Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3QBJ3

Protein Details
Accession A0A0C3QBJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-352KIDREEESRVRRRRKERDENEASABasic
374-395DGDDDKKGKKLKKKQDGPGVLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-343RRRRK
379-388KKGKKLKKKQ
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MATQKPKKARADTAASTGLALPSAQPATATTPTTTPYQAAVPAIDPNLPAASTPTANRTVQAATGYLNTPGVPATPLATQAYYNYYPQYYSQGYGQGMPYYTAQTAYGTGYGPQAYGALGTPTTATHPYTPTAAAPSVAVAASTATVGTPAAQRLIPPTAPATSKPSPAAPAAPSLDTASVAQLTDALGSAGVDIRAEEEAMTRDTKAQLSTSIAPSEDRSKKQNFLDPVVLAARVKEITKNHSVTATADAQTYIALALQFRLTTLIKQSIAAVDHRLESQYNRPPPLYPIDDNIMQVEGEDAVKPEPQPMWSVLVRRDVSKQLAALEKIDREEESRVRRRRKERDENEASANGGGISGVGGGDAMDLDGVGGDGDDDKKGKKLKKKQDGPGVLAKKMTEDMQKSVSNRVANEFTGVKKYSWMQPGAATATTPVKKPAPIATNTTGGGAATSSSTPTAVGGATAGSSFVRPFLAGGRSAVNETLEERKVTLGDLMFVVGKEKGHGAGRGSAKTWGVGGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.51
3 0.45
4 0.37
5 0.28
6 0.2
7 0.16
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.17
15 0.2
16 0.22
17 0.19
18 0.2
19 0.22
20 0.25
21 0.24
22 0.2
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.14
39 0.15
40 0.17
41 0.2
42 0.24
43 0.24
44 0.25
45 0.24
46 0.22
47 0.22
48 0.22
49 0.18
50 0.14
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.19
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.25
76 0.2
77 0.2
78 0.21
79 0.23
80 0.23
81 0.25
82 0.25
83 0.21
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.09
111 0.1
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.12
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.19
149 0.24
150 0.23
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.24
155 0.24
156 0.25
157 0.18
158 0.2
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.23
205 0.25
206 0.25
207 0.29
208 0.31
209 0.36
210 0.38
211 0.43
212 0.37
213 0.36
214 0.36
215 0.31
216 0.29
217 0.24
218 0.22
219 0.16
220 0.13
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.16
227 0.22
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.23
232 0.2
233 0.23
234 0.2
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.09
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.17
268 0.23
269 0.26
270 0.27
271 0.27
272 0.27
273 0.29
274 0.33
275 0.31
276 0.24
277 0.23
278 0.24
279 0.24
280 0.24
281 0.22
282 0.17
283 0.12
284 0.1
285 0.08
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.12
298 0.15
299 0.16
300 0.19
301 0.19
302 0.26
303 0.26
304 0.26
305 0.28
306 0.27
307 0.28
308 0.26
309 0.24
310 0.2
311 0.22
312 0.22
313 0.21
314 0.19
315 0.18
316 0.17
317 0.18
318 0.15
319 0.13
320 0.17
321 0.21
322 0.28
323 0.36
324 0.44
325 0.53
326 0.62
327 0.7
328 0.77
329 0.82
330 0.84
331 0.82
332 0.85
333 0.83
334 0.78
335 0.72
336 0.62
337 0.51
338 0.4
339 0.32
340 0.21
341 0.13
342 0.09
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.03
362 0.04
363 0.05
364 0.07
365 0.08
366 0.13
367 0.2
368 0.27
369 0.36
370 0.46
371 0.57
372 0.67
373 0.76
374 0.81
375 0.85
376 0.84
377 0.79
378 0.78
379 0.71
380 0.61
381 0.52
382 0.43
383 0.34
384 0.29
385 0.27
386 0.23
387 0.22
388 0.24
389 0.27
390 0.31
391 0.31
392 0.35
393 0.37
394 0.33
395 0.31
396 0.33
397 0.3
398 0.27
399 0.29
400 0.25
401 0.22
402 0.26
403 0.26
404 0.22
405 0.22
406 0.25
407 0.29
408 0.33
409 0.33
410 0.29
411 0.29
412 0.32
413 0.31
414 0.28
415 0.21
416 0.17
417 0.23
418 0.23
419 0.22
420 0.24
421 0.24
422 0.25
423 0.27
424 0.33
425 0.32
426 0.34
427 0.4
428 0.39
429 0.4
430 0.39
431 0.37
432 0.29
433 0.23
434 0.19
435 0.12
436 0.09
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.12
460 0.15
461 0.15
462 0.17
463 0.19
464 0.2
465 0.21
466 0.21
467 0.18
468 0.16
469 0.17
470 0.22
471 0.21
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.2
476 0.2
477 0.21
478 0.15
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.15
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.15
490 0.18
491 0.21
492 0.22
493 0.29
494 0.34
495 0.35
496 0.35
497 0.36
498 0.33
499 0.3