Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2LIM5

Protein Details
Accession A0A0D2LIM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
412-432QTISHSSRRINQRKRLRDEAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 5, extr 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00382  TFIIB  
CDD cd00043  CYCLIN_SF  
Amino Acid Sequences MTDFIKSLAVSFGATGLSPRAITLFTQAKSASNFRWGQKSRGVAAACLAIALREANRPDSIRDIASILKVSASSVSREFMSVTSTLKLALTLVDPSVHISTLQNHLAFALQQHRQICGLPRSLVTSLQKLCLRSTARTAVSLSQLLARFSPHHDVLRLPVAPTACGIFMLALEAEDRGILNPLGDLAQFLGSPCYAAKSVVMDRYKIVQDEVARWIDKVPWLDKYESRNGRAKVSKRLVVARGLKDVIQFQEDIWQRRIQPLLNVDLGSDEDLSEARQPIQHGSPSPYKRPKLNHALIQTAHFLLDPLGKTVSSTMLAFKEGQTKVASKSLPGLPLATYMLTNASTSMIRRPPTRLQLLAQDRGGVSEEQIPDDELFTPGELEGFLRNNDEIQVFRSVFGWNDGEDSSEKSQTISHSSRRINQRKRLRDEAESEEQPTRNSDLLRKKKSRINMEAFAQFLAEGHNDSDGNSQDSMDAGLLGLDEVVQDCGFDDHDDHDNSQNDHSCKSVSMLVQGVTSTQQWNTKHTSKALGCNDGDDEELVLEDWRPPSPEPIIGGLYSQYEEEYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.18
11 0.23
12 0.22
13 0.26
14 0.26
15 0.28
16 0.32
17 0.36
18 0.31
19 0.33
20 0.38
21 0.38
22 0.48
23 0.49
24 0.5
25 0.52
26 0.55
27 0.49
28 0.51
29 0.48
30 0.37
31 0.36
32 0.32
33 0.25
34 0.2
35 0.16
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.15
42 0.18
43 0.22
44 0.24
45 0.25
46 0.29
47 0.3
48 0.26
49 0.25
50 0.24
51 0.22
52 0.23
53 0.22
54 0.16
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.18
66 0.14
67 0.15
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.14
88 0.19
89 0.22
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.17
96 0.19
97 0.18
98 0.22
99 0.23
100 0.24
101 0.24
102 0.27
103 0.31
104 0.29
105 0.3
106 0.27
107 0.27
108 0.3
109 0.3
110 0.33
111 0.29
112 0.31
113 0.28
114 0.33
115 0.35
116 0.32
117 0.32
118 0.34
119 0.34
120 0.3
121 0.34
122 0.35
123 0.33
124 0.34
125 0.34
126 0.3
127 0.29
128 0.28
129 0.22
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.16
136 0.18
137 0.23
138 0.21
139 0.22
140 0.23
141 0.23
142 0.25
143 0.29
144 0.26
145 0.21
146 0.2
147 0.19
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.11
186 0.13
187 0.2
188 0.21
189 0.2
190 0.2
191 0.24
192 0.24
193 0.21
194 0.19
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.2
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.16
207 0.19
208 0.21
209 0.24
210 0.27
211 0.31
212 0.38
213 0.39
214 0.42
215 0.44
216 0.43
217 0.47
218 0.5
219 0.49
220 0.49
221 0.5
222 0.5
223 0.45
224 0.49
225 0.44
226 0.44
227 0.46
228 0.38
229 0.35
230 0.32
231 0.3
232 0.26
233 0.26
234 0.19
235 0.14
236 0.12
237 0.1
238 0.17
239 0.19
240 0.22
241 0.22
242 0.24
243 0.23
244 0.25
245 0.27
246 0.2
247 0.21
248 0.2
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.16
253 0.15
254 0.14
255 0.11
256 0.09
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.17
271 0.25
272 0.27
273 0.34
274 0.4
275 0.41
276 0.44
277 0.48
278 0.51
279 0.53
280 0.55
281 0.53
282 0.48
283 0.48
284 0.44
285 0.41
286 0.34
287 0.24
288 0.19
289 0.13
290 0.11
291 0.08
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.17
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.19
312 0.19
313 0.23
314 0.22
315 0.15
316 0.2
317 0.2
318 0.2
319 0.19
320 0.17
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.1
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.13
335 0.16
336 0.18
337 0.2
338 0.25
339 0.31
340 0.37
341 0.4
342 0.37
343 0.35
344 0.42
345 0.45
346 0.43
347 0.37
348 0.31
349 0.27
350 0.25
351 0.25
352 0.16
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.11
380 0.15
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.14
385 0.14
386 0.16
387 0.15
388 0.1
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.16
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.16
399 0.17
400 0.24
401 0.25
402 0.28
403 0.35
404 0.38
405 0.45
406 0.55
407 0.64
408 0.66
409 0.71
410 0.76
411 0.78
412 0.83
413 0.85
414 0.78
415 0.74
416 0.7
417 0.68
418 0.65
419 0.56
420 0.51
421 0.45
422 0.41
423 0.36
424 0.32
425 0.27
426 0.22
427 0.23
428 0.28
429 0.34
430 0.44
431 0.54
432 0.58
433 0.61
434 0.65
435 0.72
436 0.74
437 0.73
438 0.71
439 0.66
440 0.64
441 0.61
442 0.56
443 0.47
444 0.36
445 0.26
446 0.18
447 0.14
448 0.1
449 0.08
450 0.08
451 0.1
452 0.09
453 0.11
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.09
463 0.08
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.03
470 0.03
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.09
480 0.11
481 0.17
482 0.19
483 0.2
484 0.26
485 0.28
486 0.29
487 0.33
488 0.37
489 0.33
490 0.32
491 0.31
492 0.26
493 0.24
494 0.24
495 0.25
496 0.19
497 0.21
498 0.22
499 0.21
500 0.21
501 0.2
502 0.18
503 0.15
504 0.16
505 0.14
506 0.15
507 0.21
508 0.22
509 0.27
510 0.34
511 0.39
512 0.42
513 0.43
514 0.5
515 0.48
516 0.56
517 0.58
518 0.56
519 0.51
520 0.48
521 0.46
522 0.38
523 0.34
524 0.24
525 0.19
526 0.12
527 0.12
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.12
533 0.13
534 0.16
535 0.17
536 0.22
537 0.25
538 0.27
539 0.27
540 0.29
541 0.3
542 0.27
543 0.27
544 0.23
545 0.21
546 0.18
547 0.15