Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2FCZ0

Protein Details
Accession A0A0D2FCZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-130AKGRGTEKKKKDPNAPKRGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-128SKRTMPKASAKSSSKAKGRGTEKKKKDPNAPKR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8.5, cyto_nucl 5.5, extr 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01390  HMG-box_NHP6-like  
Amino Acid Sequences MHSLKTIPIALRSTASFTCTTHHCLAVSSATPLPTLPTLPLLHYAVAFVLLLPTICDSRIFLLLSSTTMAKTSIAQTTAKSTLTSNATSKVTKSSSKRTMPKASAKSSSKAKGRGTEKKKKDPNAPKRGLSAYMFFANEQRETVREENPGISFGQVGKVLGDKWKALSDKQREPYEKKAATDKKRYEDEKAKYNAADDDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.21
4 0.19
5 0.21
6 0.23
7 0.28
8 0.26
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.25
13 0.25
14 0.23
15 0.19
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.14
23 0.11
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.19
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.15
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.06
36 0.05
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.16
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.14
69 0.16
70 0.18
71 0.2
72 0.17
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.23
80 0.26
81 0.32
82 0.38
83 0.46
84 0.51
85 0.54
86 0.59
87 0.58
88 0.63
89 0.6
90 0.55
91 0.55
92 0.52
93 0.49
94 0.47
95 0.48
96 0.44
97 0.43
98 0.42
99 0.42
100 0.48
101 0.54
102 0.58
103 0.62
104 0.65
105 0.7
106 0.75
107 0.74
108 0.77
109 0.78
110 0.8
111 0.8
112 0.78
113 0.7
114 0.66
115 0.61
116 0.53
117 0.44
118 0.35
119 0.26
120 0.23
121 0.21
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.17
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.2
134 0.22
135 0.21
136 0.21
137 0.17
138 0.14
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.14
148 0.16
149 0.14
150 0.15
151 0.21
152 0.22
153 0.26
154 0.35
155 0.39
156 0.47
157 0.54
158 0.61
159 0.63
160 0.67
161 0.71
162 0.72
163 0.67
164 0.6
165 0.63
166 0.64
167 0.67
168 0.72
169 0.7
170 0.68
171 0.73
172 0.74
173 0.73
174 0.73
175 0.7
176 0.69
177 0.66
178 0.62
179 0.54
180 0.52
181 0.46
182 0.4
183 0.36