Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2EDF1

Protein Details
Accession A0A0D2EDF1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-79GTLFPSSKKDKRRIKHAQLIHKVTKSNERKTRRRRPSKKLVTTLDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-72KKDKRRIKHAQLIHKVTKSNERKTRRRRPSKK
114-129KRKSIKSRPGAMKRRE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPVRQPPSRHAQPTKSILKKSSNGSQNDAATSGTLFPSSKKDKRRIKHAQLIHKVTKSNERKTRRRRPSKKLVTTLDALADALPHKEEAGNDVSRTKGATAGERPQDQVNIIKRKSIKSRPGAMKRRENLDKGERDRFAKNMAQLVTATSTPASVGKPDTKENGDASSRAAAVPPTSERWAALRGFISQTLETKPELKGLRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.77
3 0.74
4 0.7
5 0.66
6 0.66
7 0.64
8 0.62
9 0.62
10 0.59
11 0.55
12 0.56
13 0.55
14 0.49
15 0.45
16 0.39
17 0.3
18 0.22
19 0.2
20 0.15
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.1
25 0.17
26 0.26
27 0.32
28 0.4
29 0.5
30 0.59
31 0.66
32 0.76
33 0.79
34 0.8
35 0.83
36 0.82
37 0.83
38 0.82
39 0.83
40 0.78
41 0.69
42 0.62
43 0.55
44 0.57
45 0.54
46 0.55
47 0.57
48 0.6
49 0.68
50 0.76
51 0.85
52 0.86
53 0.89
54 0.89
55 0.9
56 0.92
57 0.93
58 0.91
59 0.89
60 0.82
61 0.74
62 0.65
63 0.56
64 0.45
65 0.34
66 0.24
67 0.15
68 0.11
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.13
89 0.18
90 0.21
91 0.22
92 0.23
93 0.21
94 0.21
95 0.18
96 0.21
97 0.24
98 0.28
99 0.28
100 0.3
101 0.32
102 0.37
103 0.44
104 0.47
105 0.48
106 0.48
107 0.57
108 0.64
109 0.72
110 0.77
111 0.76
112 0.77
113 0.71
114 0.72
115 0.68
116 0.6
117 0.56
118 0.55
119 0.56
120 0.52
121 0.55
122 0.49
123 0.48
124 0.47
125 0.42
126 0.38
127 0.33
128 0.3
129 0.28
130 0.27
131 0.24
132 0.22
133 0.22
134 0.2
135 0.16
136 0.14
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.12
144 0.17
145 0.2
146 0.23
147 0.27
148 0.28
149 0.3
150 0.3
151 0.31
152 0.28
153 0.26
154 0.25
155 0.22
156 0.2
157 0.17
158 0.17
159 0.13
160 0.12
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.22
168 0.25
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.24
176 0.22
177 0.24
178 0.23
179 0.24
180 0.23
181 0.23
182 0.22
183 0.26