FuNGI

A0A0D2GA48

Protein Details

Accession

A0A0D2GA48

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
208-231	GSTVEATGRKRKKRWDVSSEPTPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
216-220	RKRKK

Subcellular Location(s)

plas 20, cyto_nucl 3, nucl 2.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFDTVRRLQAERNSQAAGKKGSKTFDPSTQRTDSSNKASVTESFDTTLYDRDGGDKYAGYHTSLPAEGEDDEMVDADDSRRLVGQYTATKDQMNEFATGGAEEEDILLGREKSARIADRESDYQKRRFDRGPLTPTRADPFAANKHAAVADGATYREVMQLQDLEREEERVKKLIADKQAAGDGAVEHKPTLKEEADKENADAGSTVEATGRKRKKRWDVSSEPTPATDDVDGKKRSRWDQAPGPGTAPAPAKRSRWDQAPALGSATPAGNAGLATPVPGAFGIDVSARNAPWSDEMLDMMLPTEGYTILEPPPGYEPVRHLARKAMPTPAQVASSAGFGGFMMQEPENPRMMGKQLPTEIPGVGDLQFLKAEDMTYFGKLVDGADENAMSVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLIRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIADNLSDEQAKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFASPDEEMKKVVLKVVSQCASTDGVTAGYLKEHVLQEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETIEKVIASLGAADIGERLEERLVDGILHAFQEQSIEDVVMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRMAVGTGIVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVHSADAMVPYYPNMKDEGLPRDELFIMV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.43
3	0.45
4	0.46
5	0.47
6	0.49
7	0.49
8	0.47
9	0.43
10	0.45
11	0.46
12	0.47
13	0.49
14	0.53
15	0.52
16	0.54
17	0.57
18	0.55
19	0.58
20	0.59
21	0.56
22	0.52
23	0.53
24	0.5
25	0.49
26	0.51
27	0.44
28	0.41
29	0.42
30	0.4
31	0.42
32	0.38
33	0.32
34	0.27
35	0.26
36	0.26
37	0.25
38	0.25
39	0.19
40	0.17
41	0.16
42	0.18
43	0.19
44	0.19
45	0.2
46	0.18
47	0.19
48	0.23
49	0.24
50	0.23
51	0.24
52	0.23
53	0.25
54	0.24
55	0.23
56	0.18
57	0.18
58	0.16
59	0.15
60	0.14
61	0.11
62	0.1
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.07
68	0.1
69	0.09
70	0.1
71	0.11
72	0.11
73	0.13
74	0.15
75	0.21
76	0.25
77	0.32
78	0.36
79	0.36
80	0.37
81	0.37
82	0.37
83	0.36
84	0.31
85	0.26
86	0.22
87	0.21
88	0.2
89	0.19
90	0.16
91	0.1
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.12
102	0.12
103	0.15
104	0.21
105	0.25
106	0.28
107	0.32
108	0.36
109	0.39
110	0.45
111	0.49
112	0.52
113	0.54
114	0.57
115	0.6
116	0.61
117	0.61
118	0.6
119	0.62
120	0.62
121	0.65
122	0.67
123	0.67
124	0.69
125	0.66
126	0.64
127	0.59
128	0.51
129	0.42
130	0.35
131	0.34
132	0.35
133	0.36
134	0.35
135	0.31
136	0.31
137	0.31
138	0.28
139	0.22
140	0.14
141	0.12
142	0.12
143	0.13
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.12
149	0.1
150	0.12
151	0.15
152	0.15
153	0.2
154	0.21
155	0.22
156	0.22
157	0.26
158	0.25
159	0.28
160	0.3
161	0.28
162	0.28
163	0.29
164	0.35
165	0.38
166	0.44
167	0.42
168	0.41
169	0.39
170	0.41
171	0.36
172	0.3
173	0.24
174	0.16
175	0.15
176	0.16
177	0.14
178	0.12
179	0.16
180	0.16
181	0.18
182	0.22
183	0.21
184	0.25
185	0.29
186	0.37
187	0.39
188	0.39
189	0.38
190	0.37
191	0.34
192	0.29
193	0.25
194	0.17
195	0.13
196	0.12
197	0.11
198	0.09
199	0.12
200	0.15
201	0.25
202	0.33
203	0.4
204	0.47
205	0.57
206	0.66
207	0.75
208	0.81
209	0.82
210	0.82
211	0.82
212	0.84
213	0.79
214	0.69
215	0.58
216	0.5
217	0.4
218	0.33
219	0.26
220	0.21
221	0.19
222	0.27
223	0.3
224	0.3
225	0.34
226	0.38
227	0.41
228	0.48
229	0.49
230	0.49
231	0.54
232	0.62
233	0.62
234	0.56
235	0.52
236	0.44
237	0.39
238	0.35
239	0.3
240	0.24
241	0.25
242	0.28
243	0.3
244	0.33
245	0.4
246	0.41
247	0.43
248	0.45
249	0.44
250	0.46
251	0.46
252	0.41
253	0.36
254	0.32
255	0.25
256	0.21
257	0.17
258	0.11
259	0.08
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.07
277	0.08
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.09
292	0.07
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.1
302	0.09
303	0.1
304	0.13
305	0.15
306	0.16
307	0.16
308	0.18
309	0.23
310	0.31
311	0.3
312	0.28
313	0.32
314	0.37
315	0.42
316	0.41
317	0.41
318	0.37
319	0.38
320	0.41
321	0.36
322	0.31
323	0.25
324	0.24
325	0.17
326	0.14
327	0.12
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.07
335	0.07
336	0.1
337	0.13
338	0.15
339	0.16
340	0.16
341	0.16
342	0.15
343	0.17
344	0.18
345	0.17
346	0.2
347	0.21
348	0.22
349	0.23
350	0.23
351	0.21
352	0.17
353	0.16
354	0.12
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.08
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.14
388	0.15
389	0.17
390	0.2
391	0.24
392	0.26
393	0.35
394	0.42
395	0.44
396	0.49
397	0.49
398	0.47
399	0.49
400	0.48
401	0.45
402	0.45
403	0.42
404	0.42
405	0.45
406	0.44
407	0.42
408	0.48
409	0.5
410	0.45
411	0.43
412	0.41
413	0.45
414	0.52
415	0.51
416	0.42
417	0.33
418	0.31
419	0.3
420	0.29
421	0.23
422	0.15
423	0.12
424	0.13
425	0.14
426	0.14
427	0.13
428	0.1
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.1
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.16
442	0.18
443	0.18
444	0.16
445	0.15
446	0.14
447	0.18
448	0.2
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.13
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.15
460	0.17
461	0.16
462	0.17
463	0.18
464	0.19
465	0.16
466	0.15
467	0.13
468	0.14
469	0.14
470	0.13
471	0.12
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.06
477	0.04
478	0.03
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.09
487	0.1
488	0.12
489	0.12
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.13
494	0.12
495	0.1
496	0.07
497	0.07
498	0.05
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.08
511	0.1
512	0.11
513	0.1
514	0.13
515	0.14
516	0.15
517	0.16
518	0.14
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.02
539	0.03
540	0.03
541	0.04
542	0.06
543	0.08
544	0.11
545	0.16
546	0.2
547	0.23
548	0.28
549	0.37
550	0.45
551	0.53
552	0.56
553	0.58
554	0.61
555	0.65
556	0.62
557	0.57
558	0.5
559	0.45
560	0.44
561	0.38
562	0.33
563	0.26
564	0.24
565	0.19
566	0.17
567	0.13
568	0.08
569	0.06
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.08
587	0.07
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.02
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.04
616	0.04
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.08
628	0.13
629	0.22
630	0.24
631	0.25
632	0.31
633	0.34
634	0.36
635	0.36
636	0.37
637	0.32
638	0.3
639	0.29
640	0.24
641	0.2
642	0.18
643	0.15
644	0.08
645	0.05
646	0.04
647	0.03
648	0.04
649	0.03
650	0.04
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.08
675	0.1
676	0.1
677	0.11
678	0.11
679	0.13
680	0.11
681	0.13
682	0.13
683	0.12
684	0.15
685	0.2
686	0.21
687	0.19
688	0.19
689	0.18
690	0.18
691	0.17
692	0.14
693	0.09
694	0.08
695	0.08
696	0.08
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.05
701	0.08
702	0.09
703	0.09
704	0.1
705	0.1
706	0.12
707	0.13
708	0.13
709	0.12
710	0.14
711	0.14
712	0.18
713	0.23
714	0.22
715	0.23
716	0.31
717	0.35
718	0.41
719	0.49
720	0.5
721	0.5
722	0.58
723	0.57
724	0.49
725	0.46
726	0.4
727	0.36
728	0.31
729	0.27
730	0.2
731	0.21
732	0.2
733	0.16
734	0.15
735	0.1
736	0.09
737	0.08
738	0.07
739	0.05
740	0.05
741	0.06
742	0.07
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.09
747	0.14
748	0.14
749	0.15
750	0.15
751	0.14
752	0.15
753	0.16
754	0.18
755	0.18
756	0.19
757	0.2
758	0.22
759	0.22
760	0.22
761	0.23
762	0.21
763	0.19
764	0.19
765	0.19
766	0.17
767	0.17
768	0.16
769	0.14
770	0.12
771	0.08
772	0.06
773	0.04
774	0.03
775	0.03
776	0.03
777	0.04
778	0.03
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.04
784	0.05
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.07
792	0.06
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.05
800	0.05
801	0.06
802	0.06
803	0.05
804	0.05
805	0.04
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.03
812	0.04
813	0.04
814	0.04
815	0.08
816	0.09
817	0.12
818	0.12
819	0.13
820	0.14
821	0.2
822	0.3
823	0.29
824	0.31
825	0.3
826	0.33
827	0.33
828	0.32
829	0.29
830	0.21
831	0.22
832	0.21
833	0.21
834	0.25
835	0.26
836	0.27
837	0.29
838	0.32
839	0.37
840	0.4
841	0.39
842	0.33
843	0.33
844	0.32
845	0.29
846	0.26
847	0.19
848	0.14
849	0.12
850	0.12
851	0.1
852	0.1
853	0.09
854	0.07
855	0.1
856	0.1
857	0.1
858	0.1
859	0.11
860	0.11
861	0.1
862	0.11
863	0.09
864	0.09
865	0.08
866	0.08
867	0.09
868	0.08
869	0.07
870	0.06
871	0.05
872	0.04
873	0.05
874	0.06
875	0.06
876	0.06
877	0.06
878	0.06
879	0.06
880	0.06
881	0.05
882	0.05
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.05
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.04
897	0.05
898	0.08
899	0.08
900	0.09
901	0.1
902	0.13
903	0.14
904	0.13
905	0.16
906	0.15
907	0.16
908	0.19
909	0.2
910	0.24
911	0.26
912	0.27
913	0.27
914	0.29
915	0.33
916	0.37
917	0.46
918	0.45
919	0.5
920	0.53
921	0.59
922	0.62
923	0.64
924	0.61
925	0.61
926	0.57
927	0.53
928	0.5
929	0.42
930	0.35
931	0.28
932	0.23
933	0.14
934	0.11
935	0.08
936	0.08
937	0.08
938	0.09
939	0.1
940	0.11
941	0.14
942	0.17
943	0.19
944	0.22
945	0.23
946	0.23
947	0.25
948	0.25
949	0.24
950	0.24
951	0.22
952	0.21
953	0.19
954	0.18
955	0.19
956	0.19
957	0.19
958	0.15
959	0.18
960	0.22
961	0.22
962	0.24
963	0.22
964	0.27
965	0.33
966	0.43
967	0.49
968	0.5
969	0.59
970	0.65
971	0.72
972	0.67
973	0.6
974	0.51
975	0.41
976	0.36
977	0.28
978	0.2
979	0.11
980	0.13
981	0.13
982	0.12
983	0.11
984	0.11
985	0.11
986	0.1
987	0.1
988	0.07
989	0.07
990	0.08
991	0.1
992	0.12
993	0.12
994	0.13
995	0.14
996	0.16
997	0.19
998	0.26
999	0.31
1000	0.35
1001	0.38
1002	0.41
1003	0.42
1004	0.41
1005	0.38
1006	0.29
1007	0.25
1008	0.19
1009	0.15
1010	0.11
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.07
1014	0.06
1015	0.04
1016	0.04
1017	0.04
1018	0.05
1019	0.05
1020	0.06
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.11
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.18
1028	0.18
1029	0.17
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.19
1033	0.2
1034	0.23
1035	0.25
1036	0.26
1037	0.25
1038	0.28
1039	0.27
1040	0.26
1041	0.2
1042	0.17
1043	0.14
1044	0.14
1045	0.15
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.13
1051	0.12
1052	0.12
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.1
1057	0.1
1058	0.09
1059	0.08
1060	0.07
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.14
1075	0.19
1076	0.21
1077	0.23
1078	0.2
1079	0.2
1080	0.22
1081	0.27
1082	0.3
1083	0.27
1084	0.27
1085	0.26
1086	0.26
1087	0.25
1088	0.23
1089	0.18
1090	0.11
1091	0.1
1092	0.08
1093	0.06
1094	0.05
1095	0.05
1096	0.05
1097	0.04
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.03
1101	0.04
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.06
1105	0.06
1106	0.07
1107	0.09
1108	0.09
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.1
1112	0.11
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.14
1116	0.21
1117	0.23
1118	0.24
1119	0.23
1120	0.21
1121	0.22
1122	0.23
1123	0.21
1124	0.14
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.11
1129	0.1
1130	0.08
1131	0.06
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.04
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.04
1146	0.06
1147	0.11
1148	0.15
1149	0.17
1150	0.25
1151	0.31
1152	0.36
1153	0.43
1154	0.49
1155	0.52
1156	0.59
1157	0.65
1158	0.66
1159	0.7
1160	0.7
1161	0.68
1162	0.66
1163	0.66
1164	0.58
1165	0.54
1166	0.48
1167	0.39
1168	0.35
1169	0.3
1170	0.25
1171	0.17
1172	0.15
1173	0.13
1174	0.11
1175	0.1
1176	0.1
1177	0.15
1178	0.15
1179	0.16
1180	0.17
1181	0.18
1182	0.21
1183	0.27
1184	0.33
1185	0.32
1186	0.35
1187	0.34
1188	0.35

A0A0D2GA48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer