Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3Q6M6

Protein Details
Accession A0A0C3Q6M6    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-82GEAGGPRKKKRTKSDGEAGKPPRKKKKRERRPVEEEENLPBasic
97-123QIDAIVKPSKSRPRKRKKNEAETDLERHydrophilic
344-364DDRLRKMQRKLALNKQKNARLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-74GPRKKKRTKSDGEAGKPPRKKKKRERRP
103-114KPSKSRPRKRKK
346-355RLRKMQRKLA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MESSALEKDIFGSGSDLSDEDEEERYQRSYRVDDQQFADEGEGEAGGPRKKKRTKSDGEAGKPPRKKKKRERRPVEEEENLPDLTEEQRRKRDLEQQIDAIVKPSKSRPRKRKKNEAETDLERYQDEEVARLRDSMNLAADQDMEANMEKRPATAKLRMLPEVMEILQKQGLQQSICDNGLLIGVRRWLEPLPDKSLPALNIQNAFFEVLPKMEIDTSTLKEAGLGKIVLFYTRCKRVSPNIRRSAEYLVDIWSRPILKRSASYRDRQIPVAADSSISSSQPKPKLAAILAKAKEQEASRSRKSAVRIPERDFGTFTVAPSSRLPTAGPGGIAQAELERKKAADDRLRKMQRKLALNKQKNARL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.21
15 0.23
16 0.27
17 0.34
18 0.43
19 0.46
20 0.49
21 0.5
22 0.5
23 0.47
24 0.41
25 0.34
26 0.24
27 0.2
28 0.15
29 0.12
30 0.08
31 0.09
32 0.12
33 0.15
34 0.21
35 0.26
36 0.36
37 0.44
38 0.54
39 0.62
40 0.69
41 0.75
42 0.79
43 0.84
44 0.84
45 0.81
46 0.81
47 0.79
48 0.78
49 0.75
50 0.75
51 0.76
52 0.76
53 0.81
54 0.83
55 0.86
56 0.88
57 0.93
58 0.94
59 0.93
60 0.93
61 0.92
62 0.89
63 0.84
64 0.75
65 0.68
66 0.6
67 0.49
68 0.39
69 0.29
70 0.21
71 0.18
72 0.24
73 0.26
74 0.3
75 0.37
76 0.4
77 0.43
78 0.47
79 0.54
80 0.55
81 0.57
82 0.55
83 0.49
84 0.49
85 0.47
86 0.43
87 0.36
88 0.29
89 0.21
90 0.19
91 0.24
92 0.32
93 0.41
94 0.52
95 0.6
96 0.69
97 0.8
98 0.88
99 0.92
100 0.93
101 0.94
102 0.92
103 0.88
104 0.84
105 0.77
106 0.74
107 0.64
108 0.53
109 0.42
110 0.33
111 0.27
112 0.22
113 0.17
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.1
139 0.13
140 0.17
141 0.22
142 0.26
143 0.3
144 0.33
145 0.34
146 0.32
147 0.28
148 0.24
149 0.2
150 0.16
151 0.12
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.12
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.11
177 0.16
178 0.19
179 0.24
180 0.24
181 0.24
182 0.24
183 0.26
184 0.24
185 0.21
186 0.2
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.15
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.13
219 0.17
220 0.25
221 0.26
222 0.26
223 0.3
224 0.38
225 0.49
226 0.56
227 0.61
228 0.64
229 0.65
230 0.65
231 0.64
232 0.58
233 0.49
234 0.4
235 0.3
236 0.22
237 0.21
238 0.2
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.23
247 0.28
248 0.36
249 0.4
250 0.45
251 0.5
252 0.57
253 0.57
254 0.53
255 0.49
256 0.42
257 0.39
258 0.35
259 0.26
260 0.18
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.23
268 0.28
269 0.29
270 0.28
271 0.29
272 0.34
273 0.34
274 0.38
275 0.34
276 0.39
277 0.38
278 0.39
279 0.38
280 0.34
281 0.34
282 0.28
283 0.33
284 0.31
285 0.38
286 0.4
287 0.43
288 0.45
289 0.45
290 0.49
291 0.47
292 0.49
293 0.52
294 0.55
295 0.57
296 0.61
297 0.6
298 0.57
299 0.51
300 0.42
301 0.39
302 0.33
303 0.28
304 0.28
305 0.26
306 0.27
307 0.27
308 0.3
309 0.23
310 0.23
311 0.23
312 0.19
313 0.23
314 0.21
315 0.2
316 0.16
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.12
321 0.11
322 0.17
323 0.17
324 0.19
325 0.18
326 0.18
327 0.22
328 0.28
329 0.34
330 0.38
331 0.47
332 0.53
333 0.63
334 0.73
335 0.76
336 0.77
337 0.75
338 0.73
339 0.74
340 0.75
341 0.75
342 0.76
343 0.79
344 0.81