FuNGI

A7TPN0

Protein Details

Accession

A7TPN0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
573-596	DELPTSRKSSPKKQMKSSAKTSYR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
307-318	RAKRGNSRRKTR

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	vpo:Kpol_478p11 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MRRSTFSRSATPSGGGGTGSVDASPFIKPDRNRRNFLRARMGARNGGKGMLKKDDPGFEDERNAQLLQQTGVEVAGRMKLEDERGEVYNEFPLRAISRENLENMRTHLLKFQSKKKINPSNDFHLPIRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVERQKEIAEYKKAQINGGPNTGNMPNNIHPKSQNVPTPVANGLPPTNPLDSKVNGPEKPPAMTPSSIDAGSSSTGTSTPSADNVVKKEPDGNNVPNQSTEPGAENNPNIVVTKLEDAGPAEDPSKVGLVKYDGKEAPAEEEVFEAGTMDPLADVAPDGGGRAKRGNSRRKTRQIKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVMLAVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIEEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRRLKAVADQRRNIEGSESEHDDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDDEQLPDDTENDNDLFGEKKIDEEGERIKKALQKTELAALYSSDEGEINPYLSESDLENKENEKSPVKKESSDELPTSRKSSPKKQMKSSAKTSYREPQVMVKSIKDCIIILKADKKVLENFAPGEWNPEVSKRKREEMEQDQTIESDETTPETKKIKTEESESVPLITEQDVIDAIGNDKVNVKDFGKSIRKRYPGPENKKLMFAIVKKLCRKVDNEHMELKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.23
3	0.17
4	0.13
5	0.12
6	0.11
7	0.1
8	0.08
9	0.08
10	0.09
11	0.1
12	0.1
13	0.12
14	0.2
15	0.25
16	0.37
17	0.47
18	0.55
19	0.62
20	0.68
21	0.75
22	0.76
23	0.79
24	0.79
25	0.74
26	0.73
27	0.74
28	0.71
29	0.69
30	0.64
31	0.61
32	0.5
33	0.47
34	0.44
35	0.4
36	0.4
37	0.4
38	0.38
39	0.37
40	0.41
41	0.43
42	0.41
43	0.43
44	0.43
45	0.37
46	0.41
47	0.38
48	0.36
49	0.33
50	0.3
51	0.25
52	0.23
53	0.23
54	0.18
55	0.17
56	0.15
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.1
61	0.09
62	0.11
63	0.11
64	0.1
65	0.12
66	0.14
67	0.17
68	0.18
69	0.2
70	0.2
71	0.21
72	0.24
73	0.23
74	0.22
75	0.24
76	0.23
77	0.21
78	0.17
79	0.18
80	0.17
81	0.19
82	0.2
83	0.17
84	0.21
85	0.23
86	0.27
87	0.28
88	0.29
89	0.29
90	0.29
91	0.33
92	0.29
93	0.27
94	0.29
95	0.32
96	0.39
97	0.43
98	0.5
99	0.55
100	0.61
101	0.67
102	0.72
103	0.76
104	0.77
105	0.8
106	0.77
107	0.74
108	0.74
109	0.71
110	0.62
111	0.59
112	0.51
113	0.49
114	0.53
115	0.49
116	0.49
117	0.52
118	0.58
119	0.6
120	0.69
121	0.71
122	0.69
123	0.67
124	0.67
125	0.63
126	0.58
127	0.56
128	0.47
129	0.38
130	0.29
131	0.29
132	0.27
133	0.3
134	0.33
135	0.28
136	0.27
137	0.27
138	0.28
139	0.29
140	0.32
141	0.33
142	0.31
143	0.34
144	0.38
145	0.38
146	0.37
147	0.37
148	0.37
149	0.34
150	0.35
151	0.31
152	0.27
153	0.29
154	0.31
155	0.28
156	0.22
157	0.23
158	0.24
159	0.32
160	0.34
161	0.33
162	0.32
163	0.35
164	0.39
165	0.4
166	0.4
167	0.35
168	0.37
169	0.35
170	0.37
171	0.33
172	0.29
173	0.24
174	0.2
175	0.18
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.17
180	0.16
181	0.19
182	0.21
183	0.21
184	0.24
185	0.3
186	0.33
187	0.32
188	0.34
189	0.37
190	0.35
191	0.35
192	0.33
193	0.28
194	0.25
195	0.24
196	0.24
197	0.21
198	0.22
199	0.2
200	0.18
201	0.15
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.08
206	0.06
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.12
214	0.14
215	0.17
216	0.19
217	0.23
218	0.22
219	0.22
220	0.28
221	0.27
222	0.3
223	0.33
224	0.34
225	0.36
226	0.38
227	0.38
228	0.31
229	0.31
230	0.26
231	0.21
232	0.18
233	0.14
234	0.13
235	0.14
236	0.16
237	0.15
238	0.15
239	0.14
240	0.14
241	0.12
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.08
259	0.07
260	0.08
261	0.11
262	0.17
263	0.18
264	0.22
265	0.21
266	0.22
267	0.23
268	0.22
269	0.21
270	0.16
271	0.16
272	0.1
273	0.11
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.06
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.06
292	0.06
293	0.08
294	0.1
295	0.13
296	0.2
297	0.29
298	0.39
299	0.46
300	0.56
301	0.65
302	0.73
303	0.8
304	0.78
305	0.79
306	0.76
307	0.74
308	0.7
309	0.69
310	0.67
311	0.6
312	0.6
313	0.55
314	0.49
315	0.42
316	0.37
317	0.31
318	0.23
319	0.24
320	0.25
321	0.23
322	0.24
323	0.24
324	0.24
325	0.21
326	0.19
327	0.17
328	0.12
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.08
365	0.08
366	0.1
367	0.12
368	0.16
369	0.19
370	0.27
371	0.36
372	0.38
373	0.39
374	0.38
375	0.38
376	0.37
377	0.34
378	0.29
379	0.2
380	0.17
381	0.18
382	0.17
383	0.16
384	0.15
385	0.15
386	0.14
387	0.14
388	0.17
389	0.14
390	0.17
391	0.25
392	0.32
393	0.33
394	0.35
395	0.37
396	0.4
397	0.41
398	0.38
399	0.32
400	0.25
401	0.28
402	0.27
403	0.27
404	0.21
405	0.2
406	0.21
407	0.19
408	0.18
409	0.14
410	0.14
411	0.15
412	0.17
413	0.24
414	0.31
415	0.41
416	0.51
417	0.54
418	0.59
419	0.61
420	0.63
421	0.65
422	0.67
423	0.68
424	0.65
425	0.64
426	0.6
427	0.56
428	0.53
429	0.43
430	0.34
431	0.24
432	0.21
433	0.21
434	0.22
435	0.2
436	0.19
437	0.19
438	0.18
439	0.16
440	0.13
441	0.11
442	0.07
443	0.06
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.06
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.11
464	0.11
465	0.12
466	0.13
467	0.15
468	0.17
469	0.19
470	0.25
471	0.29
472	0.32
473	0.35
474	0.37
475	0.38
476	0.45
477	0.47
478	0.42
479	0.37
480	0.34
481	0.33
482	0.32
483	0.29
484	0.19
485	0.15
486	0.14
487	0.13
488	0.13
489	0.11
490	0.1
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.11
496	0.12
497	0.13
498	0.11
499	0.1
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.1
508	0.12
509	0.12
510	0.14
511	0.23
512	0.27
513	0.28
514	0.28
515	0.3
516	0.33
517	0.36
518	0.4
519	0.35
520	0.31
521	0.32
522	0.38
523	0.37
524	0.33
525	0.29
526	0.22
527	0.2
528	0.17
529	0.15
530	0.09
531	0.08
532	0.07
533	0.09
534	0.09
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.07
542	0.14
543	0.16
544	0.17
545	0.18
546	0.2
547	0.22
548	0.25
549	0.28
550	0.29
551	0.31
552	0.36
553	0.44
554	0.46
555	0.47
556	0.46
557	0.49
558	0.48
559	0.49
560	0.45
561	0.41
562	0.43
563	0.41
564	0.43
565	0.4
566	0.4
567	0.42
568	0.5
569	0.56
570	0.62
571	0.68
572	0.73
573	0.8
574	0.84
575	0.85
576	0.83
577	0.83
578	0.8
579	0.74
580	0.7
581	0.68
582	0.65
583	0.59
584	0.52
585	0.49
586	0.47
587	0.52
588	0.49
589	0.44
590	0.38
591	0.38
592	0.38
593	0.31
594	0.25
595	0.21
596	0.23
597	0.21
598	0.23
599	0.28
600	0.29
601	0.31
602	0.32
603	0.32
604	0.32
605	0.35
606	0.34
607	0.3
608	0.29
609	0.27
610	0.29
611	0.26
612	0.28
613	0.22
614	0.22
615	0.2
616	0.26
617	0.34
618	0.36
619	0.46
620	0.45
621	0.53
622	0.55
623	0.61
624	0.63
625	0.65
626	0.68
627	0.63
628	0.6
629	0.53
630	0.49
631	0.44
632	0.34
633	0.24
634	0.16
635	0.12
636	0.12
637	0.15
638	0.16
639	0.18
640	0.22
641	0.23
642	0.27
643	0.32
644	0.37
645	0.39
646	0.44
647	0.47
648	0.51
649	0.54
650	0.5
651	0.45
652	0.38
653	0.34
654	0.29
655	0.21
656	0.16
657	0.11
658	0.11
659	0.1
660	0.09
661	0.1
662	0.09
663	0.1
664	0.12
665	0.13
666	0.12
667	0.16
668	0.17
669	0.19
670	0.23
671	0.23
672	0.23
673	0.25
674	0.35
675	0.41
676	0.47
677	0.53
678	0.59
679	0.64
680	0.65
681	0.72
682	0.73
683	0.74
684	0.77
685	0.78
686	0.78
687	0.74
688	0.73
689	0.65
690	0.58
691	0.55
692	0.49
693	0.49
694	0.48
695	0.54
696	0.56
697	0.63
698	0.64
699	0.62
700	0.63
701	0.62
702	0.64
703	0.65
704	0.64

A7TPN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer