Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2CYX1

Protein Details
Accession A0A0D2CYX1    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-515VRRLGALRKRREQDRDRTSSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-372GGTKSPRPARTRGLNKKG
441-442PK
455-460RRLGRL
486-505KTQPSPKPGVRRLGALRKRR
563-583RRMQLKRTIEAGAAGRKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSESVVGGWQELQTLSRRQCPKLFYQFSTDQESLTVLLTDLISIWETSLDSYDIKAAAARQRTTVDPSASSRQFEVLLSKLRQSLSDGKNTITRGSGRNSQILHLRTRIDLPHPLNPLDWTFTLEPQTSPELAERILHPSLREVAVSQSKIDSLLAIVKEKDHVISKLLDRIGNSAVDLSLVFPGIAGLATRKGGHVSVADAKKRVPGMADFDEGAWIKQFADDDGYEGADRTGLSNLVRGCEKCFAHSKSEHEKWVKDLPTTSEMQSGGKDDAQVQPPPIELAEENSGAGDESAEDEFERQPTPPHLKAISPASRRAARQTMPPVRRASTTSTETATATASQDEDKDVRTPSRGGTKSPRPARTRGLNKKGAATRSPSATPSPSPSASASPSPLPTRSHPRHSSPTTSKRGEHDDETETEADDEDDDLDRSPLPSPVRKPKFKSPTPATGQTPRRLGRLGARKTQPPPDPGPASDEDDSPAKPEKTQPSPKPGVRRLGALRKRREQDRDRTSSPPATEADSRPRATDSPKSPSASMSISQRHKSPVDQSPPRETAEEAASRRRMQLKRTIEAGAAGRKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.35
4 0.41
5 0.45
6 0.5
7 0.53
8 0.58
9 0.62
10 0.65
11 0.59
12 0.61
13 0.62
14 0.6
15 0.63
16 0.53
17 0.42
18 0.36
19 0.33
20 0.26
21 0.2
22 0.17
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.1
37 0.09
38 0.1
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.2
45 0.27
46 0.27
47 0.28
48 0.31
49 0.33
50 0.38
51 0.39
52 0.35
53 0.32
54 0.36
55 0.42
56 0.42
57 0.41
58 0.35
59 0.31
60 0.29
61 0.27
62 0.25
63 0.21
64 0.26
65 0.26
66 0.28
67 0.3
68 0.29
69 0.29
70 0.31
71 0.37
72 0.34
73 0.41
74 0.4
75 0.38
76 0.42
77 0.42
78 0.38
79 0.32
80 0.31
81 0.26
82 0.3
83 0.36
84 0.35
85 0.39
86 0.39
87 0.38
88 0.42
89 0.41
90 0.4
91 0.35
92 0.33
93 0.3
94 0.32
95 0.32
96 0.29
97 0.34
98 0.34
99 0.37
100 0.39
101 0.38
102 0.36
103 0.35
104 0.32
105 0.27
106 0.24
107 0.22
108 0.2
109 0.21
110 0.24
111 0.23
112 0.21
113 0.2
114 0.23
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.15
119 0.15
120 0.16
121 0.14
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.19
129 0.18
130 0.14
131 0.18
132 0.23
133 0.23
134 0.21
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.12
140 0.07
141 0.11
142 0.11
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.18
153 0.19
154 0.24
155 0.25
156 0.24
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.19
161 0.17
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.18
186 0.23
187 0.24
188 0.24
189 0.24
190 0.26
191 0.26
192 0.24
193 0.17
194 0.15
195 0.19
196 0.21
197 0.22
198 0.19
199 0.19
200 0.2
201 0.19
202 0.17
203 0.11
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.12
228 0.14
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.26
233 0.27
234 0.31
235 0.33
236 0.38
237 0.41
238 0.45
239 0.48
240 0.44
241 0.42
242 0.41
243 0.45
244 0.4
245 0.32
246 0.3
247 0.26
248 0.26
249 0.27
250 0.24
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.15
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.13
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.09
269 0.06
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.04
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.13
291 0.19
292 0.2
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.25
297 0.31
298 0.34
299 0.3
300 0.32
301 0.33
302 0.35
303 0.35
304 0.37
305 0.35
306 0.28
307 0.32
308 0.39
309 0.44
310 0.43
311 0.48
312 0.46
313 0.42
314 0.42
315 0.39
316 0.34
317 0.3
318 0.31
319 0.27
320 0.26
321 0.25
322 0.24
323 0.22
324 0.17
325 0.12
326 0.1
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.25
341 0.24
342 0.26
343 0.33
344 0.41
345 0.49
346 0.56
347 0.62
348 0.57
349 0.6
350 0.63
351 0.65
352 0.67
353 0.68
354 0.69
355 0.68
356 0.65
357 0.67
358 0.65
359 0.59
360 0.5
361 0.45
362 0.39
363 0.35
364 0.35
365 0.3
366 0.27
367 0.26
368 0.25
369 0.24
370 0.26
371 0.23
372 0.24
373 0.24
374 0.24
375 0.23
376 0.23
377 0.2
378 0.18
379 0.21
380 0.21
381 0.22
382 0.23
383 0.25
384 0.35
385 0.38
386 0.46
387 0.48
388 0.53
389 0.59
390 0.61
391 0.65
392 0.64
393 0.68
394 0.67
395 0.66
396 0.62
397 0.57
398 0.59
399 0.54
400 0.48
401 0.42
402 0.37
403 0.35
404 0.35
405 0.31
406 0.24
407 0.2
408 0.17
409 0.13
410 0.1
411 0.09
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.13
421 0.16
422 0.22
423 0.29
424 0.4
425 0.49
426 0.56
427 0.62
428 0.68
429 0.75
430 0.75
431 0.78
432 0.74
433 0.74
434 0.74
435 0.74
436 0.68
437 0.68
438 0.68
439 0.63
440 0.64
441 0.56
442 0.51
443 0.46
444 0.43
445 0.43
446 0.46
447 0.47
448 0.48
449 0.51
450 0.55
451 0.58
452 0.65
453 0.61
454 0.57
455 0.56
456 0.55
457 0.54
458 0.48
459 0.49
460 0.43
461 0.43
462 0.38
463 0.32
464 0.27
465 0.25
466 0.24
467 0.22
468 0.25
469 0.2
470 0.21
471 0.28
472 0.35
473 0.43
474 0.53
475 0.57
476 0.61
477 0.69
478 0.73
479 0.76
480 0.74
481 0.73
482 0.64
483 0.64
484 0.63
485 0.65
486 0.69
487 0.68
488 0.7
489 0.71
490 0.77
491 0.78
492 0.8
493 0.78
494 0.8
495 0.81
496 0.8
497 0.75
498 0.72
499 0.69
500 0.65
501 0.57
502 0.5
503 0.4
504 0.37
505 0.38
506 0.38
507 0.42
508 0.43
509 0.42
510 0.4
511 0.42
512 0.4
513 0.41
514 0.46
515 0.42
516 0.44
517 0.49
518 0.51
519 0.48
520 0.47
521 0.44
522 0.39
523 0.35
524 0.35
525 0.38
526 0.42
527 0.44
528 0.46
529 0.48
530 0.47
531 0.48
532 0.48
533 0.5
534 0.53
535 0.59
536 0.62
537 0.65
538 0.66
539 0.63
540 0.57
541 0.47
542 0.41
543 0.39
544 0.4
545 0.34
546 0.4
547 0.43
548 0.43
549 0.48
550 0.54
551 0.51
552 0.51
553 0.58
554 0.58
555 0.58
556 0.6
557 0.56
558 0.47
559 0.47
560 0.46
561 0.45
562 0.45
563 0.46