FuNGI

A0A0D2E9M4

Protein Details

Accession

A0A0D2E9M4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
431-454	NPGGGKRRGAKAKRGKNGNEKFGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
432-447	PGGGKRRGAKAKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRSRWIDKKSAQTFHLLYRPQTDEALHDEAAGERALYQISGPGSSSQHKPELTKGLHLEDLEDGLDFEDMRDNEGEAAEYGIFFDDTKYDYMQHLRDIGEGGGEALFVDAAPVKVQGKGKAKVIKLEDALRELSVDDAQSVAGSEMLSTFSTSTRPRTYQNQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDEKDEEDIFSALARDGRNGELDLDEFQATYDEDDEGWESDVTEKASEQPSQLKLPTPLSALGDADHASGFPAPDAEAAVAADGDWLRDFAKYKRDNARKPPLKAAESIIAASAIQDKAPSLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTAGQQLLDARFDQVEKMYSLDEGEEFDDGDGGMSLASGMTGLTGASKMSKMSQLSTTSFADEGAVREDFDSMMDGFLGDWNKANPGGGKRRGAKAKRGKNGNEKFGLQQLEEVRAELGPARIYQRTTKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.56
3	0.57
4	0.5
5	0.43
6	0.45
7	0.47
8	0.41
9	0.4
10	0.34
11	0.29
12	0.32
13	0.34
14	0.26
15	0.22
16	0.21
17	0.2
18	0.21
19	0.17
20	0.12
21	0.07
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.07
26	0.09
27	0.1
28	0.11
29	0.12
30	0.14
31	0.17
32	0.21
33	0.26
34	0.27
35	0.32
36	0.34
37	0.35
38	0.38
39	0.44
40	0.42
41	0.44
42	0.43
43	0.4
44	0.4
45	0.38
46	0.33
47	0.24
48	0.23
49	0.17
50	0.14
51	0.1
52	0.08
53	0.08
54	0.07
55	0.06
56	0.11
57	0.11
58	0.14
59	0.14
60	0.14
61	0.14
62	0.15
63	0.15
64	0.09
65	0.1
66	0.08
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.06
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.1
76	0.11
77	0.12
78	0.14
79	0.19
80	0.21
81	0.21
82	0.23
83	0.21
84	0.21
85	0.21
86	0.18
87	0.13
88	0.12
89	0.1
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.04
94	0.04
95	0.03
96	0.04
97	0.04
98	0.04
99	0.05
100	0.07
101	0.08
102	0.12
103	0.15
104	0.22
105	0.29
106	0.32
107	0.39
108	0.44
109	0.45
110	0.47
111	0.48
112	0.45
113	0.41
114	0.43
115	0.37
116	0.33
117	0.32
118	0.26
119	0.22
120	0.17
121	0.15
122	0.11
123	0.09
124	0.07
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.05
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.1
140	0.12
141	0.17
142	0.21
143	0.23
144	0.27
145	0.35
146	0.43
147	0.49
148	0.56
149	0.58
150	0.55
151	0.55
152	0.53
153	0.46
154	0.38
155	0.29
156	0.2
157	0.14
158	0.12
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.07
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.14
168	0.14
169	0.13
170	0.13
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.08
176	0.07
177	0.08
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.04
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.08
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.15
230	0.16
231	0.18
232	0.19
233	0.18
234	0.19
235	0.19
236	0.2
237	0.16
238	0.15
239	0.14
240	0.14
241	0.12
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.04
263	0.03
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.06
269	0.08
270	0.1
271	0.2
272	0.23
273	0.3
274	0.4
275	0.49
276	0.56
277	0.64
278	0.73
279	0.71
280	0.71
281	0.73
282	0.7
283	0.62
284	0.56
285	0.49
286	0.42
287	0.34
288	0.31
289	0.22
290	0.15
291	0.13
292	0.11
293	0.11
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.07
302	0.09
303	0.1
304	0.11
305	0.15
306	0.17
307	0.17
308	0.24
309	0.32
310	0.41
311	0.45
312	0.5
313	0.55
314	0.63
315	0.71
316	0.71
317	0.73
318	0.73
319	0.75
320	0.75
321	0.67
322	0.59
323	0.5
324	0.42
325	0.34
326	0.25
327	0.18
328	0.14
329	0.13
330	0.11
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.13
335	0.15
336	0.16
337	0.15
338	0.16
339	0.18
340	0.19
341	0.2
342	0.19
343	0.16
344	0.14
345	0.14
346	0.14
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.11
352	0.1
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.02
373	0.02
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.04
378	0.04
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.1
383	0.15
384	0.15
385	0.18
386	0.23
387	0.26
388	0.28
389	0.31
390	0.3
391	0.27
392	0.26
393	0.23
394	0.19
395	0.16
396	0.15
397	0.14
398	0.13
399	0.12
400	0.12
401	0.13
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.1
411	0.11
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.14
416	0.14
417	0.16
418	0.17
419	0.25
420	0.35
421	0.4
422	0.48
423	0.52
424	0.61
425	0.7
426	0.71
427	0.73
428	0.74
429	0.77
430	0.78
431	0.82
432	0.83
433	0.83
434	0.86
435	0.84
436	0.79
437	0.71
438	0.65
439	0.61
440	0.55
441	0.44
442	0.4
443	0.34
444	0.34
445	0.32
446	0.29
447	0.24
448	0.21
449	0.21
450	0.18
451	0.18
452	0.14
453	0.16
454	0.2
455	0.22
456	0.26

A0A0D2E9M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer