Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2N8W9

Protein Details
Accession A0A0D2N8W9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-154PYSHNSIHRKHPKAHRRSRANVMQSHydrophilic
637-656ELRFPRITKIHRPNERSWTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-146KHPKAHRR
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_mito 11, cyto 7, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences RRAQASRSSKHIKDYPALVKFKLWVARLHSQFAPLPEGTTAICLRLLFPEDDITRKYDIQEPRMTTLLAKSFGLDMSKFEGWQHEETSGCLGDELALVLDKSCIVDKDFETRLSIAEVAELLDELAALSPYSHNSIHRKHPKAHRRSRANVMQSLFRRLSLFDAAVVTQIILKDLRPLLYPLTELHYSAALVNFNTAAVTMLTKEHAMRAWNTQGLLPKFFRVRATFDAAGALAEKGTSSYCDAQPAIGFPIAVPKSEKGQSCPHALGLLFPVETVWAETKYDGERAQIHVKVRADGGSDITIFSKSRRESTDDRVAVHEIIRAALGLRLAKATAGSSRFNTSKPPNIKHTIILDAEMVAFCGDKVAEFYHISPLIGGVRGRRRVVTNVPNDDGDTESDDGIVESDFSLGLVFFDVLYLEGKSLLEHSYTDRRKILESMIYVRPGKAILAARYLVPSSTSSSTQAEDTLRWIFAYHLAGHEEGLVLKAAESVYNDYRLPWVKLKKDYIPGHGDCVDMVILGASWEKVRGRSLRAPPSVYTTFFIGALENKEESSSKPKFHSYFTVAYGLNREQLEDLNFKIRSTDPIPFSDLKSKDGLEFEVTFSAISKPTVVLRTPLLVELFGAGFTKAAHSQHYELRFPRITKIHRPNERSWTESMSLAELNVIAFECVGREHPEKEMYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.61
4 0.62
5 0.54
6 0.5
7 0.47
8 0.47
9 0.44
10 0.37
11 0.34
12 0.38
13 0.46
14 0.47
15 0.5
16 0.45
17 0.43
18 0.44
19 0.4
20 0.38
21 0.29
22 0.27
23 0.22
24 0.23
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.13
29 0.15
30 0.13
31 0.14
32 0.16
33 0.2
34 0.16
35 0.17
36 0.23
37 0.23
38 0.26
39 0.27
40 0.27
41 0.27
42 0.27
43 0.28
44 0.29
45 0.35
46 0.39
47 0.45
48 0.46
49 0.46
50 0.47
51 0.44
52 0.38
53 0.36
54 0.34
55 0.28
56 0.24
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.23
61 0.17
62 0.14
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.23
68 0.24
69 0.27
70 0.27
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.26
75 0.21
76 0.16
77 0.13
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.14
93 0.16
94 0.22
95 0.25
96 0.25
97 0.26
98 0.25
99 0.24
100 0.22
101 0.21
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.07
118 0.1
119 0.12
120 0.17
121 0.24
122 0.29
123 0.4
124 0.5
125 0.54
126 0.6
127 0.7
128 0.75
129 0.79
130 0.85
131 0.84
132 0.84
133 0.85
134 0.86
135 0.84
136 0.8
137 0.74
138 0.66
139 0.63
140 0.55
141 0.55
142 0.46
143 0.38
144 0.32
145 0.27
146 0.28
147 0.23
148 0.21
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.17
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.22
201 0.27
202 0.27
203 0.29
204 0.25
205 0.25
206 0.26
207 0.27
208 0.29
209 0.25
210 0.28
211 0.28
212 0.34
213 0.31
214 0.29
215 0.28
216 0.24
217 0.21
218 0.16
219 0.12
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.11
228 0.11
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.1
237 0.07
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.19
244 0.24
245 0.25
246 0.21
247 0.28
248 0.3
249 0.33
250 0.32
251 0.29
252 0.26
253 0.25
254 0.21
255 0.15
256 0.13
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.16
274 0.21
275 0.22
276 0.22
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.23
281 0.2
282 0.17
283 0.15
284 0.15
285 0.11
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.08
291 0.09
292 0.13
293 0.13
294 0.17
295 0.19
296 0.24
297 0.27
298 0.34
299 0.43
300 0.39
301 0.39
302 0.37
303 0.36
304 0.31
305 0.27
306 0.21
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.05
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.15
326 0.16
327 0.16
328 0.21
329 0.22
330 0.28
331 0.33
332 0.36
333 0.38
334 0.42
335 0.43
336 0.4
337 0.39
338 0.34
339 0.28
340 0.25
341 0.18
342 0.14
343 0.13
344 0.1
345 0.08
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.05
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.17
367 0.2
368 0.21
369 0.22
370 0.24
371 0.27
372 0.34
373 0.38
374 0.39
375 0.4
376 0.4
377 0.39
378 0.37
379 0.34
380 0.27
381 0.19
382 0.14
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.04
391 0.03
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.11
415 0.2
416 0.22
417 0.26
418 0.27
419 0.27
420 0.28
421 0.29
422 0.28
423 0.23
424 0.23
425 0.25
426 0.26
427 0.29
428 0.27
429 0.26
430 0.23
431 0.19
432 0.17
433 0.16
434 0.17
435 0.14
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.18
440 0.18
441 0.13
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.13
446 0.14
447 0.16
448 0.17
449 0.18
450 0.17
451 0.18
452 0.15
453 0.13
454 0.15
455 0.14
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.12
461 0.15
462 0.13
463 0.12
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.1
469 0.08
470 0.08
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.11
479 0.13
480 0.15
481 0.15
482 0.15
483 0.19
484 0.21
485 0.24
486 0.27
487 0.33
488 0.37
489 0.44
490 0.49
491 0.51
492 0.57
493 0.58
494 0.56
495 0.57
496 0.51
497 0.49
498 0.44
499 0.39
500 0.29
501 0.26
502 0.19
503 0.11
504 0.1
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.07
512 0.08
513 0.1
514 0.16
515 0.19
516 0.26
517 0.34
518 0.43
519 0.5
520 0.53
521 0.55
522 0.51
523 0.55
524 0.5
525 0.43
526 0.36
527 0.28
528 0.25
529 0.22
530 0.21
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.16
535 0.14
536 0.14
537 0.15
538 0.15
539 0.17
540 0.24
541 0.25
542 0.27
543 0.3
544 0.37
545 0.38
546 0.42
547 0.46
548 0.43
549 0.43
550 0.42
551 0.43
552 0.36
553 0.35
554 0.36
555 0.29
556 0.28
557 0.24
558 0.22
559 0.18
560 0.2
561 0.22
562 0.2
563 0.21
564 0.24
565 0.24
566 0.23
567 0.25
568 0.23
569 0.26
570 0.28
571 0.33
572 0.29
573 0.32
574 0.37
575 0.36
576 0.39
577 0.42
578 0.39
579 0.35
580 0.34
581 0.32
582 0.3
583 0.3
584 0.28
585 0.23
586 0.23
587 0.22
588 0.2
589 0.19
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.11
597 0.15
598 0.19
599 0.19
600 0.2
601 0.21
602 0.23
603 0.23
604 0.24
605 0.21
606 0.17
607 0.16
608 0.15
609 0.13
610 0.1
611 0.1
612 0.08
613 0.07
614 0.07
615 0.1
616 0.12
617 0.13
618 0.16
619 0.2
620 0.24
621 0.31
622 0.36
623 0.39
624 0.38
625 0.45
626 0.48
627 0.45
628 0.5
629 0.52
630 0.54
631 0.58
632 0.67
633 0.69
634 0.73
635 0.79
636 0.79
637 0.8
638 0.78
639 0.71
640 0.64
641 0.6
642 0.51
643 0.47
644 0.4
645 0.32
646 0.27
647 0.23
648 0.2
649 0.14
650 0.12
651 0.1
652 0.09
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.07
658 0.1
659 0.15
660 0.19
661 0.21
662 0.25