Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3M4D4

Protein Details
Accession A0A0C3M4D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-179EEEAARKKKKNEKRTEVRAQKSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-174EAARKKKKNEKRTEVR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, cyto 9, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR002999  Tudor  
IPR043560  ZGPAT  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
CDD cd21182  Tudor_SMN_SPF30-like  
Amino Acid Sequences MDRNELETYQVQLSQVELALVSDPDNAELTSLRSELKELISLTEQALAQSEAAASLSTAASSSKSKSTSGAATTPTFAAGDEILAKYSGDGKWYPARITSIGGADDRRVYSVVFKGYNSTELVAAGDVKALPANYAATSASSASAGTKRKAVTKEEEEEAARKKKKNEKRTEVRAQKSAEQQQKQVAWQKFAKKGEKKGVVIAGMQGKSIFASPDNPYGRVGVTGSGKGMSDTVTRIKHKFAPTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.1
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.17
30 0.18
31 0.17
32 0.13
33 0.14
34 0.12
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.04
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.07
48 0.09
49 0.11
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.18
54 0.2
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.22
59 0.21
60 0.22
61 0.2
62 0.18
63 0.15
64 0.12
65 0.1
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.13
79 0.18
80 0.2
81 0.2
82 0.18
83 0.2
84 0.18
85 0.19
86 0.17
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.11
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.14
106 0.12
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.1
132 0.13
133 0.13
134 0.16
135 0.17
136 0.22
137 0.26
138 0.28
139 0.31
140 0.35
141 0.38
142 0.36
143 0.37
144 0.33
145 0.33
146 0.35
147 0.36
148 0.36
149 0.35
150 0.42
151 0.5
152 0.59
153 0.67
154 0.72
155 0.75
156 0.8
157 0.86
158 0.89
159 0.89
160 0.84
161 0.79
162 0.71
163 0.66
164 0.64
165 0.63
166 0.61
167 0.55
168 0.52
169 0.52
170 0.51
171 0.5
172 0.51
173 0.45
174 0.42
175 0.44
176 0.49
177 0.51
178 0.56
179 0.61
180 0.6
181 0.65
182 0.7
183 0.72
184 0.65
185 0.63
186 0.59
187 0.5
188 0.43
189 0.38
190 0.35
191 0.27
192 0.26
193 0.21
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.13
198 0.08
199 0.12
200 0.15
201 0.24
202 0.27
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.27
207 0.24
208 0.21
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.13
218 0.11
219 0.14
220 0.2
221 0.26
222 0.31
223 0.33
224 0.37
225 0.43