
293	0.58
294	0.62
295	0.7
296	0.7
297	0.67
298	0.65
299	0.58
300	0.52
301	0.5
302	0.41
303	0.31
304	0.27
305	0.21
306	0.14
307	0.11
308	0.1
309	0.11
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.13
317	0.12
318	0.12
319	0.12
320	0.13
321	0.14
322	0.15
323	0.14
324	0.14
325	0.15
326	0.17
327	0.16
328	0.14
329	0.12
330	0.13
331	0.14
332	0.14
333	0.13
334	0.09
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.07
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.12
354	0.14
355	0.16
356	0.19
357	0.26
358	0.28
359	0.29
360	0.29
361	0.28
362	0.25
363	0.2
364	0.18
365	0.11
366	0.08
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.03
374	0.03
375	0.04
376	0.07
377	0.11
378	0.16
379	0.22
380	0.3
381	0.39
382	0.46
383	0.57
384	0.62
385	0.68
386	0.73
387	0.76
388	0.71
389	0.67
390	0.62
391	0.52
392	0.43
393	0.33
394	0.24
395	0.15
396	0.11
397	0.06
398	0.05
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.07
403	0.07
404	0.1
405	0.12
406	0.15
407	0.16
408	0.19
409	0.2
410	0.21
411	0.22
412	0.2
413	0.2
414	0.17
415	0.17
416	0.16
417	0.2
418	0.23
419	0.23
420	0.27
421	0.28
422	0.31
423	0.32
424	0.35
425	0.32
426	0.35
427	0.4
428	0.44
429	0.48
430	0.52
431	0.58
432	0.62
433	0.67
434	0.69
435	0.7
436	0.73
437	0.76
438	0.78
439	0.8
440	0.83
441	0.81
442	0.79
443	0.81
444	0.74
445	0.69
446	0.59
447	0.49
448	0.38
449	0.3
450	0.22
451	0.13
452	0.1
453	0.05
454	0.04
455	0.03
456	0.03
457	0.04
458	0.07
459	0.09
460	0.1
461	0.13
462	0.2
463	0.22
464	0.24
465	0.29
466	0.35
467	0.4
468	0.42
469	0.41
470	0.38
471	0.42
472	0.44
473	0.43
474	0.37
475	0.35
476	0.37
477	0.36
478	0.34
479	0.3
480	0.29
481	0.24
482	0.21
483	0.17
484	0.18
485	0.17
486	0.18
487	0.17
488	0.15
489	0.14
490	0.14
491	0.14
492	0.1
493	0.12
494	0.11
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.1
500	0.12
501	0.1
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.08
506	0.09
507	0.11
508	0.11
509	0.16
510	0.18
511	0.2
512	0.22
513	0.27
514	0.3
515	0.38
516	0.44
517	0.46
518	0.51
519	0.51
520	0.49
521	0.48
522	0.45
523	0.37
524	0.35
525	0.32

A0A0D2LD41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer