Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2L4C6

Protein Details
Accession A0A0D2L4C6    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
333-355LTMPSTRRSRGGRRRHRDGEPTLBasic
406-436MARSSNDPGRRRRSERPVRTAERPRKTQQELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-246RR
340-348RSRGGRRRH
413-430PGRRRRSERPVRTAERPR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MENTPAEFTAEEITALSYDDSVAYEEQVPTDAERASLAKRIGTSKVYLLSESSAIARGGKTWEPDARVDRISLKRKHDDGEDEDRMMEDDEMEDSLVYRSNAILLNGSPIAHLPTARIFVYATHFDAHPMGLEWVDDNTCVLVFESKRDARSAFSRLQKSTAEEPDMDEYFTGKPFPVALWPPEERITETLGQGQGLKGIIRMRWAKVDDVKKKGAMKESKFYQKHGSSAGKELFDGRDLPPAKRRRGDRHEDDEMRKAQLDDELDQFLAEDDKEEEKQEKQEEVESDVPGSPPSRMRSDYIAGDGRTLLERTSVLRLHGAAADEQPDLATRLTMPSTRRSRGGRRRHRDGEPTLEVKSSLHDRMQAPFSERLEWGPGPDRKQESSRRGGVGRNRDRDRDLAINGMARSSNDPGRRRRSERPVRTAERPRKTQQELDDELDAFLNHG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.1
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.15
18 0.14
19 0.11
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.22
27 0.26
28 0.28
29 0.29
30 0.29
31 0.28
32 0.32
33 0.31
34 0.29
35 0.27
36 0.24
37 0.22
38 0.2
39 0.18
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.16
46 0.18
47 0.2
48 0.23
49 0.27
50 0.29
51 0.34
52 0.36
53 0.36
54 0.35
55 0.34
56 0.37
57 0.42
58 0.48
59 0.5
60 0.54
61 0.58
62 0.59
63 0.61
64 0.58
65 0.56
66 0.53
67 0.56
68 0.51
69 0.44
70 0.41
71 0.38
72 0.33
73 0.27
74 0.2
75 0.1
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.1
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.09
101 0.11
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.11
106 0.12
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.18
133 0.2
134 0.22
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.27
139 0.29
140 0.29
141 0.35
142 0.39
143 0.38
144 0.41
145 0.39
146 0.39
147 0.4
148 0.37
149 0.31
150 0.26
151 0.27
152 0.27
153 0.26
154 0.22
155 0.16
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.22
171 0.22
172 0.19
173 0.18
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.2
192 0.21
193 0.22
194 0.27
195 0.36
196 0.38
197 0.4
198 0.41
199 0.41
200 0.43
201 0.42
202 0.44
203 0.42
204 0.39
205 0.4
206 0.44
207 0.51
208 0.49
209 0.48
210 0.48
211 0.41
212 0.39
213 0.39
214 0.37
215 0.29
216 0.33
217 0.33
218 0.25
219 0.24
220 0.23
221 0.18
222 0.15
223 0.15
224 0.11
225 0.16
226 0.17
227 0.19
228 0.26
229 0.32
230 0.36
231 0.4
232 0.46
233 0.49
234 0.56
235 0.64
236 0.64
237 0.65
238 0.69
239 0.69
240 0.65
241 0.61
242 0.54
243 0.45
244 0.37
245 0.3
246 0.22
247 0.19
248 0.18
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.13
265 0.18
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.22
270 0.22
271 0.25
272 0.26
273 0.21
274 0.2
275 0.19
276 0.18
277 0.15
278 0.15
279 0.12
280 0.13
281 0.16
282 0.19
283 0.2
284 0.22
285 0.25
286 0.28
287 0.27
288 0.27
289 0.28
290 0.24
291 0.23
292 0.21
293 0.18
294 0.16
295 0.15
296 0.11
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.14
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.15
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.08
317 0.08
318 0.06
319 0.08
320 0.1
321 0.14
322 0.15
323 0.24
324 0.31
325 0.33
326 0.39
327 0.44
328 0.53
329 0.6
330 0.69
331 0.71
332 0.73
333 0.81
334 0.82
335 0.83
336 0.81
337 0.76
338 0.74
339 0.69
340 0.62
341 0.53
342 0.46
343 0.4
344 0.31
345 0.28
346 0.24
347 0.21
348 0.2
349 0.24
350 0.25
351 0.3
352 0.33
353 0.32
354 0.32
355 0.35
356 0.35
357 0.32
358 0.31
359 0.28
360 0.3
361 0.28
362 0.26
363 0.3
364 0.33
365 0.34
366 0.41
367 0.43
368 0.42
369 0.5
370 0.56
371 0.55
372 0.59
373 0.61
374 0.58
375 0.57
376 0.6
377 0.6
378 0.62
379 0.64
380 0.65
381 0.65
382 0.64
383 0.65
384 0.6
385 0.58
386 0.53
387 0.44
388 0.39
389 0.35
390 0.35
391 0.32
392 0.3
393 0.25
394 0.2
395 0.22
396 0.22
397 0.27
398 0.31
399 0.39
400 0.47
401 0.57
402 0.65
403 0.69
404 0.75
405 0.79
406 0.82
407 0.86
408 0.86
409 0.87
410 0.84
411 0.87
412 0.88
413 0.87
414 0.86
415 0.83
416 0.81
417 0.8
418 0.8
419 0.77
420 0.74
421 0.73
422 0.69
423 0.65
424 0.6
425 0.51
426 0.45
427 0.38