FuNGI

A0A0D2Q9Y1

Protein Details

Accession

A0A0D2Q9Y1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	EAPSTSKKKSKGRSKADAGIN	Hydrophilic
504-554	DKDEKKARKTAIKAERQQRRMEKKSTKEQFGAEVKDQKKRIGNKELRLKKL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
114-120	KKKSKGR
272-273	KK
503-554	EDKDEKKARKTAIKAERQQRRMEKKSTKEQFGAEVKDQKKRIGNKELRLKKL

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPSKSIFRQPGAKHFQLVHRSQRDPLINDPDASVHVLKPFERDNTKKGKSRADLEDLLSPEDLIEGRQNVGEASLYGVYFDDTEYDYMRHLRPVGIQEDGVDSVLLEAPSTSKKKSKGRSKADAGINLLDLPDGVLASTSELPRTYESQQAVPASIAGFQPDMDAHLRQVLEALENDAFVEDELEDDFFSQLVADGERGSDEEVDFEFRAEGIDRVDEHSQVLDEDVSWQQRFADFKKNQADTKKTSDDGYDSGGDTVGTLPAISVIGGKKKRRAASDASGYSMSSSSMVRNEALQTLDDRFDQMILREYNEDEDEEDLHSHDDNDSDEAPELITSRDDFDSMVNTFLNDFEILGRKMKPKMEGESGVDKLDIFRRTMGQDERNRLADIGAEDDVRIDDLFPEKDDKDRWDCETILTTYTNIENHPRLIRARDPRPTPKIVLDRKTGLPLVVSAAEKTEKTKAPARLAPFSGSDDTEGSDTDTDQGELKCMRSQAVGRPRNEDKDEKKARKTAIKAERQQRRMEKKSTKEQFGAEVKDQKKRIGNKELRLKKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.55
3	0.59
4	0.59
5	0.61
6	0.61
7	0.6
8	0.6
9	0.59
10	0.63
11	0.61
12	0.56
13	0.56
14	0.54
15	0.49
16	0.47
17	0.44
18	0.37
19	0.32
20	0.31
21	0.25
22	0.18
23	0.19
24	0.2
25	0.2
26	0.23
27	0.26
28	0.3
29	0.38
30	0.42
31	0.46
32	0.55
33	0.62
34	0.66
35	0.68
36	0.7
37	0.67
38	0.7
39	0.69
40	0.66
41	0.62
42	0.56
43	0.56
44	0.47
45	0.43
46	0.35
47	0.27
48	0.19
49	0.17
50	0.14
51	0.1
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.12
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.11
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.11
74	0.12
75	0.16
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.19
80	0.22
81	0.27
82	0.27
83	0.25
84	0.24
85	0.22
86	0.22
87	0.21
88	0.17
89	0.12
90	0.09
91	0.08
92	0.1
93	0.09
94	0.07
95	0.06
96	0.08
97	0.14
98	0.17
99	0.2
100	0.24
101	0.32
102	0.41
103	0.52
104	0.61
105	0.66
106	0.73
107	0.79
108	0.81
109	0.81
110	0.78
111	0.72
112	0.64
113	0.54
114	0.45
115	0.35
116	0.27
117	0.18
118	0.12
119	0.08
120	0.05
121	0.04
122	0.03
123	0.04
124	0.04
125	0.06
126	0.09
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.12
131	0.14
132	0.18
133	0.18
134	0.21
135	0.23
136	0.24
137	0.26
138	0.26
139	0.24
140	0.2
141	0.18
142	0.13
143	0.13
144	0.11
145	0.09
146	0.08
147	0.07
148	0.08
149	0.07
150	0.09
151	0.09
152	0.1
153	0.09
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.11
159	0.1
160	0.1
161	0.12
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.07
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.06
201	0.07
202	0.07
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.06
212	0.05
213	0.07
214	0.08
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.12
220	0.15
221	0.16
222	0.25
223	0.23
224	0.3
225	0.38
226	0.41
227	0.42
228	0.46
229	0.49
230	0.43
231	0.49
232	0.45
233	0.38
234	0.36
235	0.33
236	0.28
237	0.24
238	0.21
239	0.15
240	0.12
241	0.11
242	0.11
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.05
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.05
255	0.12
256	0.17
257	0.19
258	0.25
259	0.3
260	0.34
261	0.35
262	0.39
263	0.39
264	0.41
265	0.47
266	0.42
267	0.38
268	0.35
269	0.32
270	0.28
271	0.21
272	0.15
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.07
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.1
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.12
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.14
299	0.14
300	0.13
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.1
330	0.1
331	0.11
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.09
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.1
341	0.11
342	0.13
343	0.15
344	0.18
345	0.22
346	0.24
347	0.29
348	0.29
349	0.33
350	0.36
351	0.37
352	0.37
353	0.39
354	0.37
355	0.32
356	0.28
357	0.23
358	0.19
359	0.22
360	0.19
361	0.14
362	0.14
363	0.16
364	0.17
365	0.23
366	0.27
367	0.31
368	0.36
369	0.41
370	0.43
371	0.43
372	0.43
373	0.37
374	0.32
375	0.25
376	0.19
377	0.16
378	0.13
379	0.11
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.05
386	0.06
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.14
391	0.14
392	0.18
393	0.2
394	0.25
395	0.28
396	0.3
397	0.33
398	0.33
399	0.33
400	0.31
401	0.33
402	0.28
403	0.25
404	0.22
405	0.19
406	0.16
407	0.18
408	0.17
409	0.14
410	0.18
411	0.18
412	0.21
413	0.23
414	0.24
415	0.25
416	0.29
417	0.36
418	0.4
419	0.46
420	0.51
421	0.57
422	0.64
423	0.68
424	0.68
425	0.63
426	0.61
427	0.64
428	0.64
429	0.62
430	0.58
431	0.56
432	0.53
433	0.54
434	0.46
435	0.36
436	0.28
437	0.23
438	0.2
439	0.18
440	0.16
441	0.13
442	0.14
443	0.16
444	0.15
445	0.18
446	0.22
447	0.22
448	0.26
449	0.34
450	0.38
451	0.44
452	0.49
453	0.52
454	0.52
455	0.51
456	0.49
457	0.44
458	0.41
459	0.35
460	0.3
461	0.26
462	0.2
463	0.19
464	0.17
465	0.15
466	0.13
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.14
473	0.13
474	0.16
475	0.17
476	0.18
477	0.2
478	0.2
479	0.2
480	0.21
481	0.25
482	0.31
483	0.4
484	0.46
485	0.45
486	0.52
487	0.57
488	0.61
489	0.63
490	0.63
491	0.59
492	0.62
493	0.71
494	0.72
495	0.74
496	0.73
497	0.75
498	0.74
499	0.74
500	0.74
501	0.73
502	0.76
503	0.77
504	0.81
505	0.83
506	0.79
507	0.82
508	0.82
509	0.82
510	0.8
511	0.81
512	0.81
513	0.8
514	0.86
515	0.86
516	0.83
517	0.76
518	0.7
519	0.68
520	0.65
521	0.62
522	0.58
523	0.58
524	0.55
525	0.59
526	0.59
527	0.57
528	0.59
529	0.61
530	0.64
531	0.66
532	0.71
533	0.72
534	0.81

A0A0D2Q9Y1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer