Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2NX09

Protein Details
Accession A0A0D2NX09    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-43TIPISSNKKKGAKDKSKKASASAHydrophilic
243-265EVDPEIKVKKGKKRKGDVDAAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-39KKKGAKDKSKKA
249-276KVKKGKKRKGDVDAAEAPPKKSKKSKVA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 10.999, cyto_nucl 10.666, mito 7, cyto_mito 6.999, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MARPSPSPSSSSSSSVTPPPTIPISSNKKKGAKDKSKKASASADAGKNEGADLNWAYVPPADTVRVGEEDVDADEFDWETLKNDNDLELCLIRVPESIKPKHLDKLEVTFSTSSQTACIGTLNRKYSSFDIWSIGDGDEQPVGGEEIKSLSCLLPRKGKKGEFYPEPKPIARHLVINAQPIRPTHTSPAVRQNPPRFSYPQEVLKHRYVPYGSVDAAAAELDAMVVDSEPQSPPTVPESLVAEVDPEIKVKKGKKRKGDVDAAEAPPKKSKKSKVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.34
4 0.3
5 0.27
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.27
10 0.32
11 0.39
12 0.46
13 0.54
14 0.58
15 0.62
16 0.67
17 0.74
18 0.76
19 0.77
20 0.79
21 0.81
22 0.83
23 0.85
24 0.8
25 0.76
26 0.72
27 0.64
28 0.61
29 0.57
30 0.52
31 0.44
32 0.44
33 0.39
34 0.31
35 0.27
36 0.2
37 0.13
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.13
83 0.21
84 0.22
85 0.26
86 0.3
87 0.32
88 0.36
89 0.37
90 0.36
91 0.3
92 0.34
93 0.34
94 0.31
95 0.3
96 0.25
97 0.23
98 0.21
99 0.19
100 0.13
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.12
108 0.17
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.23
113 0.24
114 0.25
115 0.23
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.09
139 0.12
140 0.15
141 0.23
142 0.25
143 0.31
144 0.37
145 0.41
146 0.42
147 0.45
148 0.5
149 0.48
150 0.52
151 0.52
152 0.51
153 0.51
154 0.48
155 0.43
156 0.38
157 0.37
158 0.32
159 0.28
160 0.24
161 0.29
162 0.3
163 0.35
164 0.35
165 0.29
166 0.29
167 0.28
168 0.32
169 0.26
170 0.26
171 0.23
172 0.3
173 0.32
174 0.34
175 0.44
176 0.46
177 0.5
178 0.56
179 0.6
180 0.58
181 0.58
182 0.59
183 0.51
184 0.48
185 0.49
186 0.46
187 0.47
188 0.46
189 0.48
190 0.49
191 0.51
192 0.51
193 0.45
194 0.44
195 0.36
196 0.32
197 0.32
198 0.29
199 0.25
200 0.21
201 0.2
202 0.15
203 0.15
204 0.12
205 0.08
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.13
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.17
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.2
237 0.27
238 0.37
239 0.47
240 0.56
241 0.65
242 0.75
243 0.82
244 0.85
245 0.87
246 0.81
247 0.79
248 0.77
249 0.7
250 0.67
251 0.6
252 0.53
253 0.51
254 0.5
255 0.5
256 0.52