Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3QJB6

Protein Details
Accession A0A0C3QJB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-215EGQARERKRRSSSRSSRSRSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-251RERKRRSSSRSSRSRSSSRVSGAGSVRRSRSASGSDRGRYVSRSPSRSRSRSRG
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRGAVQIHGANPQFLVEKIIRTRIWESNYWKEHCFALTAETLIDKAIELKYIGGVYGNQRPTEFISLLLKLLQIQPEKEILVEYLLVDEFKYLRALAAMYIRMTFRPVEVFELLEPLLKDFRKLRVRSMAGYTLTYMDEFVDQLLTEERVCDIILPRLTKREVLEETEGLAPRSSALLKAMEQSGSEDEGQARERKRRSSSRSSRSRSSSRVSGAGSVRRSRSASGSDRGRYVSRSPSRSRSRSRGSSPTGSAARYRSRSRDISPDRMQED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.22
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.2
8 0.15
9 0.2
10 0.23
11 0.29
12 0.28
13 0.32
14 0.37
15 0.38
16 0.42
17 0.43
18 0.48
19 0.51
20 0.58
21 0.57
22 0.53
23 0.48
24 0.45
25 0.38
26 0.33
27 0.23
28 0.19
29 0.17
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.12
48 0.19
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.22
53 0.24
54 0.27
55 0.23
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.12
63 0.14
64 0.17
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.11
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.21
114 0.29
115 0.3
116 0.33
117 0.39
118 0.41
119 0.41
120 0.42
121 0.37
122 0.29
123 0.28
124 0.24
125 0.17
126 0.15
127 0.13
128 0.1
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.1
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.22
154 0.21
155 0.23
156 0.25
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.23
161 0.18
162 0.16
163 0.12
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.12
182 0.14
183 0.18
184 0.2
185 0.26
186 0.3
187 0.36
188 0.44
189 0.53
190 0.59
191 0.65
192 0.72
193 0.75
194 0.82
195 0.81
196 0.8
197 0.78
198 0.77
199 0.71
200 0.66
201 0.61
202 0.54
203 0.51
204 0.44
205 0.42
206 0.4
207 0.41
208 0.4
209 0.39
210 0.38
211 0.37
212 0.38
213 0.34
214 0.34
215 0.35
216 0.36
217 0.39
218 0.44
219 0.43
220 0.43
221 0.45
222 0.43
223 0.39
224 0.37
225 0.4
226 0.4
227 0.45
228 0.5
229 0.57
230 0.65
231 0.71
232 0.76
233 0.75
234 0.76
235 0.78
236 0.79
237 0.79
238 0.76
239 0.74
240 0.68
241 0.66
242 0.59
243 0.51
244 0.48
245 0.44
246 0.45
247 0.45
248 0.49
249 0.48
250 0.53
251 0.57
252 0.57
253 0.63
254 0.62
255 0.65
256 0.67