FuNGI

A0A0C3LR56

Protein Details

Accession

A0A0C3LR56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
462-484	SSSPERVRRPTKKAKPLVRAPAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
467-479	RVRRPTKKAKPLV

Subcellular Location(s)

extr 9, nucl 8, mito 6, cyto_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MSSQAKNKSQIVAAFATLGLTRSQVLAIFADDETSASSTALPQSATTSQHRQPHGDLDSPSSTMIPTPALPSVLQEAASATVQQFEGLAATRHTVSAAVASHPASTSAQGHTVAPVAPSTRPGLMEPSAGPQGPSAGVGSGFGRSLEYFGMQAAPASGNGLDALRSLAAQPVIPTSNALPASGMPQYFSLPPESRGQWGSSGTVSSQLPSHVPSSLAPMLAPAYGPMRATPAAPSSAPRFSANPTRARPAAPTRNRPITNIDKVVIVPSPLYERYTSYLSYACQRAGLSCPISLETGFSKEAVFKVLVALFGDKLDFDIFHFEWMFLSQQTGDSLIEANIPPRPCGTQISKAYRKKSVIFLRLQISAVPLLPRFKEFIRKRCAELGKSAAQLLNDPNLLEDGELMEEEADLVEDEGEFQCDRCGGVFLSLSRAPHLLKCIGSRKRTASTRHTSKTLGPVDPSSSPERVRRPTKKAKPLVRAPASPTRATSSSSRNTKLRLRSVTPAASALGEEVDQLEEDERTARKDSGAGDWDEEDGDEEDMDGDEEEEGDDDYEDDVGFEDEDNGFGEQLGGDHRSGSGVSVRTPSLCPFCDEILPKSLSPALKDALTSALRSAVRKPLPSNPNHYQLEWTRSIAVCSIHHAQTTSEASGLSWPTSIDFGQVPVRLLAHRQDLLAVLEGASTAHAVLEGFRDGSHPLTSTGAKLGALKYLHAGYYGPQGYELLCNSLLQMFSLQSANCLSVLSFFDFVHYVLAPYASFLLIRDDLKQDLQGSEIWMRWEYSRAHGEAYFPEM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.23
3	0.21
4	0.17
5	0.15
6	0.11
7	0.09
8	0.09
9	0.09
10	0.1
11	0.1
12	0.11
13	0.11
14	0.11
15	0.12
16	0.11
17	0.12
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.11
22	0.1
23	0.09
24	0.09
25	0.1
26	0.13
27	0.14
28	0.13
29	0.12
30	0.16
31	0.19
32	0.24
33	0.28
34	0.33
35	0.38
36	0.45
37	0.49
38	0.48
39	0.48
40	0.52
41	0.5
42	0.48
43	0.43
44	0.42
45	0.4
46	0.37
47	0.35
48	0.26
49	0.22
50	0.17
51	0.17
52	0.12
53	0.11
54	0.13
55	0.14
56	0.15
57	0.15
58	0.16
59	0.19
60	0.18
61	0.17
62	0.15
63	0.14
64	0.15
65	0.15
66	0.14
67	0.1
68	0.11
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.08
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.09
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.13
87	0.14
88	0.14
89	0.14
90	0.16
91	0.13
92	0.14
93	0.15
94	0.14
95	0.16
96	0.17
97	0.17
98	0.16
99	0.17
100	0.15
101	0.13
102	0.13
103	0.12
104	0.12
105	0.14
106	0.15
107	0.16
108	0.16
109	0.17
110	0.2
111	0.19
112	0.21
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.21
117	0.2
118	0.16
119	0.16
120	0.14
121	0.14
122	0.1
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.08
137	0.09
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.08
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.11
159	0.12
160	0.12
161	0.13
162	0.12
163	0.17
164	0.16
165	0.16
166	0.13
167	0.12
168	0.15
169	0.16
170	0.15
171	0.11
172	0.11
173	0.13
174	0.14
175	0.15
176	0.18
177	0.17
178	0.2
179	0.24
180	0.24
181	0.26
182	0.26
183	0.26
184	0.23
185	0.22
186	0.21
187	0.17
188	0.16
189	0.14
190	0.16
191	0.14
192	0.13
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.14
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.17
202	0.17
203	0.17
204	0.14
205	0.14
206	0.14
207	0.13
208	0.12
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.1
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.16
222	0.17
223	0.19
224	0.21
225	0.2
226	0.2
227	0.22
228	0.31
229	0.34
230	0.37
231	0.38
232	0.41
233	0.41
234	0.41
235	0.42
236	0.42
237	0.48
238	0.49
239	0.55
240	0.57
241	0.65
242	0.65
243	0.61
244	0.59
245	0.56
246	0.54
247	0.48
248	0.42
249	0.33
250	0.32
251	0.32
252	0.25
253	0.17
254	0.1
255	0.08
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.15
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.16
266	0.15
267	0.19
268	0.19
269	0.16
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.19
275	0.16
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.14
281	0.13
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.1
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.12
313	0.07
314	0.08
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.07
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.16
333	0.2
334	0.26
335	0.33
336	0.42
337	0.51
338	0.55
339	0.57
340	0.58
341	0.56
342	0.5
343	0.52
344	0.51
345	0.48
346	0.45
347	0.45
348	0.42
349	0.4
350	0.38
351	0.29
352	0.22
353	0.16
354	0.14
355	0.11
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.12
362	0.22
363	0.27
364	0.34
365	0.41
366	0.42
367	0.44
368	0.5
369	0.53
370	0.44
371	0.42
372	0.38
373	0.33
374	0.31
375	0.3
376	0.23
377	0.19
378	0.18
379	0.16
380	0.12
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.02
397	0.02
398	0.02
399	0.02
400	0.02
401	0.03
402	0.03
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.05
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.11
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.13
422	0.15
423	0.13
424	0.13
425	0.17
426	0.26
427	0.31
428	0.34
429	0.36
430	0.38
431	0.42
432	0.47
433	0.49
434	0.49
435	0.52
436	0.58
437	0.57
438	0.56
439	0.51
440	0.47
441	0.5
442	0.45
443	0.36
444	0.29
445	0.27
446	0.27
447	0.26
448	0.27
449	0.21
450	0.2
451	0.21
452	0.25
453	0.3
454	0.35
455	0.44
456	0.49
457	0.55
458	0.64
459	0.72
460	0.77
461	0.8
462	0.81
463	0.8
464	0.8
465	0.81
466	0.74
467	0.67
468	0.62
469	0.61
470	0.56
471	0.48
472	0.41
473	0.34
474	0.3
475	0.31
476	0.29
477	0.27
478	0.31
479	0.36
480	0.39
481	0.37
482	0.41
483	0.45
484	0.49
485	0.5
486	0.47
487	0.46
488	0.47
489	0.5
490	0.47
491	0.41
492	0.34
493	0.27
494	0.21
495	0.18
496	0.13
497	0.08
498	0.06
499	0.05
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.08
508	0.08
509	0.1
510	0.12
511	0.13
512	0.12
513	0.15
514	0.16
515	0.18
516	0.21
517	0.2
518	0.19
519	0.19
520	0.18
521	0.16
522	0.15
523	0.11
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.11
568	0.11
569	0.12
570	0.14
571	0.15
572	0.16
573	0.17
574	0.19
575	0.2
576	0.2
577	0.21
578	0.22
579	0.23
580	0.26
581	0.27
582	0.26
583	0.28
584	0.29
585	0.26
586	0.25
587	0.27
588	0.24
589	0.23
590	0.23
591	0.19
592	0.17
593	0.17
594	0.16
595	0.18
596	0.18
597	0.16
598	0.14
599	0.18
600	0.19
601	0.2
602	0.23
603	0.26
604	0.29
605	0.32
606	0.35
607	0.4
608	0.47
609	0.5
610	0.56
611	0.53
612	0.58
613	0.57
614	0.54
615	0.5
616	0.47
617	0.49
618	0.42
619	0.38
620	0.32
621	0.3
622	0.3
623	0.26
624	0.24
625	0.18
626	0.2
627	0.24
628	0.22
629	0.22
630	0.22
631	0.2
632	0.23
633	0.26
634	0.21
635	0.17
636	0.16
637	0.15
638	0.18
639	0.18
640	0.13
641	0.11
642	0.1
643	0.1
644	0.12
645	0.12
646	0.11
647	0.1
648	0.12
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.16
653	0.18
654	0.16
655	0.19
656	0.21
657	0.22
658	0.21
659	0.2
660	0.2
661	0.21
662	0.21
663	0.2
664	0.16
665	0.1
666	0.09
667	0.09
668	0.08
669	0.07
670	0.06
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.05
676	0.07
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.09
681	0.1
682	0.13
683	0.13
684	0.12
685	0.13
686	0.16
687	0.17
688	0.17
689	0.17
690	0.16
691	0.15
692	0.17
693	0.16
694	0.19
695	0.18
696	0.17
697	0.18
698	0.19
699	0.18
700	0.16
701	0.16
702	0.12
703	0.21
704	0.22
705	0.19
706	0.18
707	0.18
708	0.19
709	0.22
710	0.21
711	0.15
712	0.14
713	0.14
714	0.14
715	0.16
716	0.15
717	0.13
718	0.13
719	0.1
720	0.12
721	0.15
722	0.14
723	0.13
724	0.14
725	0.15
726	0.13
727	0.13
728	0.11
729	0.11
730	0.14
731	0.16
732	0.16
733	0.15
734	0.17
735	0.17
736	0.17
737	0.17
738	0.14
739	0.12
740	0.11
741	0.12
742	0.1
743	0.1
744	0.11
745	0.09
746	0.09
747	0.08
748	0.13
749	0.15
750	0.17
751	0.19
752	0.21
753	0.23
754	0.24
755	0.26
756	0.23
757	0.21
758	0.21
759	0.2
760	0.21
761	0.22
762	0.22
763	0.22
764	0.21
765	0.22
766	0.22
767	0.26
768	0.24
769	0.28
770	0.33
771	0.32
772	0.34
773	0.33
774	0.34

A0A0C3LR56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer