Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3QHP0

Protein Details
Accession A0A0C3QHP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-283QRSIKKKTKGLDHKIERSKKKAKKVLKPSNGTNKATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-275RSIKKKTKGLDHKIERSKKKAKKVLKP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
Amino Acid Sequences MDQPRQSRGALLINNLPQLQNLVKRDPISYKEEFLQQWNHYDSIRLLFEAKPDDLENAGRFRELHYGTLNTDLKRSLAQNLVLLRNKDIITSIDLLKVLFPLLPRTSSSDLRSFIRTTILTDIKTANARHKAVKLNKAVQVMLFGMVERGMDAEVIGDKGKLRGQVRGEGANKSAGDEAMWAVMVAKELWRKNVWNDPKTVSIVALGCFHPVIKVQSACVHFFLNSEEAAEDSESEDEAPDLGKLAHQRSIKKKTKGLDHKIERSKKKAKKVLKPSNGTNKATPNFPALHLLHDPQSFGEKIFDAINKYDKRYSLDHKILLMQLLSRVMGAHKLTVLSFYPYITKYLTYRQLRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.33
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.28
8 0.29
9 0.3
10 0.34
11 0.35
12 0.39
13 0.4
14 0.41
15 0.4
16 0.39
17 0.38
18 0.36
19 0.41
20 0.39
21 0.38
22 0.41
23 0.36
24 0.39
25 0.39
26 0.37
27 0.31
28 0.32
29 0.28
30 0.26
31 0.25
32 0.2
33 0.19
34 0.19
35 0.22
36 0.24
37 0.23
38 0.2
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.22
43 0.21
44 0.19
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.18
49 0.25
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.25
54 0.25
55 0.33
56 0.35
57 0.27
58 0.27
59 0.25
60 0.23
61 0.24
62 0.24
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.23
67 0.27
68 0.33
69 0.34
70 0.34
71 0.31
72 0.3
73 0.29
74 0.26
75 0.23
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.08
87 0.08
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.2
93 0.24
94 0.27
95 0.3
96 0.29
97 0.3
98 0.31
99 0.33
100 0.28
101 0.25
102 0.25
103 0.21
104 0.19
105 0.23
106 0.23
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.23
112 0.23
113 0.23
114 0.27
115 0.29
116 0.31
117 0.34
118 0.41
119 0.44
120 0.51
121 0.51
122 0.5
123 0.52
124 0.51
125 0.46
126 0.37
127 0.32
128 0.24
129 0.18
130 0.12
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.08
148 0.13
149 0.13
150 0.17
151 0.19
152 0.24
153 0.26
154 0.31
155 0.31
156 0.27
157 0.27
158 0.25
159 0.23
160 0.18
161 0.17
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.1
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.19
180 0.28
181 0.35
182 0.33
183 0.35
184 0.35
185 0.36
186 0.36
187 0.33
188 0.24
189 0.17
190 0.16
191 0.14
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.18
204 0.2
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.06
231 0.1
232 0.12
233 0.18
234 0.21
235 0.29
236 0.38
237 0.49
238 0.56
239 0.59
240 0.62
241 0.63
242 0.7
243 0.74
244 0.73
245 0.73
246 0.73
247 0.76
248 0.81
249 0.85
250 0.8
251 0.79
252 0.8
253 0.77
254 0.79
255 0.78
256 0.79
257 0.8
258 0.85
259 0.87
260 0.86
261 0.85
262 0.83
263 0.85
264 0.83
265 0.76
266 0.69
267 0.66
268 0.58
269 0.53
270 0.46
271 0.39
272 0.33
273 0.3
274 0.33
275 0.25
276 0.28
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.27
281 0.27
282 0.2
283 0.24
284 0.2
285 0.18
286 0.18
287 0.14
288 0.15
289 0.17
290 0.19
291 0.18
292 0.2
293 0.28
294 0.3
295 0.34
296 0.37
297 0.36
298 0.38
299 0.42
300 0.47
301 0.48
302 0.52
303 0.5
304 0.48
305 0.49
306 0.46
307 0.41
308 0.34
309 0.24
310 0.19
311 0.18
312 0.16
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.18
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.21
328 0.21
329 0.23
330 0.21
331 0.23
332 0.21
333 0.29
334 0.39