Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2MDR8

Protein Details
Accession A0A0D2MDR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-281PPPKVKAAPTKPKKVKNPPPTSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-276RRTPPRVPSPLPPPKAARAVKPIPRARAELPPKPAQPPPVATAPPPPPPPKVKAAPTKPKKVKNP
293-298AKRSRP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027093  EAF_fam  
IPR019194  Tscrpt_elong_fac_Eaf_N  
Gene Ontology GO:0032783  C:super elongation complex  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09816  EAF  
Amino Acid Sequences MASSSSWMPPQGRHTVNIGSSLNRAIKNRKLKGSPAPTTKRSNLPERDFYSFKFNFKASSTDATKAGSIETTKGPENTLVRAEYPSTQKKAGEVHKFNGVEQTARDVDCILIYDEDTGQYTLEKLDSYIQLKFDRKVMVSPQPASPAPIATGKGKAKQEESDMASAVEEDPPRQTDVKRQTDATNLDEIMRQAVAMRREEEEEEGGEVEPPRRTPPRVPSPLPPPKAARAVKPIPRARAELPPKPAQPPPVATAPPPPPPPKVKAAPTKPKKVKNPPPTSYPDEEVIEFGKPAKRSRPSPPRQVAPPPRISSPVSLSFPGGSTPAFAPPPAPPVAKPAVARNIPPAPAPQPEMPPSPPIMQLDSDDDDEEDWEQVPTVTPVIAQPDYEAELEEAIFGDGFSDADGGEDIDVNAFEQEMNEQMDPDSEDDFLAAMISPEPERPATGQPISLNRLASGTGAADSDEDDFSSSDESDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.41
4 0.43
5 0.38
6 0.31
7 0.3
8 0.33
9 0.34
10 0.33
11 0.37
12 0.38
13 0.46
14 0.55
15 0.61
16 0.64
17 0.64
18 0.67
19 0.73
20 0.75
21 0.75
22 0.75
23 0.76
24 0.73
25 0.76
26 0.74
27 0.72
28 0.69
29 0.69
30 0.69
31 0.68
32 0.71
33 0.68
34 0.69
35 0.62
36 0.57
37 0.57
38 0.5
39 0.45
40 0.4
41 0.36
42 0.32
43 0.32
44 0.35
45 0.29
46 0.34
47 0.35
48 0.34
49 0.34
50 0.32
51 0.31
52 0.27
53 0.23
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.19
59 0.2
60 0.21
61 0.21
62 0.24
63 0.25
64 0.25
65 0.25
66 0.24
67 0.22
68 0.23
69 0.24
70 0.24
71 0.3
72 0.35
73 0.35
74 0.36
75 0.36
76 0.37
77 0.43
78 0.47
79 0.5
80 0.47
81 0.46
82 0.51
83 0.51
84 0.49
85 0.47
86 0.39
87 0.29
88 0.25
89 0.28
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.14
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.24
118 0.27
119 0.28
120 0.28
121 0.28
122 0.26
123 0.28
124 0.3
125 0.34
126 0.36
127 0.37
128 0.34
129 0.35
130 0.35
131 0.33
132 0.29
133 0.2
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.15
138 0.22
139 0.22
140 0.28
141 0.3
142 0.31
143 0.31
144 0.31
145 0.33
146 0.32
147 0.33
148 0.28
149 0.25
150 0.23
151 0.2
152 0.18
153 0.14
154 0.12
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.21
163 0.31
164 0.38
165 0.39
166 0.4
167 0.39
168 0.43
169 0.45
170 0.39
171 0.31
172 0.24
173 0.22
174 0.21
175 0.2
176 0.14
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.14
199 0.16
200 0.19
201 0.24
202 0.32
203 0.41
204 0.47
205 0.49
206 0.5
207 0.58
208 0.64
209 0.61
210 0.55
211 0.47
212 0.43
213 0.49
214 0.46
215 0.39
216 0.38
217 0.42
218 0.45
219 0.51
220 0.51
221 0.47
222 0.47
223 0.47
224 0.42
225 0.44
226 0.44
227 0.4
228 0.42
229 0.43
230 0.42
231 0.42
232 0.41
233 0.36
234 0.32
235 0.29
236 0.27
237 0.25
238 0.25
239 0.22
240 0.26
241 0.26
242 0.28
243 0.3
244 0.3
245 0.3
246 0.34
247 0.37
248 0.37
249 0.39
250 0.42
251 0.47
252 0.54
253 0.61
254 0.64
255 0.71
256 0.73
257 0.76
258 0.79
259 0.8
260 0.81
261 0.82
262 0.84
263 0.77
264 0.75
265 0.73
266 0.69
267 0.62
268 0.53
269 0.44
270 0.35
271 0.32
272 0.26
273 0.21
274 0.15
275 0.12
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.23
281 0.28
282 0.33
283 0.43
284 0.53
285 0.57
286 0.65
287 0.69
288 0.67
289 0.66
290 0.72
291 0.71
292 0.67
293 0.67
294 0.59
295 0.54
296 0.52
297 0.49
298 0.41
299 0.36
300 0.34
301 0.28
302 0.26
303 0.25
304 0.22
305 0.21
306 0.18
307 0.14
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.14
320 0.2
321 0.23
322 0.25
323 0.25
324 0.26
325 0.32
326 0.32
327 0.33
328 0.33
329 0.33
330 0.31
331 0.3
332 0.28
333 0.23
334 0.25
335 0.28
336 0.25
337 0.26
338 0.29
339 0.32
340 0.3
341 0.29
342 0.3
343 0.28
344 0.27
345 0.25
346 0.24
347 0.21
348 0.21
349 0.22
350 0.22
351 0.21
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.08
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.12
426 0.12
427 0.14
428 0.17
429 0.22
430 0.27
431 0.28
432 0.3
433 0.32
434 0.38
435 0.41
436 0.41
437 0.36
438 0.29
439 0.29
440 0.25
441 0.22
442 0.16
443 0.13
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.12
456 0.11