Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3LM19

Protein Details
Accession A0A0C3LM19    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-63RSEWEAYRREREKRRNDDQEAKRKAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-51REREKR
Subcellular Location(s) nucl 7, cyto 7, cyto_nucl 7, cysk 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
Amino Acid Sequences MVDQYTKILIPPPEALEDLAEIKGGSGKWKVLERIRERSEWEAYRREREKRRNDDQEAKRKAFGEIDWNDYAIKKMAAMVMETAAPEVEALRAVQAAGENDASTSEPDDSAMQLEESAVSEAKRKELEEAERARATQALSAAPMKIRKDYVPKSLAAKKADKTMTTTCQICGQLIPVDQLEEHTRIELLDPRWKSQRDSLEARRAIGNEQQLGANVVTSLKQLARAFVDDEADEVKRKQLEVEAEAKRKEREKIAWDGYTATKEGTVNKFQSNVNFDEQIASIWKAKGLARADPSTTGPGIGPSIGPAPGGPSAAPAPAPALPPSLPPNPLINPATGQAYAAGSVASGPQPATQYDMQYDMQFPPPGGFGLPPNPGFMPGPSGYPPQMPPSMGGPMAGMHPSRLAQLGGEGPPHVAGVTRSADEMEGVVSGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.16
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.13
11 0.12
12 0.14
13 0.15
14 0.18
15 0.21
16 0.27
17 0.34
18 0.38
19 0.49
20 0.52
21 0.6
22 0.63
23 0.62
24 0.61
25 0.59
26 0.6
27 0.56
28 0.55
29 0.54
30 0.54
31 0.61
32 0.64
33 0.68
34 0.7
35 0.74
36 0.79
37 0.8
38 0.85
39 0.86
40 0.87
41 0.88
42 0.88
43 0.88
44 0.86
45 0.8
46 0.72
47 0.63
48 0.56
49 0.48
50 0.39
51 0.38
52 0.32
53 0.35
54 0.32
55 0.32
56 0.3
57 0.27
58 0.27
59 0.19
60 0.16
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.12
108 0.13
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.24
114 0.29
115 0.32
116 0.36
117 0.38
118 0.38
119 0.37
120 0.34
121 0.3
122 0.26
123 0.19
124 0.16
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.21
135 0.29
136 0.33
137 0.38
138 0.38
139 0.38
140 0.42
141 0.47
142 0.49
143 0.45
144 0.45
145 0.39
146 0.44
147 0.44
148 0.38
149 0.37
150 0.36
151 0.35
152 0.34
153 0.33
154 0.26
155 0.28
156 0.28
157 0.23
158 0.18
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.14
175 0.14
176 0.19
177 0.2
178 0.23
179 0.29
180 0.3
181 0.31
182 0.32
183 0.37
184 0.36
185 0.43
186 0.47
187 0.5
188 0.49
189 0.48
190 0.43
191 0.37
192 0.32
193 0.29
194 0.24
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.14
200 0.12
201 0.08
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.14
228 0.17
229 0.25
230 0.28
231 0.31
232 0.33
233 0.35
234 0.34
235 0.35
236 0.34
237 0.31
238 0.31
239 0.32
240 0.39
241 0.42
242 0.4
243 0.37
244 0.36
245 0.32
246 0.28
247 0.23
248 0.15
249 0.12
250 0.11
251 0.16
252 0.18
253 0.21
254 0.22
255 0.23
256 0.26
257 0.25
258 0.28
259 0.28
260 0.27
261 0.25
262 0.23
263 0.22
264 0.21
265 0.2
266 0.17
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.2
275 0.2
276 0.23
277 0.25
278 0.27
279 0.28
280 0.27
281 0.28
282 0.24
283 0.22
284 0.18
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.12
307 0.11
308 0.13
309 0.12
310 0.15
311 0.2
312 0.22
313 0.21
314 0.22
315 0.25
316 0.25
317 0.3
318 0.29
319 0.25
320 0.23
321 0.23
322 0.23
323 0.19
324 0.17
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.15
340 0.15
341 0.17
342 0.18
343 0.21
344 0.2
345 0.2
346 0.22
347 0.2
348 0.23
349 0.22
350 0.2
351 0.18
352 0.17
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.17
358 0.22
359 0.21
360 0.23
361 0.23
362 0.24
363 0.24
364 0.21
365 0.22
366 0.18
367 0.21
368 0.21
369 0.24
370 0.23
371 0.26
372 0.27
373 0.26
374 0.28
375 0.26
376 0.25
377 0.25
378 0.27
379 0.24
380 0.22
381 0.17
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.14
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.15
391 0.14
392 0.11
393 0.13
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.15
401 0.13
402 0.1
403 0.09
404 0.13
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.17
410 0.16
411 0.15
412 0.11