Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2PPB6

Protein Details
Accession A0A0D2PPB6    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-561FSAPKPKPKKLPSFNKKPPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
473-498KTKKRKPESAPGPKGSGAQPLKKAAV
543-559APKPKPKKLPSFNKKPP
903-917RGRGRGGGGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDYSQWEQQRTGPDPSTAAPASDLNDFADLPGEHAGPAAARHHSPRPGPSSSAMAATFFSPYVIPNANFHYQAAPYPTIAYGQPWSTAVPLSSYSSLVGATTNASPQPQAPPLPQHSPPQQHQQPHPSSSGHMVIESAFSSLSSPVLHSPPSSPLLSLNGVATSSIQSAFPAPTSYSDQQQQQQQQSHQQQQQHQQLQQLQQQQQQQSQSQSQMQARGQYYNPPIVYPYYRHQQAASAPQGTLSPIALHSPTGSLMNIQPTSFYPQPQQMAPNSPVASTSQQPIQQYNTPATSPPAPAPAGPTPEEREERKRVFQASIRPLLQPAAFTGAQAVRELTDRIAEYGLSEVDAATRLDIVGAIRDGAGNHYFRAWSENATAIDITREWIKAAARGNNALLVETTMPLLHLIDRLPLDVLGLMESKLGKIIKKLVKDEPSPAIKDLAANLERKWRNMLSNADGGARAPENNGAEDSKTKKRKPESAPGPKGSGAQPLKKAAVGTAGSVRPLAVKREPVAGKIPPAASGAAAAAAKDAAKADSSFFSAPKPKPKKLPSFNKKPPAPASGAGVAQASPLNAFEEALKSMKSRNSPAAPTPPPTGGAGSAAGAGGASGSGRGLRRKKSVTWAPDDRLESVRFIEKAVYDDDPVDGTHVAHSLRDLDRGEGAALHAHLFEETIDWAEPLLVDLPPEPEGHTRFVRGSASQEKSTQEEREQSALSAVYMSPNQIPDSPAEPAVVLTDDEVDREAKTMSVGAALDALFQWGAEPALPPPGAAASVAELVGQLAMGSLMDVGGGAPGAPAQMDMQGAASATLAAVQGLLPQDQLQQLLAQLSSSASAAAGPPYGLQNPPQQPQPPTQQQLAAYAAEGWGQSLYDYGHHQYAEDGAGAGGAADQQQQRGWADSGRGRGRGGGGRGRGRGAESKPYQYNAFNNARKKPCSFFAAGRCKYGDLCDFMHEMEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.4
4 0.32
5 0.28
6 0.23
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.15
12 0.16
13 0.15
14 0.13
15 0.16
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.15
20 0.13
21 0.14
22 0.14
23 0.1
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.17
28 0.22
29 0.29
30 0.35
31 0.39
32 0.45
33 0.48
34 0.49
35 0.5
36 0.48
37 0.47
38 0.41
39 0.4
40 0.32
41 0.26
42 0.23
43 0.2
44 0.19
45 0.13
46 0.12
47 0.09
48 0.1
49 0.14
50 0.18
51 0.18
52 0.2
53 0.26
54 0.29
55 0.29
56 0.29
57 0.27
58 0.23
59 0.26
60 0.28
61 0.24
62 0.21
63 0.22
64 0.21
65 0.2
66 0.2
67 0.19
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.13
85 0.11
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.19
95 0.22
96 0.24
97 0.26
98 0.33
99 0.38
100 0.44
101 0.45
102 0.47
103 0.52
104 0.57
105 0.58
106 0.61
107 0.62
108 0.64
109 0.68
110 0.71
111 0.68
112 0.64
113 0.62
114 0.52
115 0.48
116 0.45
117 0.41
118 0.31
119 0.25
120 0.21
121 0.18
122 0.18
123 0.16
124 0.12
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.09
132 0.11
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.2
138 0.23
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.22
143 0.22
144 0.21
145 0.17
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.14
161 0.21
162 0.23
163 0.25
164 0.29
165 0.33
166 0.36
167 0.43
168 0.48
169 0.48
170 0.52
171 0.51
172 0.57
173 0.61
174 0.65
175 0.63
176 0.62
177 0.62
178 0.66
179 0.72
180 0.69
181 0.62
182 0.59
183 0.6
184 0.59
185 0.58
186 0.57
187 0.51
188 0.5
189 0.54
190 0.52
191 0.5
192 0.49
193 0.46
194 0.43
195 0.42
196 0.41
197 0.38
198 0.41
199 0.39
200 0.41
201 0.38
202 0.4
203 0.38
204 0.37
205 0.34
206 0.35
207 0.35
208 0.35
209 0.34
210 0.27
211 0.27
212 0.27
213 0.29
214 0.26
215 0.28
216 0.3
217 0.33
218 0.33
219 0.32
220 0.32
221 0.34
222 0.38
223 0.38
224 0.31
225 0.28
226 0.27
227 0.27
228 0.24
229 0.2
230 0.12
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.22
249 0.22
250 0.22
251 0.21
252 0.25
253 0.27
254 0.28
255 0.3
256 0.26
257 0.3
258 0.31
259 0.33
260 0.28
261 0.26
262 0.25
263 0.24
264 0.23
265 0.19
266 0.19
267 0.18
268 0.2
269 0.22
270 0.23
271 0.25
272 0.27
273 0.28
274 0.28
275 0.26
276 0.24
277 0.23
278 0.24
279 0.22
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.17
285 0.21
286 0.21
287 0.22
288 0.22
289 0.24
290 0.24
291 0.28
292 0.32
293 0.31
294 0.35
295 0.4
296 0.42
297 0.45
298 0.46
299 0.44
300 0.44
301 0.44
302 0.47
303 0.46
304 0.48
305 0.44
306 0.4
307 0.38
308 0.36
309 0.31
310 0.22
311 0.16
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.08
321 0.1
322 0.11
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.07
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.14
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.15
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.09
374 0.12
375 0.16
376 0.2
377 0.2
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.21
382 0.17
383 0.13
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.18
414 0.21
415 0.25
416 0.29
417 0.33
418 0.38
419 0.39
420 0.41
421 0.38
422 0.37
423 0.35
424 0.31
425 0.26
426 0.21
427 0.2
428 0.17
429 0.16
430 0.15
431 0.15
432 0.15
433 0.23
434 0.24
435 0.24
436 0.27
437 0.23
438 0.23
439 0.27
440 0.29
441 0.24
442 0.25
443 0.25
444 0.22
445 0.2
446 0.18
447 0.14
448 0.11
449 0.08
450 0.06
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.12
458 0.17
459 0.23
460 0.3
461 0.32
462 0.38
463 0.43
464 0.52
465 0.55
466 0.61
467 0.64
468 0.68
469 0.72
470 0.68
471 0.64
472 0.55
473 0.5
474 0.4
475 0.38
476 0.29
477 0.26
478 0.26
479 0.26
480 0.26
481 0.25
482 0.24
483 0.16
484 0.17
485 0.13
486 0.12
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.1
493 0.11
494 0.14
495 0.12
496 0.14
497 0.15
498 0.22
499 0.23
500 0.22
501 0.25
502 0.22
503 0.22
504 0.22
505 0.21
506 0.15
507 0.16
508 0.14
509 0.1
510 0.1
511 0.08
512 0.07
513 0.06
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.12
529 0.19
530 0.21
531 0.31
532 0.38
533 0.4
534 0.48
535 0.56
536 0.64
537 0.67
538 0.76
539 0.76
540 0.79
541 0.85
542 0.85
543 0.79
544 0.74
545 0.67
546 0.6
547 0.53
548 0.43
549 0.36
550 0.29
551 0.27
552 0.21
553 0.18
554 0.13
555 0.11
556 0.1
557 0.07
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.08
569 0.12
570 0.15
571 0.18
572 0.2
573 0.25
574 0.28
575 0.3
576 0.34
577 0.39
578 0.38
579 0.38
580 0.37
581 0.31
582 0.29
583 0.27
584 0.23
585 0.15
586 0.14
587 0.11
588 0.08
589 0.08
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.04
594 0.03
595 0.02
596 0.02
597 0.02
598 0.02
599 0.05
600 0.07
601 0.14
602 0.19
603 0.24
604 0.31
605 0.35
606 0.38
607 0.46
608 0.52
609 0.51
610 0.55
611 0.56
612 0.52
613 0.54
614 0.52
615 0.45
616 0.4
617 0.35
618 0.27
619 0.23
620 0.23
621 0.18
622 0.17
623 0.16
624 0.14
625 0.14
626 0.16
627 0.15
628 0.12
629 0.12
630 0.12
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.08
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.11
642 0.12
643 0.15
644 0.15
645 0.14
646 0.15
647 0.15
648 0.15
649 0.11
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.08
673 0.09
674 0.09
675 0.11
676 0.13
677 0.16
678 0.2
679 0.2
680 0.21
681 0.2
682 0.22
683 0.22
684 0.19
685 0.23
686 0.28
687 0.31
688 0.31
689 0.33
690 0.33
691 0.35
692 0.38
693 0.35
694 0.3
695 0.31
696 0.32
697 0.33
698 0.31
699 0.27
700 0.25
701 0.21
702 0.18
703 0.13
704 0.1
705 0.09
706 0.09
707 0.1
708 0.1
709 0.11
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.14
714 0.17
715 0.17
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.13
720 0.13
721 0.11
722 0.08
723 0.07
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.09
728 0.09
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.07
733 0.08
734 0.08
735 0.07
736 0.08
737 0.08
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.08
742 0.07
743 0.07
744 0.05
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.06
751 0.06
752 0.11
753 0.11
754 0.11
755 0.11
756 0.11
757 0.11
758 0.1
759 0.1
760 0.06
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.06
765 0.06
766 0.06
767 0.05
768 0.03
769 0.03
770 0.03
771 0.03
772 0.03
773 0.03
774 0.03
775 0.02
776 0.03
777 0.03
778 0.03
779 0.03
780 0.03
781 0.03
782 0.03
783 0.03
784 0.03
785 0.04
786 0.04
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.07
791 0.07
792 0.07
793 0.07
794 0.06
795 0.05
796 0.05
797 0.05
798 0.05
799 0.04
800 0.04
801 0.04
802 0.06
803 0.07
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.11
808 0.12
809 0.13
810 0.11
811 0.1
812 0.11
813 0.12
814 0.11
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.08
820 0.07
821 0.05
822 0.06
823 0.06
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.1
829 0.12
830 0.13
831 0.16
832 0.24
833 0.29
834 0.33
835 0.38
836 0.41
837 0.43
838 0.48
839 0.55
840 0.55
841 0.54
842 0.54
843 0.51
844 0.47
845 0.48
846 0.44
847 0.34
848 0.24
849 0.2
850 0.17
851 0.14
852 0.13
853 0.09
854 0.07
855 0.07
856 0.06
857 0.07
858 0.07
859 0.08
860 0.12
861 0.14
862 0.17
863 0.17
864 0.17
865 0.17
866 0.18
867 0.17
868 0.14
869 0.11
870 0.08
871 0.08
872 0.08
873 0.07
874 0.05
875 0.04
876 0.05
877 0.09
878 0.1
879 0.12
880 0.13
881 0.16
882 0.17
883 0.2
884 0.21
885 0.19
886 0.25
887 0.28
888 0.37
889 0.39
890 0.4
891 0.36
892 0.37
893 0.39
894 0.39
895 0.41
896 0.39
897 0.42
898 0.46
899 0.48
900 0.47
901 0.44
902 0.42
903 0.44
904 0.4
905 0.43
906 0.41
907 0.47
908 0.49
909 0.51
910 0.51
911 0.48
912 0.49
913 0.48
914 0.53
915 0.52
916 0.56
917 0.63
918 0.67
919 0.67
920 0.67
921 0.64
922 0.59
923 0.59
924 0.57
925 0.55
926 0.58
927 0.64
928 0.61
929 0.6
930 0.56
931 0.5
932 0.46
933 0.43
934 0.38
935 0.31
936 0.3
937 0.29
938 0.29