FuNGI

A0A0C3L8R5

Protein Details

Accession

A0A0C3L8R5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-60	PDENQKPKPRSVAPKRKGSDRQI	Hydrophilic
84-104	EYNVAKFRPKRPGQRLQLSSF	Hydrophilic
124-150	NTTNTKPIAKGRRRARVKKNATWRVYP	Hydrophilic
541-566	AVDPNPSPTKRKRTNKMLRPPCPTYG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-54	KPRSVAPKRK
131-142	IAKGRRRARVKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 4.333, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MALLSAALLMEKAEALKRGSPLNKVKVTKTQNGRVYAPDENQKPKPRSVAPKRKGSDRQIVLSSSTNTAIATTLPIFSAPSPVEYNVAKFRPKRPGQRLQLSSFTSSTTIERRNIFAEAHDPTNTTNTKPIAKGRRRARVKKNATWRVYPESNNSLKAKVEMNPWVIDDAAGEQQWVGQLNGESDGGHWAVLTRHVNYFEFTPLNRLYDFSPKEQVVGRGCETKTPSATLSSQLPARRHVNRPGGSDMAFRDSMVGLSRNSTFDDSSELGEGGDVDELSYEKDPSDDEEGYGHDGSAENADVKDLRERMRRAFILDTDGGQDKTKELNEKQAAQRQDWIQTFKVVAKHFNPDAETDHCDEDADEEDDVYRVKYGQVDSGVELSPIRFLLGVQPQKETGKRPTPVATPDVTSLTSPAVQTLEKGKKSSDSGHIGVPKKDFMRTLGGRIDSNPSLPASGASLVPCITIQREKPNHSHDTHHRNFISTASLLGTADLIPAKSPSQALSVSASSTHSKTTKRKTVHVGESVKAVETCFPNPTSSAVDPNPSPTKRKRTNKMLRPPCPTYGDLITLLRDNGGAMQVNALRERYQTRKYQDNREIVTQFVKNSQFVASSKAESKLWVHLKPQHMQP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.15
3	0.19
4	0.21
5	0.29
6	0.33
7	0.41
8	0.48
9	0.54
10	0.6
11	0.6
12	0.63
13	0.65
14	0.69
15	0.69
16	0.69
17	0.69
18	0.68
19	0.69
20	0.66
21	0.6
22	0.57
23	0.53
24	0.49
25	0.48
26	0.48
27	0.5
28	0.57
29	0.63
30	0.62
31	0.62
32	0.65
33	0.65
34	0.7
35	0.74
36	0.76
37	0.75
38	0.81
39	0.8
40	0.82
41	0.82
42	0.79
43	0.78
44	0.73
45	0.7
46	0.63
47	0.6
48	0.53
49	0.47
50	0.41
51	0.33
52	0.28
53	0.22
54	0.18
55	0.17
56	0.14
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.09
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.15
66	0.13
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.21
71	0.2
72	0.24
73	0.27
74	0.3
75	0.34
76	0.37
77	0.43
78	0.51
79	0.59
80	0.66
81	0.69
82	0.76
83	0.79
84	0.84
85	0.83
86	0.78
87	0.76
88	0.68
89	0.61
90	0.51
91	0.42
92	0.33
93	0.27
94	0.25
95	0.24
96	0.26
97	0.28
98	0.29
99	0.3
100	0.31
101	0.32
102	0.29
103	0.24
104	0.24
105	0.23
106	0.23
107	0.22
108	0.2
109	0.19
110	0.25
111	0.25
112	0.22
113	0.23
114	0.24
115	0.27
116	0.3
117	0.38
118	0.42
119	0.5
120	0.58
121	0.62
122	0.7
123	0.76
124	0.83
125	0.85
126	0.85
127	0.87
128	0.86
129	0.88
130	0.88
131	0.82
132	0.78
133	0.72
134	0.69
135	0.64
136	0.58
137	0.53
138	0.51
139	0.49
140	0.48
141	0.44
142	0.38
143	0.33
144	0.32
145	0.29
146	0.24
147	0.26
148	0.26
149	0.27
150	0.27
151	0.27
152	0.25
153	0.22
154	0.19
155	0.14
156	0.11
157	0.1
158	0.09
159	0.08
160	0.07
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.09
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.08
172	0.1
173	0.08
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.12
179	0.14
180	0.14
181	0.16
182	0.18
183	0.19
184	0.19
185	0.2
186	0.18
187	0.18
188	0.16
189	0.19
190	0.18
191	0.19
192	0.18
193	0.18
194	0.17
195	0.24
196	0.27
197	0.25
198	0.29
199	0.27
200	0.28
201	0.29
202	0.32
203	0.26
204	0.27
205	0.26
206	0.27
207	0.27
208	0.29
209	0.3
210	0.28
211	0.26
212	0.24
213	0.23
214	0.2
215	0.21
216	0.19
217	0.19
218	0.18
219	0.2
220	0.23
221	0.23
222	0.25
223	0.31
224	0.34
225	0.37
226	0.44
227	0.5
228	0.49
229	0.51
230	0.5
231	0.46
232	0.4
233	0.37
234	0.29
235	0.24
236	0.2
237	0.16
238	0.14
239	0.12
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.08
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.13
249	0.11
250	0.1
251	0.14
252	0.13
253	0.12
254	0.12
255	0.11
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.08
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.14
278	0.13
279	0.11
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.09
291	0.11
292	0.14
293	0.2
294	0.23
295	0.25
296	0.3
297	0.3
298	0.29
299	0.29
300	0.26
301	0.24
302	0.22
303	0.2
304	0.16
305	0.17
306	0.15
307	0.13
308	0.13
309	0.09
310	0.11
311	0.12
312	0.15
313	0.15
314	0.23
315	0.25
316	0.3
317	0.33
318	0.37
319	0.37
320	0.33
321	0.37
322	0.29
323	0.33
324	0.3
325	0.29
326	0.24
327	0.23
328	0.23
329	0.22
330	0.25
331	0.2
332	0.22
333	0.2
334	0.24
335	0.24
336	0.24
337	0.23
338	0.19
339	0.21
340	0.2
341	0.21
342	0.18
343	0.18
344	0.17
345	0.16
346	0.14
347	0.12
348	0.11
349	0.1
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.05
357	0.04
358	0.05
359	0.08
360	0.08
361	0.1
362	0.12
363	0.12
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.11
368	0.11
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.1
376	0.17
377	0.22
378	0.22
379	0.23
380	0.25
381	0.28
382	0.3
383	0.29
384	0.29
385	0.33
386	0.34
387	0.36
388	0.38
389	0.38
390	0.39
391	0.38
392	0.32
393	0.25
394	0.25
395	0.23
396	0.2
397	0.17
398	0.14
399	0.12
400	0.11
401	0.1
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.1
406	0.18
407	0.24
408	0.25
409	0.26
410	0.26
411	0.28
412	0.31
413	0.34
414	0.33
415	0.31
416	0.31
417	0.34
418	0.41
419	0.4
420	0.4
421	0.37
422	0.34
423	0.29
424	0.29
425	0.26
426	0.21
427	0.28
428	0.26
429	0.29
430	0.3
431	0.3
432	0.29
433	0.29
434	0.32
435	0.23
436	0.23
437	0.2
438	0.16
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.09
443	0.1
444	0.1
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.1
452	0.14
453	0.17
454	0.26
455	0.33
456	0.37
457	0.44
458	0.5
459	0.54
460	0.52
461	0.57
462	0.56
463	0.61
464	0.6
465	0.62
466	0.55
467	0.5
468	0.49
469	0.42
470	0.36
471	0.25
472	0.22
473	0.14
474	0.14
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.13
489	0.13
490	0.14
491	0.16
492	0.16
493	0.15
494	0.15
495	0.17
496	0.17
497	0.17
498	0.2
499	0.21
500	0.28
501	0.37
502	0.46
503	0.53
504	0.55
505	0.62
506	0.67
507	0.72
508	0.73
509	0.73
510	0.67
511	0.59
512	0.58
513	0.51
514	0.43
515	0.33
516	0.25
517	0.21
518	0.19
519	0.2
520	0.2
521	0.21
522	0.21
523	0.21
524	0.23
525	0.25
526	0.23
527	0.28
528	0.26
529	0.28
530	0.27
531	0.34
532	0.4
533	0.37
534	0.43
535	0.45
536	0.55
537	0.62
538	0.72
539	0.75
540	0.78
541	0.87
542	0.9
543	0.92
544	0.92
545	0.9
546	0.89
547	0.84
548	0.78
549	0.72
550	0.63
551	0.56
552	0.48
553	0.42
554	0.36
555	0.31
556	0.27
557	0.24
558	0.22
559	0.18
560	0.14
561	0.12
562	0.1
563	0.12
564	0.11
565	0.1
566	0.13
567	0.15
568	0.17
569	0.19
570	0.19
571	0.18
572	0.21
573	0.27
574	0.31
575	0.36
576	0.43
577	0.47
578	0.56
579	0.62
580	0.7
581	0.72
582	0.74
583	0.71
584	0.71
585	0.66
586	0.58
587	0.57
588	0.49
589	0.41
590	0.39
591	0.37
592	0.3
593	0.3
594	0.29
595	0.27
596	0.25
597	0.29
598	0.26
599	0.27
600	0.3
601	0.31
602	0.3
603	0.29
604	0.31
605	0.34
606	0.38
607	0.38
608	0.42
609	0.46
610	0.53

A0A0C3L8R5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer