FuNGI

A0A0C3Q5K0

Protein Details

Accession

A0A0C3Q5K0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-125	KGTNCKYCSRKAYTFRREAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 9, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3

Amino Acid Sequences

MVIVTQVAKCIAQLRLLDHGLIDAAQAVDEIVSSAPGKKLNLNLVDDKDEKGDIAGTGDADAVVRALDKYVAHQLRRASGSRRDDYHDSVVYNTRKAVIKAFLYLKGTNCKYCSRKAYTFRREAFTKIIEYDLPQKAKDVNTLLGAKRPNVLAGPTTQHDESQQDADGDAEMSSESEEGEDIEHSDETDSEEGESAKQSKKSEEIQGAPAIDYRGRVKGPRGRSERLIMAEEARAHIRRLFDNEHTLCGLIFGPHGSLAPIDGLGVSPASADMFFVEVVAIPPSRFRPPAERMGQLMEHPQNTQLSKVLSSTYAVRDTSKQLRELSDKNSKLERIPLPKERDTLIQKLLNQLIQLQVEYNVFVDSSKAPSQNLKGSVLAPGVKNILEKKAGLFRKNMMGKRVNYAARSVISPDVNIESNEIGIPPVFARKLTFPEPVTQHNVHVMRQLVINGPKSYPGANMVQYEDGSIQSLERMSQEQRIALANQLLTPQEGKKAVFAQAHSLSTRTVAVPKKVYRHLQSGDQLILNRQPTLHKPSMMVHTARVLKGEKTIRMHYANCNSYNADFDGDEMNIHFPQTQVSRAEARFIASTDNQYLVPTSGNPLRGLIQDHVVAGVWMTYKETFFTREEYQQLLYGALKPEDSYTGGGRVLT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.29
3	0.3
4	0.29
5	0.24
6	0.23
7	0.18
8	0.16
9	0.13
10	0.08
11	0.07
12	0.06
13	0.06
14	0.06
15	0.05
16	0.05
17	0.06
18	0.04
19	0.06
20	0.07
21	0.1
22	0.12
23	0.15
24	0.17
25	0.2
26	0.26
27	0.32
28	0.37
29	0.4
30	0.43
31	0.44
32	0.48
33	0.46
34	0.42
35	0.36
36	0.31
37	0.25
38	0.2
39	0.17
40	0.12
41	0.12
42	0.11
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.05
53	0.06
54	0.08
55	0.08
56	0.11
57	0.21
58	0.28
59	0.28
60	0.32
61	0.34
62	0.39
63	0.43
64	0.44
65	0.41
66	0.44
67	0.51
68	0.53
69	0.54
70	0.54
71	0.54
72	0.55
73	0.55
74	0.48
75	0.4
76	0.38
77	0.42
78	0.38
79	0.35
80	0.3
81	0.29
82	0.29
83	0.3
84	0.31
85	0.29
86	0.28
87	0.32
88	0.35
89	0.34
90	0.35
91	0.37
92	0.35
93	0.39
94	0.41
95	0.39
96	0.39
97	0.44
98	0.44
99	0.49
100	0.55
101	0.54
102	0.6
103	0.66
104	0.74
105	0.75
106	0.81
107	0.77
108	0.75
109	0.68
110	0.62
111	0.58
112	0.5
113	0.42
114	0.33
115	0.31
116	0.25
117	0.25
118	0.3
119	0.31
120	0.3
121	0.27
122	0.28
123	0.3
124	0.31
125	0.33
126	0.28
127	0.23
128	0.26
129	0.31
130	0.29
131	0.31
132	0.31
133	0.27
134	0.26
135	0.25
136	0.21
137	0.17
138	0.18
139	0.15
140	0.16
141	0.19
142	0.18
143	0.21
144	0.2
145	0.19
146	0.2
147	0.2
148	0.2
149	0.18
150	0.17
151	0.14
152	0.14
153	0.13
154	0.12
155	0.1
156	0.08
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.09
175	0.09
176	0.08
177	0.07
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.11
182	0.12
183	0.15
184	0.19
185	0.2
186	0.22
187	0.26
188	0.3
189	0.35
190	0.37
191	0.36
192	0.35
193	0.36
194	0.34
195	0.3
196	0.27
197	0.21
198	0.16
199	0.15
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.17
204	0.23
205	0.29
206	0.37
207	0.45
208	0.5
209	0.5
210	0.52
211	0.54
212	0.51
213	0.46
214	0.41
215	0.31
216	0.26
217	0.24
218	0.21
219	0.19
220	0.18
221	0.16
222	0.14
223	0.16
224	0.17
225	0.16
226	0.21
227	0.24
228	0.24
229	0.32
230	0.32
231	0.31
232	0.29
233	0.27
234	0.22
235	0.18
236	0.16
237	0.07
238	0.07
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.09
271	0.12
272	0.13
273	0.14
274	0.2
275	0.25
276	0.34
277	0.37
278	0.36
279	0.34
280	0.35
281	0.34
282	0.27
283	0.28
284	0.22
285	0.19
286	0.17
287	0.18
288	0.18
289	0.17
290	0.17
291	0.13
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.09
297	0.1
298	0.11
299	0.11
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.14
304	0.18
305	0.24
306	0.25
307	0.26
308	0.25
309	0.28
310	0.31
311	0.32
312	0.34
313	0.36
314	0.35
315	0.35
316	0.36
317	0.34
318	0.3
319	0.34
320	0.33
321	0.31
322	0.35
323	0.41
324	0.45
325	0.46
326	0.46
327	0.41
328	0.42
329	0.39
330	0.36
331	0.34
332	0.3
333	0.28
334	0.3
335	0.3
336	0.24
337	0.2
338	0.18
339	0.15
340	0.12
341	0.12
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.1
353	0.12
354	0.12
355	0.13
356	0.16
357	0.19
358	0.22
359	0.23
360	0.21
361	0.2
362	0.19
363	0.2
364	0.19
365	0.18
366	0.14
367	0.12
368	0.12
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.21
377	0.25
378	0.25
379	0.26
380	0.26
381	0.33
382	0.4
383	0.4
384	0.39
385	0.41
386	0.4
387	0.42
388	0.46
389	0.4
390	0.34
391	0.33
392	0.29
393	0.23
394	0.22
395	0.2
396	0.17
397	0.15
398	0.14
399	0.14
400	0.13
401	0.13
402	0.13
403	0.12
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.06
409	0.05
410	0.06
411	0.05
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.11
417	0.16
418	0.19
419	0.24
420	0.22
421	0.28
422	0.31
423	0.33
424	0.37
425	0.34
426	0.31
427	0.34
428	0.34
429	0.28
430	0.29
431	0.26
432	0.2
433	0.2
434	0.2
435	0.18
436	0.21
437	0.24
438	0.21
439	0.2
440	0.21
441	0.21
442	0.21
443	0.17
444	0.16
445	0.16
446	0.17
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.17
451	0.17
452	0.14
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.07
460	0.08
461	0.11
462	0.11
463	0.16
464	0.17
465	0.17
466	0.18
467	0.2
468	0.19
469	0.18
470	0.19
471	0.14
472	0.14
473	0.15
474	0.14
475	0.12
476	0.14
477	0.13
478	0.15
479	0.16
480	0.16
481	0.18
482	0.2
483	0.24
484	0.25
485	0.25
486	0.27
487	0.29
488	0.3
489	0.28
490	0.26
491	0.21
492	0.19
493	0.2
494	0.14
495	0.18
496	0.2
497	0.25
498	0.32
499	0.37
500	0.42
501	0.48
502	0.55
503	0.53
504	0.56
505	0.54
506	0.54
507	0.54
508	0.5
509	0.45
510	0.4
511	0.36
512	0.3
513	0.32
514	0.25
515	0.22
516	0.19
517	0.21
518	0.24
519	0.33
520	0.34
521	0.31
522	0.32
523	0.36
524	0.42
525	0.43
526	0.39
527	0.31
528	0.34
529	0.36
530	0.34
531	0.33
532	0.29
533	0.25
534	0.31
535	0.36
536	0.35
537	0.36
538	0.4
539	0.42
540	0.45
541	0.47
542	0.48
543	0.51
544	0.52
545	0.48
546	0.47
547	0.43
548	0.39
549	0.39
550	0.31
551	0.24
552	0.18
553	0.17
554	0.16
555	0.14
556	0.14
557	0.12
558	0.14
559	0.12
560	0.13
561	0.12
562	0.1
563	0.14
564	0.16
565	0.2
566	0.19
567	0.22
568	0.29
569	0.29
570	0.33
571	0.29
572	0.29
573	0.26
574	0.25
575	0.26
576	0.21
577	0.25
578	0.23
579	0.24
580	0.22
581	0.21
582	0.22
583	0.17
584	0.16
585	0.13
586	0.16
587	0.19
588	0.21
589	0.21
590	0.21
591	0.23
592	0.24
593	0.27
594	0.24
595	0.23
596	0.22
597	0.21
598	0.2
599	0.18
600	0.15
601	0.11
602	0.1
603	0.08
604	0.07
605	0.1
606	0.11
607	0.11
608	0.13
609	0.15
610	0.18
611	0.18
612	0.24
613	0.26
614	0.31
615	0.34
616	0.35
617	0.34
618	0.33
619	0.32
620	0.28
621	0.25
622	0.23
623	0.24
624	0.22
625	0.2
626	0.18
627	0.19
628	0.2
629	0.21
630	0.19
631	0.18
632	0.19

A0A0C3Q5K0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer