Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3QUQ9

Protein Details
Accession A0A0C3QUQ9    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-53AVNGSTSSPHKHKKRKERPSDSHLAKESHQHKKKKSKDKHRHAELDVAABasic
56-77VVSHHVSKKKGKRKMEDGESAFHydrophilic
318-349EEELPPPPPPVKKKKKDKKSKGSSGSKPSASRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-46HKHKKRKERPSDSHLAKESHQHKKKKSKDKHRH
63-69KKKGKRK
325-345PPPVKKKKKDKKSKGSSGSKP
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MATTAVNGSTSSPHKHKKRKERPSDSHLAKESHQHKKKKSKDKHRHAELDVAAPEVVSHHVSKKKGKRKMEDGESAFAVVSASIRLSIPPVFAAKPLAGVEEMLDSMVMKHIPSLKGVVLSHSNIQFLDEAAQILNECPFSICNVGFDALVWSPRVGMRLTGQVILFSPDHIALLVNRTFNVSIPARHIPDDEYEFDYQANEVDGPINGVGERNRKVPEEMEGDETLKDSASSQHEPAVDDPQIDAMGRWVKRNTCERVGGPNLMVEFTVVGMILANQMISLIGSLQPDPLDPRHSEVAAPSPGPHPVEPASEFEEEEEELPPPPPPVKKKKKDKKSKGSSGSKPSASRNSDDDLPELPKPRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.63
3 0.72
4 0.79
5 0.86
6 0.9
7 0.93
8 0.94
9 0.93
10 0.92
11 0.92
12 0.86
13 0.84
14 0.78
15 0.69
16 0.59
17 0.59
18 0.59
19 0.6
20 0.63
21 0.63
22 0.68
23 0.76
24 0.85
25 0.87
26 0.88
27 0.89
28 0.91
29 0.94
30 0.95
31 0.94
32 0.92
33 0.84
34 0.81
35 0.72
36 0.66
37 0.55
38 0.45
39 0.35
40 0.26
41 0.23
42 0.15
43 0.15
44 0.1
45 0.11
46 0.16
47 0.22
48 0.27
49 0.37
50 0.47
51 0.55
52 0.62
53 0.71
54 0.74
55 0.78
56 0.83
57 0.82
58 0.81
59 0.75
60 0.69
61 0.6
62 0.5
63 0.4
64 0.3
65 0.21
66 0.11
67 0.08
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.07
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.16
107 0.17
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.15
112 0.16
113 0.14
114 0.11
115 0.12
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.05
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.11
170 0.11
171 0.15
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.16
177 0.17
178 0.19
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.12
186 0.09
187 0.08
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.06
197 0.08
198 0.13
199 0.14
200 0.17
201 0.18
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.23
206 0.22
207 0.23
208 0.23
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.15
214 0.11
215 0.09
216 0.06
217 0.1
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.18
227 0.16
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.14
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.24
239 0.3
240 0.38
241 0.41
242 0.4
243 0.43
244 0.42
245 0.46
246 0.47
247 0.43
248 0.35
249 0.31
250 0.26
251 0.22
252 0.2
253 0.12
254 0.08
255 0.06
256 0.06
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.12
277 0.14
278 0.17
279 0.17
280 0.21
281 0.24
282 0.24
283 0.24
284 0.22
285 0.26
286 0.25
287 0.24
288 0.21
289 0.19
290 0.22
291 0.25
292 0.23
293 0.2
294 0.2
295 0.23
296 0.23
297 0.25
298 0.26
299 0.24
300 0.24
301 0.21
302 0.21
303 0.18
304 0.17
305 0.15
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.17
312 0.24
313 0.33
314 0.44
315 0.54
316 0.64
317 0.75
318 0.83
319 0.9
320 0.94
321 0.95
322 0.95
323 0.95
324 0.96
325 0.95
326 0.94
327 0.92
328 0.91
329 0.87
330 0.82
331 0.75
332 0.72
333 0.7
334 0.64
335 0.59
336 0.53
337 0.5
338 0.49
339 0.47
340 0.41
341 0.35
342 0.35
343 0.36