FuNGI

A0A0C3KF96

Protein Details

Accession

A0A0C3KF96

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-29	MSSIKTEKPAKPKSSRPKRAGPESRLKVV	Hydrophilic
204-225	KSASGKARRRKEKEHTQKERID	Basic
357-382	PGEAPNPPSRRPRKGKDKEKDSNASS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-27	KPAKPKSSRPKRAGPESRLK
200-218	RPEEKSASGKARRRKEKEH
244-288	ASKKGQSAKERAKNPARKPSESADAPSKSKGKTPASPVRPTRSKA
364-376	PSRRPRKGKDKEK
447-468	PRGRGRGGGRGRGRGRGRGGAP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSSIKTEKPAKPKSSRPKRAGPESRLKVVVRRLPPNLPEGVFWESVTPWVDAQTTSWKQFWPGKLRPKGVNKENVLSRAYIVFNTEEQLKNFHRDYDGHLFRDKSGNESQAVVEFAPFQKVPLAKAKVDQRQGSIQEDEDFKSFITSLSQVEPTEAEKLAMAPPPDLNEKMTTLTPLLASLLPNKDSHAAESRDKHHETRPEEKSASGKARRRKEKEHTQKERIDDAEFSRGPVRQDSTRPEEASKKGQSAKERAKNPARKPSESADAPSKSKGKTPASPVRPTRSKAPPGPQQGNDAAGPSTSAADGSTSPTQHKARPKFKFDGILAPGGGRPRPGRSESGHATPAASSPTTETAPGEAPNPPSRRPRKGKDKEKDSNASSSGPARTGSVAEHSGPKHAGDHLPAKPPAPMVVHRILQRPTARIDDEGATPDAPTSAGIIPVQMPPRGRGRGGGRGRGRGRGRGGAPAPES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.89
3	0.86
4	0.87
5	0.87
6	0.89
7	0.89
8	0.86
9	0.86
10	0.82
11	0.8
12	0.75
13	0.67
14	0.62
15	0.6
16	0.6
17	0.57
18	0.58
19	0.57
20	0.58
21	0.6
22	0.57
23	0.53
24	0.45
25	0.38
26	0.35
27	0.35
28	0.28
29	0.26
30	0.23
31	0.18
32	0.2
33	0.21
34	0.17
35	0.13
36	0.13
37	0.14
38	0.13
39	0.15
40	0.23
41	0.25
42	0.28
43	0.29
44	0.28
45	0.33
46	0.39
47	0.45
48	0.45
49	0.5
50	0.57
51	0.65
52	0.7
53	0.74
54	0.77
55	0.79
56	0.78
57	0.78
58	0.71
59	0.7
60	0.69
61	0.63
62	0.54
63	0.45
64	0.38
65	0.31
66	0.28
67	0.21
68	0.18
69	0.16
70	0.15
71	0.16
72	0.2
73	0.19
74	0.19
75	0.25
76	0.25
77	0.29
78	0.3
79	0.3
80	0.28
81	0.27
82	0.34
83	0.38
84	0.41
85	0.38
86	0.41
87	0.4
88	0.38
89	0.44
90	0.36
91	0.31
92	0.31
93	0.31
94	0.28
95	0.28
96	0.27
97	0.22
98	0.23
99	0.17
100	0.13
101	0.12
102	0.11
103	0.14
104	0.13
105	0.12
106	0.15
107	0.16
108	0.18
109	0.26
110	0.29
111	0.27
112	0.33
113	0.41
114	0.44
115	0.5
116	0.49
117	0.43
118	0.45
119	0.47
120	0.45
121	0.38
122	0.31
123	0.27
124	0.27
125	0.25
126	0.2
127	0.18
128	0.14
129	0.13
130	0.12
131	0.09
132	0.1
133	0.09
134	0.1
135	0.12
136	0.14
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.13
141	0.14
142	0.13
143	0.11
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.13
148	0.12
149	0.11
150	0.11
151	0.13
152	0.16
153	0.16
154	0.16
155	0.15
156	0.15
157	0.16
158	0.16
159	0.14
160	0.12
161	0.12
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.11
168	0.13
169	0.14
170	0.14
171	0.15
172	0.17
173	0.16
174	0.18
175	0.21
176	0.22
177	0.26
178	0.3
179	0.34
180	0.37
181	0.39
182	0.38
183	0.37
184	0.41
185	0.42
186	0.47
187	0.48
188	0.46
189	0.45
190	0.43
191	0.41
192	0.38
193	0.41
194	0.39
195	0.41
196	0.44
197	0.53
198	0.62
199	0.66
200	0.69
201	0.71
202	0.74
203	0.8
204	0.83
205	0.83
206	0.81
207	0.79
208	0.73
209	0.67
210	0.57
211	0.47
212	0.37
213	0.29
214	0.28
215	0.23
216	0.21
217	0.19
218	0.19
219	0.19
220	0.19
221	0.2
222	0.16
223	0.2
224	0.24
225	0.29
226	0.31
227	0.31
228	0.31
229	0.34
230	0.34
231	0.37
232	0.34
233	0.31
234	0.32
235	0.35
236	0.38
237	0.41
238	0.48
239	0.49
240	0.51
241	0.55
242	0.6
243	0.66
244	0.67
245	0.69
246	0.65
247	0.6
248	0.59
249	0.55
250	0.52
251	0.44
252	0.41
253	0.38
254	0.35
255	0.34
256	0.34
257	0.33
258	0.27
259	0.3
260	0.34
261	0.32
262	0.34
263	0.42
264	0.48
265	0.51
266	0.58
267	0.59
268	0.6
269	0.6
270	0.57
271	0.56
272	0.55
273	0.56
274	0.54
275	0.58
276	0.58
277	0.61
278	0.65
279	0.58
280	0.54
281	0.48
282	0.44
283	0.36
284	0.28
285	0.2
286	0.14
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.05
294	0.06
295	0.09
296	0.11
297	0.12
298	0.13
299	0.19
300	0.22
301	0.26
302	0.36
303	0.42
304	0.5
305	0.57
306	0.63
307	0.62
308	0.63
309	0.65
310	0.57
311	0.55
312	0.47
313	0.41
314	0.34
315	0.29
316	0.27
317	0.22
318	0.21
319	0.15
320	0.15
321	0.17
322	0.21
323	0.24
324	0.27
325	0.29
326	0.36
327	0.38
328	0.4
329	0.38
330	0.34
331	0.31
332	0.27
333	0.24
334	0.19
335	0.15
336	0.11
337	0.11
338	0.13
339	0.13
340	0.14
341	0.13
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.14
346	0.14
347	0.19
348	0.26
349	0.29
350	0.32
351	0.41
352	0.49
353	0.58
354	0.64
355	0.7
356	0.74
357	0.81
358	0.88
359	0.88
360	0.91
361	0.9
362	0.89
363	0.87
364	0.78
365	0.73
366	0.64
367	0.55
368	0.46
369	0.4
370	0.32
371	0.26
372	0.23
373	0.18
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.16
379	0.16
380	0.21
381	0.21
382	0.23
383	0.23
384	0.23
385	0.21
386	0.22
387	0.23
388	0.23
389	0.3
390	0.31
391	0.37
392	0.38
393	0.37
394	0.35
395	0.33
396	0.32
397	0.29
398	0.28
399	0.27
400	0.32
401	0.35
402	0.38
403	0.43
404	0.41
405	0.44
406	0.45
407	0.42
408	0.4
409	0.41
410	0.39
411	0.34
412	0.36
413	0.31
414	0.28
415	0.29
416	0.26
417	0.2
418	0.19
419	0.17
420	0.14
421	0.12
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.11
426	0.1
427	0.11
428	0.13
429	0.17
430	0.2
431	0.21
432	0.22
433	0.24
434	0.32
435	0.36
436	0.35
437	0.38
438	0.41
439	0.48
440	0.54
441	0.6
442	0.59
443	0.64
444	0.67
445	0.69
446	0.67
447	0.64
448	0.62
449	0.61
450	0.56
451	0.56
452	0.56

A0A0C3KF96

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer