Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3M6T5

Protein Details
Accession A0A0C3M6T5    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-132DDDLFGPEPPRKRRKKSKAARKAIAERPKDBasic
151-173LFKGRAIKKSRVKVRPYNVQPVAHydrophilic
417-440LSFNKVRGAKKKKDKAGRKITRGDBasic
943-968QEEIARLKKNQGRRLQRKQKAGEQIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-130PPRKRRKKSKAARKAIAERP
336-338RPR
422-436VRGAKKKKDKAGRKI
950-960KKNQGRRLQRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MDDEAFDPKAIRGLGLDTVLAALELPSSASLGNQLGLSGLDFYTSSRLFAGFPEEGAIGVGEGDDYEDEVDMEIKKEEEDVDMGAMSPLRPVVATASPSEEDDDDLFGPEPPRKRRKKSKAARKAIAERPKDVGELFPTFEPGKILDFTELFKGRAIKKSRVKVRPYNVQPVAPKERELADPRPIKSLIGDAKTVVQQSKASAAEPAVDPNTILLRVIDSQRQRNDAQENHLISDTLPVDDRSYDLVLLADWEKDILFDPPAPTSTAITAPNLLEPNASMSLSNPHNLYLESNDWLQTIIWDIRRPFKDFRQLPFDPEPIPKETLPPPVKAPEAPRPRRRVRIDLTVPQDKFNLSNDQYYEVSKEKSRVRQTFGQLIVEHAYPAQKLQLPFYKTRLSKQEARSWHRPALQFPTNLPLSFNKVRGAKKKKDKAGRKITRGDLTEGLRFTGDISLRDTSSFVLLEYSEEYPATLSSFGMGSVLVNYYRKRNDADEYIPKLDLGEPFILEPNDESPFMRHGHVPQGDTVQAVYNNLYRAPLFRHKPASTDFLVIRSTTKGESRYFIREIKNLFVVGQTFPIVEVPGPHSRKITNTIKGRLQVIAFRLLGKSKEGRIKIQRLLKYFPDENELQMKQRLKPFIKEFMEFHRTGPHQNYWRTKTTIKQPTRAEMLRIVEPEHVVLSEAMTVGSQHLMDSGYGKGDFADAEKDDEETNKMSIEQQLAPWMTTKSFVSAATKGTLMKLHGDGDPTKRGEAFSFIRASAKTPFVKAGEDPEVVNEQIASKTKNQHKYTVADQQLAYRQEVDRIWKAQHDSLSNPIPPVLTEEEDEPHPSHSISRRGSLQPGARARSPSIPFSDRVPSRAGSVGFGGQQDNASLDGRDPMSNRVLRIRRLIDGKWKTEIIRDPRVITAYIERKRIDEESSINPENLVVTGDSATDARNAKRLQEEIARLKKNQGRRLQRKQKAGEQIPAGEYYTQSETTRKCGNCGQIGHMKTNRKCPRWAEFHADGGPISAASPPPATAASPPPGGSAMSPPAASSLHLGRESYFGPGSAFRNPSFTMPPVPSPLATSPPFSAQQGWQEEGAMSPDAAGSTAKKITLKVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.11
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.07
9 0.05
10 0.04
11 0.04
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.21
38 0.16
39 0.16
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.04
49 0.04
50 0.05
51 0.04
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.11
80 0.14
81 0.16
82 0.16
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.24
87 0.2
88 0.18
89 0.17
90 0.18
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.2
97 0.28
98 0.35
99 0.46
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.83
104 0.89
105 0.92
106 0.93
107 0.94
108 0.95
109 0.92
110 0.91
111 0.89
112 0.87
113 0.86
114 0.79
115 0.71
116 0.64
117 0.57
118 0.49
119 0.4
120 0.33
121 0.29
122 0.27
123 0.25
124 0.21
125 0.23
126 0.22
127 0.22
128 0.2
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.16
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.23
137 0.24
138 0.22
139 0.23
140 0.28
141 0.3
142 0.38
143 0.43
144 0.45
145 0.52
146 0.62
147 0.7
148 0.73
149 0.78
150 0.79
151 0.81
152 0.82
153 0.8
154 0.81
155 0.74
156 0.7
157 0.65
158 0.64
159 0.64
160 0.55
161 0.49
162 0.41
163 0.4
164 0.41
165 0.43
166 0.4
167 0.4
168 0.45
169 0.44
170 0.47
171 0.45
172 0.39
173 0.33
174 0.36
175 0.33
176 0.29
177 0.29
178 0.25
179 0.27
180 0.29
181 0.3
182 0.23
183 0.19
184 0.17
185 0.18
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.18
192 0.17
193 0.19
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.08
202 0.09
203 0.12
204 0.15
205 0.2
206 0.24
207 0.32
208 0.36
209 0.4
210 0.39
211 0.42
212 0.47
213 0.44
214 0.45
215 0.45
216 0.43
217 0.4
218 0.39
219 0.34
220 0.26
221 0.27
222 0.21
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.15
261 0.12
262 0.11
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.1
267 0.1
268 0.15
269 0.17
270 0.18
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.15
283 0.13
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.14
288 0.18
289 0.19
290 0.27
291 0.31
292 0.35
293 0.37
294 0.4
295 0.49
296 0.5
297 0.54
298 0.54
299 0.52
300 0.54
301 0.53
302 0.49
303 0.41
304 0.39
305 0.37
306 0.31
307 0.34
308 0.27
309 0.27
310 0.28
311 0.36
312 0.35
313 0.33
314 0.33
315 0.33
316 0.34
317 0.33
318 0.36
319 0.35
320 0.44
321 0.51
322 0.57
323 0.63
324 0.68
325 0.75
326 0.76
327 0.75
328 0.69
329 0.7
330 0.69
331 0.67
332 0.67
333 0.65
334 0.6
335 0.52
336 0.47
337 0.37
338 0.31
339 0.27
340 0.27
341 0.21
342 0.23
343 0.23
344 0.26
345 0.26
346 0.25
347 0.25
348 0.2
349 0.21
350 0.19
351 0.24
352 0.27
353 0.35
354 0.44
355 0.45
356 0.49
357 0.54
358 0.57
359 0.59
360 0.54
361 0.49
362 0.39
363 0.36
364 0.32
365 0.24
366 0.2
367 0.13
368 0.12
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.16
375 0.22
376 0.25
377 0.28
378 0.32
379 0.37
380 0.35
381 0.4
382 0.43
383 0.43
384 0.47
385 0.5
386 0.54
387 0.55
388 0.62
389 0.64
390 0.61
391 0.61
392 0.58
393 0.54
394 0.5
395 0.49
396 0.46
397 0.4
398 0.35
399 0.35
400 0.31
401 0.29
402 0.27
403 0.2
404 0.23
405 0.24
406 0.25
407 0.24
408 0.29
409 0.35
410 0.43
411 0.51
412 0.53
413 0.61
414 0.69
415 0.73
416 0.78
417 0.82
418 0.82
419 0.85
420 0.85
421 0.81
422 0.79
423 0.76
424 0.71
425 0.62
426 0.55
427 0.47
428 0.4
429 0.36
430 0.29
431 0.24
432 0.18
433 0.16
434 0.14
435 0.13
436 0.12
437 0.1
438 0.12
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.13
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.08
471 0.12
472 0.14
473 0.16
474 0.17
475 0.19
476 0.22
477 0.25
478 0.3
479 0.33
480 0.35
481 0.35
482 0.33
483 0.3
484 0.27
485 0.24
486 0.19
487 0.14
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.11
492 0.1
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.11
501 0.12
502 0.13
503 0.12
504 0.12
505 0.19
506 0.21
507 0.21
508 0.19
509 0.19
510 0.18
511 0.17
512 0.16
513 0.1
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.08
523 0.13
524 0.2
525 0.21
526 0.25
527 0.31
528 0.31
529 0.33
530 0.35
531 0.34
532 0.28
533 0.28
534 0.24
535 0.19
536 0.19
537 0.17
538 0.15
539 0.12
540 0.11
541 0.1
542 0.12
543 0.13
544 0.14
545 0.16
546 0.18
547 0.22
548 0.23
549 0.27
550 0.27
551 0.27
552 0.28
553 0.27
554 0.25
555 0.21
556 0.18
557 0.15
558 0.14
559 0.11
560 0.1
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.09
569 0.16
570 0.18
571 0.19
572 0.2
573 0.2
574 0.22
575 0.3
576 0.32
577 0.32
578 0.37
579 0.4
580 0.42
581 0.43
582 0.43
583 0.36
584 0.3
585 0.25
586 0.2
587 0.2
588 0.17
589 0.16
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.15
594 0.15
595 0.16
596 0.22
597 0.23
598 0.3
599 0.36
600 0.42
601 0.45
602 0.5
603 0.5
604 0.47
605 0.49
606 0.45
607 0.43
608 0.38
609 0.33
610 0.31
611 0.27
612 0.25
613 0.27
614 0.25
615 0.21
616 0.24
617 0.26
618 0.25
619 0.29
620 0.35
621 0.31
622 0.38
623 0.4
624 0.44
625 0.45
626 0.43
627 0.4
628 0.39
629 0.43
630 0.37
631 0.34
632 0.31
633 0.29
634 0.3
635 0.33
636 0.32
637 0.33
638 0.39
639 0.47
640 0.45
641 0.48
642 0.49
643 0.47
644 0.46
645 0.5
646 0.54
647 0.5
648 0.53
649 0.51
650 0.51
651 0.55
652 0.5
653 0.42
654 0.36
655 0.34
656 0.29
657 0.27
658 0.24
659 0.19
660 0.18
661 0.16
662 0.12
663 0.09
664 0.08
665 0.07
666 0.06
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.04
671 0.05
672 0.04
673 0.05
674 0.04
675 0.04
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.06
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.09
689 0.08
690 0.09
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.11
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.09
699 0.1
700 0.1
701 0.12
702 0.14
703 0.14
704 0.13
705 0.17
706 0.17
707 0.17
708 0.17
709 0.16
710 0.13
711 0.14
712 0.13
713 0.11
714 0.12
715 0.12
716 0.14
717 0.15
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.15
722 0.14
723 0.15
724 0.13
725 0.13
726 0.13
727 0.14
728 0.14
729 0.16
730 0.18
731 0.2
732 0.25
733 0.23
734 0.23
735 0.22
736 0.21
737 0.19
738 0.22
739 0.21
740 0.19
741 0.2
742 0.2
743 0.21
744 0.21
745 0.22
746 0.2
747 0.24
748 0.21
749 0.21
750 0.23
751 0.22
752 0.24
753 0.22
754 0.24
755 0.22
756 0.22
757 0.21
758 0.19
759 0.2
760 0.18
761 0.18
762 0.12
763 0.09
764 0.11
765 0.13
766 0.13
767 0.16
768 0.25
769 0.33
770 0.43
771 0.45
772 0.49
773 0.52
774 0.53
775 0.55
776 0.55
777 0.5
778 0.43
779 0.41
780 0.38
781 0.39
782 0.37
783 0.32
784 0.24
785 0.22
786 0.22
787 0.24
788 0.26
789 0.25
790 0.26
791 0.26
792 0.28
793 0.31
794 0.31
795 0.33
796 0.3
797 0.27
798 0.31
799 0.34
800 0.31
801 0.28
802 0.25
803 0.21
804 0.18
805 0.21
806 0.18
807 0.15
808 0.15
809 0.16
810 0.17
811 0.18
812 0.21
813 0.17
814 0.16
815 0.15
816 0.14
817 0.18
818 0.22
819 0.29
820 0.29
821 0.32
822 0.35
823 0.37
824 0.41
825 0.42
826 0.41
827 0.41
828 0.45
829 0.45
830 0.43
831 0.43
832 0.41
833 0.43
834 0.41
835 0.37
836 0.36
837 0.35
838 0.34
839 0.35
840 0.41
841 0.34
842 0.34
843 0.33
844 0.28
845 0.27
846 0.3
847 0.27
848 0.19
849 0.19
850 0.19
851 0.17
852 0.17
853 0.16
854 0.12
855 0.12
856 0.11
857 0.1
858 0.1
859 0.09
860 0.09
861 0.08
862 0.11
863 0.13
864 0.14
865 0.15
866 0.17
867 0.24
868 0.25
869 0.27
870 0.33
871 0.36
872 0.38
873 0.44
874 0.44
875 0.42
876 0.45
877 0.47
878 0.48
879 0.5
880 0.5
881 0.46
882 0.45
883 0.41
884 0.42
885 0.47
886 0.44
887 0.46
888 0.46
889 0.44
890 0.44
891 0.45
892 0.4
893 0.33
894 0.35
895 0.35
896 0.37
897 0.41
898 0.39
899 0.38
900 0.41
901 0.41
902 0.36
903 0.3
904 0.3
905 0.32
906 0.39
907 0.39
908 0.35
909 0.33
910 0.3
911 0.26
912 0.21
913 0.15
914 0.08
915 0.07
916 0.07
917 0.08
918 0.08
919 0.08
920 0.08
921 0.11
922 0.14
923 0.15
924 0.22
925 0.22
926 0.25
927 0.3
928 0.31
929 0.32
930 0.36
931 0.43
932 0.46
933 0.55
934 0.55
935 0.51
936 0.59
937 0.59
938 0.61
939 0.62
940 0.62
941 0.64
942 0.71
943 0.82
944 0.84
945 0.87
946 0.88
947 0.86
948 0.85
949 0.84
950 0.79
951 0.74
952 0.67
953 0.62
954 0.53
955 0.47
956 0.39
957 0.29
958 0.24
959 0.2
960 0.19
961 0.18
962 0.18
963 0.22
964 0.23
965 0.28
966 0.36
967 0.33
968 0.34
969 0.38
970 0.44
971 0.45
972 0.46
973 0.47
974 0.47
975 0.49
976 0.53
977 0.54
978 0.56
979 0.54
980 0.62
981 0.66
982 0.62
983 0.67
984 0.66
985 0.69
986 0.68
987 0.7
988 0.68
989 0.62
990 0.63
991 0.57
992 0.51
993 0.41
994 0.33
995 0.27
996 0.18
997 0.14
998 0.11
999 0.09
1000 0.1
1001 0.11
1002 0.1
1003 0.12
1004 0.12
1005 0.13
1006 0.15
1007 0.2
1008 0.22
1009 0.23
1010 0.24
1011 0.23
1012 0.23
1013 0.23
1014 0.2
1015 0.19
1016 0.19
1017 0.19
1018 0.18
1019 0.17
1020 0.18
1021 0.18
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.16
1025 0.2
1026 0.21
1027 0.22
1028 0.21
1029 0.23
1030 0.23
1031 0.24
1032 0.2
1033 0.16
1034 0.16
1035 0.2
1036 0.22
1037 0.26
1038 0.29
1039 0.26
1040 0.3
1041 0.31
1042 0.33
1043 0.34
1044 0.34
1045 0.33
1046 0.33
1047 0.36
1048 0.37
1049 0.38
1050 0.34
1051 0.34
1052 0.34
1053 0.34
1054 0.33
1055 0.33
1056 0.29
1057 0.32
1058 0.33
1059 0.3
1060 0.31
1061 0.28
1062 0.35
1063 0.36
1064 0.36
1065 0.32
1066 0.31
1067 0.29
1068 0.26
1069 0.25
1070 0.17
1071 0.12
1072 0.1
1073 0.1
1074 0.09
1075 0.1
1076 0.1
1077 0.09
1078 0.13
1079 0.15
1080 0.18
1081 0.19
1082 0.23