Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D2FRT0

Protein Details
Accession A0A0D2FRT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-131LTSSKAQKSGKKRKANGAAKAEHydrophilic
448-469DISGMVKRKKPKATQSNGGESGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-126KSGKKRKANG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MATDDEVPTTVAEPSMATETADEKSSGTQSDADKRAQLTELVAQAAAEYAVKHYSEAAELYSQATELQAELNGEMATENADLYYAYGKCLFFLAQQTSSVLGGTAASAQLTSSKAQKSGKKRKANGAAKAEASTNNGGGASATSKAPPAAPETPVPNVGDVVPQEDVQQPLQTASDKPYFQISGDAEGWDDSEDDEADEDEEAEEEDDDDFATSYEFLDLARVLYLRKLDQTQEHAMEDSEKGKYVASIDLTPEVKSLKARVAEIYDLQAEVELEGEKYSDAAANLNACLALREELERPESSILAECHYKLSLALEFSASSEQRDAEGNPTGKLLVDWKIRNEAIAQQEKAIDVCKLRVAVETAALDKLDAGPAKDKAMAQIEDVQDMIAEMEVRLEELRKPPVSVKAESENEMKQQIQGVLGSLLGSSVTEEEKKEKLAQVTEKATDISGMVKRKKPKATQSNGGESGPGSAASTPAAAPGVAGESSLGKRKVEFVDEEAHADSGKKAKVEDAEDCGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.12
6 0.14
7 0.15
8 0.17
9 0.15
10 0.13
11 0.15
12 0.17
13 0.17
14 0.17
15 0.2
16 0.23
17 0.32
18 0.35
19 0.35
20 0.36
21 0.36
22 0.37
23 0.34
24 0.3
25 0.23
26 0.24
27 0.23
28 0.21
29 0.19
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.12
34 0.08
35 0.06
36 0.07
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.13
79 0.19
80 0.22
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.21
86 0.18
87 0.13
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.14
100 0.16
101 0.21
102 0.27
103 0.35
104 0.45
105 0.55
106 0.63
107 0.68
108 0.73
109 0.78
110 0.83
111 0.84
112 0.82
113 0.78
114 0.72
115 0.63
116 0.58
117 0.49
118 0.39
119 0.34
120 0.26
121 0.18
122 0.14
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.15
136 0.16
137 0.18
138 0.2
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.25
143 0.19
144 0.17
145 0.15
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.14
162 0.19
163 0.18
164 0.18
165 0.21
166 0.2
167 0.19
168 0.23
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.1
177 0.09
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.15
218 0.2
219 0.23
220 0.23
221 0.22
222 0.21
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.13
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.08
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.12
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.17
318 0.16
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.2
324 0.21
325 0.22
326 0.27
327 0.27
328 0.27
329 0.26
330 0.25
331 0.27
332 0.31
333 0.3
334 0.26
335 0.26
336 0.26
337 0.25
338 0.21
339 0.15
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.11
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.12
360 0.13
361 0.15
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.22
366 0.21
367 0.2
368 0.25
369 0.24
370 0.22
371 0.22
372 0.18
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.13
386 0.2
387 0.21
388 0.23
389 0.25
390 0.34
391 0.38
392 0.37
393 0.37
394 0.39
395 0.41
396 0.42
397 0.42
398 0.35
399 0.33
400 0.33
401 0.28
402 0.21
403 0.22
404 0.2
405 0.17
406 0.15
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.07
418 0.09
419 0.11
420 0.14
421 0.16
422 0.19
423 0.22
424 0.26
425 0.28
426 0.34
427 0.38
428 0.42
429 0.45
430 0.44
431 0.41
432 0.37
433 0.33
434 0.26
435 0.2
436 0.18
437 0.19
438 0.26
439 0.32
440 0.37
441 0.46
442 0.54
443 0.63
444 0.67
445 0.73
446 0.76
447 0.78
448 0.82
449 0.81
450 0.82
451 0.75
452 0.66
453 0.56
454 0.45
455 0.38
456 0.28
457 0.2
458 0.12
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.1
474 0.13
475 0.21
476 0.22
477 0.2
478 0.21
479 0.27
480 0.31
481 0.33
482 0.33
483 0.3
484 0.36
485 0.36
486 0.38
487 0.33
488 0.29
489 0.25
490 0.22
491 0.21
492 0.2
493 0.22
494 0.2
495 0.2
496 0.24
497 0.3
498 0.34
499 0.36