FuNGI

A0A0C3LAX5

Protein Details

Accession

A0A0C3LAX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-66	KEDGTAKPRPPPPAKKPKPKAPSVPANQQPD	Hydrophilic
585-607	NAATADAKKNKKRKEVPGASDAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
41-56	AKPRPPPPAKKPKPKA
186-216	AKEKAAAAAANAKGKGKATDAPGKGKKSQPK
592-624	KKNKKRKEVPGASDATKSPTAAAPGGGVAKKKK

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 12.666, nucl 9.5, cyto_mito 9.499, mito_nucl 7.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAVLSAGAIAAMASANKKGKAVKFQKVQNGQVYALKEDGTAKPRPPPPAKKPKPKAPSVPANQQPDSSADPSDPDNKPPPTFAIVSSDPANWRFNVGAFHPQQRIPNPENPDEVVVPSIQIQDFHQPIKMNRKQPKSMLYAEPEPTEIKDQQFKPMLGPDGKPVYHNGQVVMVNAEGQTLASLAKAKEKAAAAAANAKGKGKATDAPGKGKKSQPKTRQVFIQSDHVRARRKEEYHPWVMEDTSGDQKWIGTMDDKNDGNLWGLLKVSGGCFEFIPIHRFYTFKPQAQIVANVRADDIEKQATSKKPDFSQVYRARMGNSSSSDVVARLEKQEKKEQKQATRRPPKEEDDLFMDGGEGDIDEFEYEKEASDDEEANRPEEIAEDEDEKDSKERLKREYLGDTNVGRATESDDEAEELDQMLMKALKKSGDMDEDDEEDDVYGSRYGVKKEEDEDTPMVIATGVQQQTPKPKAPTPTPAAKPLVASGSSMDLDAPATASPVKASGSLMDFTPAAPRVISRGGSPAASTGVGAALLAKRATSPKPTGPGRGGSPQAGRAGSPLAASAARAASPATAAAATAPVAPANAATADAKKNKKRKEVPGASDATKSPTAAAPGGGVAKKKKLDEGARPEPPSMKNVVEVLKANGGVTGYVSAKTLASHYQTKHNPEYKKNLIQLLKQVANITQDADGVQRIQLKAEYV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.16
3	0.17
4	0.2
5	0.27
6	0.33
7	0.43
8	0.51
9	0.56
10	0.61
11	0.68
12	0.75
13	0.77
14	0.77
15	0.74
16	0.68
17	0.6
18	0.56
19	0.51
20	0.42
21	0.35
22	0.28
23	0.22
24	0.22
25	0.26
26	0.26
27	0.29
28	0.29
29	0.37
30	0.42
31	0.52
32	0.58
33	0.63
34	0.69
35	0.75
36	0.84
37	0.86
38	0.91
39	0.92
40	0.91
41	0.9
42	0.89
43	0.87
44	0.87
45	0.84
46	0.84
47	0.81
48	0.8
49	0.72
50	0.62
51	0.54
52	0.46
53	0.44
54	0.35
55	0.28
56	0.21
57	0.21
58	0.23
59	0.3
60	0.28
61	0.29
62	0.35
63	0.38
64	0.39
65	0.4
66	0.4
67	0.37
68	0.36
69	0.32
70	0.31
71	0.28
72	0.3
73	0.29
74	0.28
75	0.26
76	0.28
77	0.29
78	0.21
79	0.22
80	0.2
81	0.19
82	0.2
83	0.2
84	0.27
85	0.28
86	0.34
87	0.36
88	0.38
89	0.42
90	0.44
91	0.49
92	0.45
93	0.49
94	0.5
95	0.5
96	0.5
97	0.46
98	0.43
99	0.36
100	0.31
101	0.25
102	0.19
103	0.15
104	0.14
105	0.15
106	0.12
107	0.12
108	0.13
109	0.19
110	0.21
111	0.22
112	0.24
113	0.25
114	0.3
115	0.4
116	0.46
117	0.49
118	0.55
119	0.63
120	0.66
121	0.68
122	0.7
123	0.66
124	0.64
125	0.6
126	0.57
127	0.55
128	0.51
129	0.45
130	0.39
131	0.34
132	0.3
133	0.28
134	0.25
135	0.24
136	0.3
137	0.3
138	0.36
139	0.4
140	0.39
141	0.36
142	0.38
143	0.4
144	0.34
145	0.34
146	0.32
147	0.32
148	0.32
149	0.31
150	0.3
151	0.29
152	0.3
153	0.3
154	0.25
155	0.24
156	0.24
157	0.24
158	0.22
159	0.16
160	0.12
161	0.11
162	0.11
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.07
170	0.08
171	0.14
172	0.15
173	0.16
174	0.2
175	0.2
176	0.2
177	0.2
178	0.21
179	0.16
180	0.21
181	0.23
182	0.21
183	0.22
184	0.21
185	0.2
186	0.2
187	0.2
188	0.17
189	0.19
190	0.21
191	0.3
192	0.32
193	0.4
194	0.45
195	0.48
196	0.5
197	0.53
198	0.56
199	0.57
200	0.65
201	0.66
202	0.71
203	0.73
204	0.72
205	0.73
206	0.69
207	0.64
208	0.56
209	0.57
210	0.48
211	0.47
212	0.48
213	0.46
214	0.47
215	0.43
216	0.47
217	0.45
218	0.46
219	0.49
220	0.53
221	0.56
222	0.56
223	0.56
224	0.51
225	0.44
226	0.4
227	0.33
228	0.24
229	0.19
230	0.17
231	0.16
232	0.14
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.11
238	0.09
239	0.1
240	0.13
241	0.18
242	0.18
243	0.18
244	0.18
245	0.18
246	0.16
247	0.15
248	0.13
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.08
260	0.1
261	0.11
262	0.15
263	0.14
264	0.15
265	0.15
266	0.16
267	0.16
268	0.25
269	0.29
270	0.28
271	0.29
272	0.28
273	0.32
274	0.32
275	0.37
276	0.28
277	0.3
278	0.28
279	0.26
280	0.25
281	0.21
282	0.2
283	0.16
284	0.15
285	0.09
286	0.09
287	0.1
288	0.15
289	0.18
290	0.23
291	0.26
292	0.27
293	0.27
294	0.34
295	0.38
296	0.36
297	0.43
298	0.44
299	0.45
300	0.44
301	0.43
302	0.38
303	0.35
304	0.34
305	0.26
306	0.22
307	0.19
308	0.17
309	0.17
310	0.15
311	0.14
312	0.13
313	0.11
314	0.1
315	0.11
316	0.18
317	0.2
318	0.24
319	0.33
320	0.4
321	0.44
322	0.52
323	0.56
324	0.58
325	0.66
326	0.71
327	0.73
328	0.77
329	0.75
330	0.73
331	0.72
332	0.67
333	0.64
334	0.55
335	0.46
336	0.4
337	0.38
338	0.31
339	0.25
340	0.21
341	0.13
342	0.12
343	0.09
344	0.04
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.14
361	0.14
362	0.15
363	0.14
364	0.14
365	0.12
366	0.11
367	0.11
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.14
378	0.17
379	0.21
380	0.25
381	0.31
382	0.34
383	0.36
384	0.42
385	0.4
386	0.38
387	0.37
388	0.33
389	0.29
390	0.26
391	0.22
392	0.15
393	0.13
394	0.13
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.1
401	0.1
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.13
415	0.15
416	0.16
417	0.17
418	0.19
419	0.19
420	0.19
421	0.19
422	0.16
423	0.14
424	0.1
425	0.09
426	0.07
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.08
431	0.1
432	0.12
433	0.15
434	0.16
435	0.17
436	0.19
437	0.23
438	0.21
439	0.23
440	0.23
441	0.2
442	0.18
443	0.17
444	0.14
445	0.1
446	0.09
447	0.06
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.13
452	0.15
453	0.23
454	0.27
455	0.31
456	0.29
457	0.32
458	0.37
459	0.42
460	0.48
461	0.46
462	0.51
463	0.49
464	0.51
465	0.5
466	0.45
467	0.4
468	0.33
469	0.29
470	0.21
471	0.18
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.11
476	0.1
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.08
491	0.1
492	0.11
493	0.11
494	0.11
495	0.11
496	0.1
497	0.13
498	0.13
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.12
503	0.15
504	0.16
505	0.13
506	0.16
507	0.16
508	0.17
509	0.17
510	0.14
511	0.13
512	0.12
513	0.11
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.05
518	0.06
519	0.05
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.12
525	0.15
526	0.2
527	0.24
528	0.28
529	0.37
530	0.39
531	0.44
532	0.43
533	0.44
534	0.42
535	0.43
536	0.4
537	0.36
538	0.35
539	0.32
540	0.32
541	0.28
542	0.24
543	0.2
544	0.19
545	0.16
546	0.14
547	0.11
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.06
569	0.06
570	0.05
571	0.06
572	0.05
573	0.06
574	0.07
575	0.11
576	0.17
577	0.25
578	0.34
579	0.42
580	0.51
581	0.58
582	0.68
583	0.74
584	0.79
585	0.83
586	0.84
587	0.82
588	0.82
589	0.79
590	0.7
591	0.63
592	0.53
593	0.47
594	0.38
595	0.31
596	0.24
597	0.2
598	0.21
599	0.18
600	0.18
601	0.13
602	0.13
603	0.18
604	0.18
605	0.2
606	0.21
607	0.27
608	0.31
609	0.32
610	0.36
611	0.4
612	0.47
613	0.53
614	0.59
615	0.63
616	0.67
617	0.67
618	0.64
619	0.61
620	0.54
621	0.48
622	0.42
623	0.34
624	0.29
625	0.3
626	0.31
627	0.29
628	0.29
629	0.28
630	0.27
631	0.26
632	0.23
633	0.21
634	0.18
635	0.14
636	0.13
637	0.13
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.11
642	0.11
643	0.12
644	0.13
645	0.15
646	0.2
647	0.26
648	0.28
649	0.38
650	0.44
651	0.51
652	0.59
653	0.62
654	0.65
655	0.66
656	0.74
657	0.73
658	0.75
659	0.73
660	0.71
661	0.69
662	0.66
663	0.66
664	0.65
665	0.59
666	0.52
667	0.48
668	0.42
669	0.4
670	0.35
671	0.28
672	0.2
673	0.17
674	0.16
675	0.16
676	0.15
677	0.13
678	0.15
679	0.19
680	0.18
681	0.2

A0A0C3LAX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer