Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PPD4

Protein Details
Accession A0A0C3PPD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-441APTTSSAPSKGKKNKKEKRSEAKAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-168K
425-440SKGKKNKKEKRSEAKA
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.833, cyto 8.5, cyto_mito 8.166, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
IPR047151  RNZ2-like  
IPR027794  tRNase_Z_dom  
Gene Ontology GO:0042781  F:3'-tRNA processing endoribonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12706  Lactamase_B_2  
PF13691  Lactamase_B_4  
Amino Acid Sequences MQWSLRVITGLTADTEPSLILKFESPPAKYIFNVPEGTNRACIQKRYGIAKTKAAFLTRLHPEQIGGFPGLVMMLADINSRDLAVCGPAGLTHYVASTRFYARRTAFGVNVNEYKHHDMPPAGNATPATLPPPIFKDENIVVHSIALYPSAVDDDGSTGSPSGSSKRKRSSSATPPPSAKRRSTEASPVPTQFLEADVPLPSYLSELNDVVDFGFHDRRHISIVDADDVYYLKSSGGPAMLKATLGLESIQTVDVEHRTQCYGLVLRHKDEWSMVYSGDTMPCNRLVEAGQDATVLIHEATMADDQVDLAFAKAHSTAGQAIDVGRRMNAKNILLTHFSQRYPKMPELQAPDLANESLISPSEEPRAPVAIAFDCATMKLGSLWKLEKYMGAMAQTFEKEPGDDASDGAAPLDDAEAPTTSSAPSKGKKNKKEKRSEAKAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.08
7 0.09
8 0.11
9 0.13
10 0.19
11 0.26
12 0.26
13 0.29
14 0.32
15 0.33
16 0.32
17 0.37
18 0.35
19 0.34
20 0.35
21 0.33
22 0.36
23 0.39
24 0.41
25 0.37
26 0.34
27 0.37
28 0.38
29 0.4
30 0.38
31 0.4
32 0.44
33 0.48
34 0.54
35 0.56
36 0.57
37 0.62
38 0.58
39 0.57
40 0.54
41 0.49
42 0.44
43 0.36
44 0.4
45 0.38
46 0.39
47 0.35
48 0.32
49 0.31
50 0.3
51 0.3
52 0.24
53 0.18
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.06
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.17
86 0.19
87 0.2
88 0.27
89 0.28
90 0.31
91 0.33
92 0.34
93 0.32
94 0.35
95 0.37
96 0.34
97 0.36
98 0.33
99 0.31
100 0.32
101 0.35
102 0.31
103 0.29
104 0.27
105 0.25
106 0.26
107 0.29
108 0.3
109 0.24
110 0.22
111 0.2
112 0.2
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.16
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.21
124 0.22
125 0.25
126 0.24
127 0.22
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.13
132 0.1
133 0.07
134 0.06
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.11
150 0.18
151 0.24
152 0.32
153 0.4
154 0.44
155 0.48
156 0.53
157 0.58
158 0.61
159 0.65
160 0.65
161 0.61
162 0.61
163 0.63
164 0.65
165 0.61
166 0.53
167 0.46
168 0.45
169 0.45
170 0.43
171 0.46
172 0.44
173 0.44
174 0.43
175 0.4
176 0.37
177 0.32
178 0.29
179 0.21
180 0.16
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.22
252 0.23
253 0.25
254 0.28
255 0.28
256 0.26
257 0.24
258 0.23
259 0.17
260 0.16
261 0.14
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.12
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.14
276 0.13
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.14
314 0.15
315 0.2
316 0.23
317 0.23
318 0.25
319 0.27
320 0.29
321 0.29
322 0.3
323 0.31
324 0.3
325 0.31
326 0.33
327 0.33
328 0.36
329 0.39
330 0.41
331 0.42
332 0.41
333 0.46
334 0.48
335 0.49
336 0.47
337 0.41
338 0.38
339 0.32
340 0.3
341 0.24
342 0.16
343 0.13
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.11
349 0.16
350 0.17
351 0.17
352 0.18
353 0.2
354 0.18
355 0.18
356 0.19
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.14
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.11
365 0.1
366 0.11
367 0.14
368 0.16
369 0.2
370 0.23
371 0.23
372 0.25
373 0.25
374 0.24
375 0.23
376 0.23
377 0.21
378 0.2
379 0.2
380 0.19
381 0.22
382 0.22
383 0.2
384 0.18
385 0.17
386 0.15
387 0.16
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.16
395 0.14
396 0.12
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.16
410 0.21
411 0.27
412 0.37
413 0.47
414 0.57
415 0.67
416 0.76
417 0.82
418 0.86
419 0.92
420 0.93
421 0.93