FuNGI

A0A0D2CH18

Protein Details

Accession

A0A0D2CH18

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
159-185	KMYLEFRVKHLKKKNPVRYKAEYNKVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13, cyto_pero 9.333, cyto_nucl 8.833, mito 5, pero 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF13181 TPR_8

Amino Acid Sequences

MTLASTKLHIREDDAMRNNRSNNQGYLDFTPKMPSRNGRILSRGPPPRASPGWPHFLEGEVVERDLLDNPRRTMPGIVRQPHGNSTLTMPSSQSAKKPDLYLIANDDAIYEQDILRNPGSVRPWLTYIDFKMRNGTIHEQAFVQERACIQLPRSYKLWKMYLEFRVKHLKKKNPVRYKAEYNKVNALFARALILLNKMPVIWEMYLTFLLRQPYVTRTRRTFDSALRALPVTQHNRIWKLYRSFANSVGGDTAVKIYGRYVQIHPEDMEDFIDLLIETGHYLEAVKRYMQILNNPKFKSKHIKSDFQLWSEMVELMVNRAREIGDSSVSGIDPDTIIRSGIERFADQRGKLWAGLATYWITRGDFERARDVFEEGITTVMTVRDFTMVFDAYVEFEESILSTLMDGASTRAAKGVVDADKDFDLDLKMMRFEHLMDRRPFLVNDVLLRQNPNNVVEWEKRVALWNDNKQEVVQTYTDAIAAIQPKRAVGKFHELWLNYAKFYEENGDLNTARIILDKAVKVPFKSVAELADTWVGWAEMELRNENFDNALKVMATATKAPKRSTVDYFDETLSPQQRVHKSWKVWSFYVDLVESVGSLDETRAVYDRIFELRIATPQTVVNYANLLEEHGYFEESFKVYERGLDVFTYPVAFELWNLYLTKAVNRKIALERLRDLFEQAVENVPPKFAKPIYLMYGNLEEERGLARSAMRIYERATRAVSDEDRLPMFEFYITKSATNFGLTSTRPIYERAIATLPDADAKAMCLKFAEMERRLGEIDRARAIYGHASQYADPRVDKSFWDTWEKFEVAHGNEDTFKEMLRIKRSVAAQFNTDVAFIASQAVARGQAAAATSADSGAHRDGDGGSRDTDAMAALERQARAPVGFVAASTGPEGGNRPAKMGGEGDKDDQQANGKAKAVVSANPDAIDVDIDDDDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.55
3	0.57
4	0.61
5	0.6
6	0.58
7	0.6
8	0.55
9	0.49
10	0.47
11	0.44
12	0.43
13	0.45
14	0.44
15	0.38
16	0.34
17	0.38
18	0.35
19	0.37
20	0.39
21	0.41
22	0.44
23	0.52
24	0.57
25	0.54
26	0.58
27	0.61
28	0.61
29	0.63
30	0.64
31	0.59
32	0.59
33	0.58
34	0.59
35	0.56
36	0.54
37	0.54
38	0.52
39	0.56
40	0.51
41	0.5
42	0.42
43	0.4
44	0.36
45	0.27
46	0.25
47	0.18
48	0.18
49	0.15
50	0.14
51	0.14
52	0.17
53	0.23
54	0.25
55	0.29
56	0.32
57	0.37
58	0.38
59	0.39
60	0.4
61	0.41
62	0.44
63	0.49
64	0.51
65	0.5
66	0.53
67	0.54
68	0.52
69	0.48
70	0.39
71	0.3
72	0.3
73	0.32
74	0.29
75	0.27
76	0.24
77	0.22
78	0.26
79	0.28
80	0.29
81	0.29
82	0.32
83	0.35
84	0.36
85	0.37
86	0.38
87	0.37
88	0.35
89	0.35
90	0.32
91	0.29
92	0.27
93	0.24
94	0.18
95	0.16
96	0.15
97	0.1
98	0.08
99	0.12
100	0.14
101	0.17
102	0.16
103	0.19
104	0.18
105	0.22
106	0.25
107	0.26
108	0.27
109	0.26
110	0.28
111	0.28
112	0.31
113	0.31
114	0.32
115	0.37
116	0.37
117	0.35
118	0.39
119	0.38
120	0.37
121	0.38
122	0.39
123	0.36
124	0.34
125	0.35
126	0.29
127	0.29
128	0.32
129	0.27
130	0.22
131	0.17
132	0.16
133	0.18
134	0.2
135	0.2
136	0.17
137	0.23
138	0.26
139	0.28
140	0.31
141	0.31
142	0.34
143	0.39
144	0.43
145	0.41
146	0.42
147	0.46
148	0.52
149	0.57
150	0.53
151	0.51
152	0.58
153	0.57
154	0.61
155	0.63
156	0.64
157	0.65
158	0.75
159	0.81
160	0.81
161	0.87
162	0.86
163	0.85
164	0.86
165	0.85
166	0.84
167	0.78
168	0.71
169	0.7
170	0.62
171	0.57
172	0.46
173	0.4
174	0.31
175	0.25
176	0.23
177	0.14
178	0.14
179	0.13
180	0.15
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.12
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.12
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.13
198	0.14
199	0.15
200	0.2
201	0.29
202	0.35
203	0.39
204	0.42
205	0.46
206	0.48
207	0.53
208	0.51
209	0.46
210	0.5
211	0.45
212	0.42
213	0.39
214	0.36
215	0.29
216	0.29
217	0.32
218	0.28
219	0.29
220	0.32
221	0.36
222	0.39
223	0.42
224	0.42
225	0.42
226	0.42
227	0.45
228	0.46
229	0.48
230	0.47
231	0.46
232	0.47
233	0.39
234	0.34
235	0.28
236	0.23
237	0.16
238	0.14
239	0.12
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.12
245	0.14
246	0.17
247	0.18
248	0.24
249	0.26
250	0.28
251	0.28
252	0.24
253	0.23
254	0.2
255	0.19
256	0.12
257	0.11
258	0.08
259	0.08
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.06
270	0.08
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.13
275	0.16
276	0.18
277	0.25
278	0.33
279	0.4
280	0.48
281	0.47
282	0.51
283	0.5
284	0.53
285	0.55
286	0.5
287	0.53
288	0.52
289	0.59
290	0.56
291	0.65
292	0.63
293	0.53
294	0.5
295	0.39
296	0.33
297	0.26
298	0.24
299	0.13
300	0.1
301	0.08
302	0.08
303	0.11
304	0.1
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.12
310	0.11
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.08
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.17
332	0.21
333	0.2
334	0.22
335	0.23
336	0.23
337	0.22
338	0.21
339	0.16
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.1
350	0.14
351	0.16
352	0.17
353	0.24
354	0.24
355	0.26
356	0.26
357	0.25
358	0.2
359	0.17
360	0.16
361	0.09
362	0.09
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.11
402	0.1
403	0.12
404	0.12
405	0.13
406	0.13
407	0.13
408	0.12
409	0.09
410	0.07
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.07
418	0.08
419	0.15
420	0.19
421	0.26
422	0.27
423	0.28
424	0.29
425	0.3
426	0.29
427	0.24
428	0.21
429	0.14
430	0.14
431	0.16
432	0.16
433	0.15
434	0.17
435	0.15
436	0.15
437	0.15
438	0.15
439	0.14
440	0.13
441	0.17
442	0.17
443	0.19
444	0.18
445	0.17
446	0.16
447	0.18
448	0.18
449	0.2
450	0.25
451	0.29
452	0.31
453	0.32
454	0.31
455	0.28
456	0.28
457	0.23
458	0.19
459	0.12
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.11
472	0.13
473	0.14
474	0.14
475	0.14
476	0.22
477	0.21
478	0.24
479	0.27
480	0.25
481	0.26
482	0.3
483	0.27
484	0.19
485	0.18
486	0.16
487	0.13
488	0.13
489	0.14
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.13
494	0.12
495	0.12
496	0.12
497	0.09
498	0.08
499	0.07
500	0.07
501	0.06
502	0.09
503	0.09
504	0.12
505	0.15
506	0.16
507	0.16
508	0.17
509	0.2
510	0.18
511	0.18
512	0.17
513	0.14
514	0.15
515	0.15
516	0.14
517	0.12
518	0.1
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.05
523	0.05
524	0.07
525	0.08
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.13
530	0.13
531	0.13
532	0.11
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.09
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.1
543	0.15
544	0.19
545	0.22
546	0.23
547	0.28
548	0.32
549	0.35
550	0.37
551	0.37
552	0.38
553	0.38
554	0.39
555	0.34
556	0.29
557	0.26
558	0.26
559	0.22
560	0.17
561	0.17
562	0.22
563	0.25
564	0.29
565	0.36
566	0.39
567	0.4
568	0.47
569	0.52
570	0.5
571	0.46
572	0.45
573	0.4
574	0.33
575	0.32
576	0.24
577	0.17
578	0.13
579	0.12
580	0.09
581	0.07
582	0.06
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.08
591	0.08
592	0.09
593	0.11
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.13
598	0.13
599	0.16
600	0.17
601	0.15
602	0.14
603	0.15
604	0.16
605	0.15
606	0.15
607	0.12
608	0.11
609	0.11
610	0.1
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.07
615	0.08
616	0.08
617	0.09
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.11
625	0.1
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.12
630	0.12
631	0.11
632	0.11
633	0.11
634	0.1
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.06
640	0.08
641	0.09
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.12
646	0.12
647	0.18
648	0.2
649	0.23
650	0.25
651	0.25
652	0.29
653	0.32
654	0.39
655	0.39
656	0.38
657	0.38
658	0.37
659	0.39
660	0.35
661	0.33
662	0.25
663	0.21
664	0.18
665	0.16
666	0.15
667	0.13
668	0.14
669	0.13
670	0.13
671	0.13
672	0.12
673	0.15
674	0.13
675	0.17
676	0.18
677	0.22
678	0.25
679	0.28
680	0.27
681	0.25
682	0.28
683	0.25
684	0.22
685	0.18
686	0.13
687	0.11
688	0.12
689	0.1
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.1
694	0.12
695	0.14
696	0.15
697	0.15
698	0.18
699	0.26
700	0.27
701	0.27
702	0.27
703	0.24
704	0.25
705	0.29
706	0.28
707	0.22
708	0.22
709	0.22
710	0.22
711	0.22
712	0.21
713	0.16
714	0.15
715	0.14
716	0.13
717	0.13
718	0.17
719	0.17
720	0.16
721	0.17
722	0.18
723	0.17
724	0.18
725	0.15
726	0.12
727	0.16
728	0.15
729	0.2
730	0.2
731	0.2
732	0.2
733	0.22
734	0.23
735	0.24
736	0.24
737	0.23
738	0.23
739	0.22
740	0.22
741	0.21
742	0.19
743	0.16
744	0.15
745	0.12
746	0.1
747	0.11
748	0.17
749	0.15
750	0.15
751	0.13
752	0.13
753	0.16
754	0.21
755	0.28
756	0.24
757	0.28
758	0.29
759	0.31
760	0.31
761	0.29
762	0.3
763	0.27
764	0.29
765	0.28
766	0.27
767	0.26
768	0.25
769	0.26
770	0.24
771	0.22
772	0.21
773	0.2
774	0.21
775	0.21
776	0.26
777	0.28
778	0.25
779	0.23
780	0.23
781	0.25
782	0.24
783	0.25
784	0.27
785	0.28
786	0.29
787	0.38
788	0.37
789	0.36
790	0.41
791	0.4
792	0.34
793	0.32
794	0.35
795	0.27
796	0.32
797	0.29
798	0.24
799	0.27
800	0.27
801	0.27
802	0.21
803	0.19
804	0.16
805	0.21
806	0.26
807	0.29
808	0.31
809	0.3
810	0.36
811	0.4
812	0.44
813	0.47
814	0.43
815	0.39
816	0.38
817	0.38
818	0.32
819	0.28
820	0.21
821	0.14
822	0.12
823	0.09
824	0.09
825	0.08
826	0.07
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.08
831	0.08
832	0.07
833	0.08
834	0.08
835	0.09
836	0.08
837	0.09
838	0.09
839	0.09
840	0.09
841	0.08
842	0.11
843	0.11
844	0.12
845	0.1
846	0.11
847	0.12
848	0.16
849	0.2
850	0.19
851	0.19
852	0.19
853	0.19
854	0.18
855	0.17
856	0.13
857	0.1
858	0.09
859	0.09
860	0.11
861	0.15
862	0.15
863	0.16
864	0.17
865	0.18
866	0.17
867	0.18
868	0.16
869	0.14
870	0.14
871	0.13
872	0.15
873	0.14
874	0.14
875	0.13
876	0.13
877	0.1
878	0.11
879	0.14
880	0.17
881	0.24
882	0.24
883	0.25
884	0.27
885	0.28
886	0.29
887	0.3
888	0.3
889	0.29
890	0.32
891	0.33
892	0.35
893	0.36
894	0.34
895	0.32
896	0.31
897	0.31
898	0.33
899	0.33
900	0.31
901	0.31
902	0.31
903	0.34
904	0.31
905	0.28
906	0.3
907	0.31
908	0.3
909	0.28
910	0.28
911	0.24
912	0.22
913	0.18
914	0.13
915	0.11
916	0.09

A0A0D2CH18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer