Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PRE3

Protein Details
Accession A0A0C3PRE3    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57AEENYAKRREQERKEKETNAHydrophilic
88-112DDAKAWIKRSKKKEKELAVKRQAELHydrophilic
266-293VEGEKGFKKPKTKKKKSSRRMPADAELGBasic
330-354LQAALSRARRQKVKRTKVSPEEIAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-102KRSKKKEK
270-285KGFKKPKTKKKKSSRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADAESISLEETNKIRISLGLKPLTDDKAPANSSEKTAEENYAKRREQERKEKETNAVAARIAKARNKLELNRRLVGTTLGEAEDTLDDAKAWIKRSKKKEKELAVKRQAELDSRDALDAEGYTEKDLEGLKVSHDFEDLAEGEARILTLKDSRILDNEEDELHNVNMAEVEKDKKRHELKTKRRDYTGYDDDEFAAGGDGLKRSVLAKYDEDLHGAPEKGFRLGSGIPQGRQTAKDVHEQQAAAVNKSLLSIDYAKNQEISDYAVEGEKGFKKPKTKKKKSSRRMPADAELGGGGEDVKPDVGMQVDVLQAQAPRQRDLDANFIDDDDLQAALSRARRQKVKRTKVSPEEIAAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.21
4 0.24
5 0.27
6 0.35
7 0.36
8 0.35
9 0.37
10 0.41
11 0.41
12 0.38
13 0.33
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.31
18 0.32
19 0.29
20 0.31
21 0.32
22 0.3
23 0.26
24 0.27
25 0.3
26 0.31
27 0.36
28 0.41
29 0.47
30 0.47
31 0.5
32 0.57
33 0.62
34 0.67
35 0.72
36 0.74
37 0.75
38 0.81
39 0.78
40 0.74
41 0.7
42 0.66
43 0.58
44 0.5
45 0.41
46 0.36
47 0.34
48 0.33
49 0.31
50 0.29
51 0.33
52 0.34
53 0.4
54 0.43
55 0.49
56 0.55
57 0.6
58 0.62
59 0.59
60 0.57
61 0.5
62 0.45
63 0.39
64 0.3
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.06
77 0.1
78 0.12
79 0.15
80 0.2
81 0.28
82 0.37
83 0.48
84 0.59
85 0.65
86 0.72
87 0.78
88 0.83
89 0.86
90 0.87
91 0.88
92 0.86
93 0.8
94 0.71
95 0.66
96 0.57
97 0.5
98 0.43
99 0.35
100 0.28
101 0.24
102 0.24
103 0.19
104 0.18
105 0.14
106 0.11
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.14
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.1
159 0.13
160 0.16
161 0.17
162 0.24
163 0.29
164 0.37
165 0.46
166 0.54
167 0.63
168 0.7
169 0.79
170 0.74
171 0.71
172 0.66
173 0.6
174 0.58
175 0.53
176 0.45
177 0.37
178 0.34
179 0.32
180 0.29
181 0.24
182 0.15
183 0.09
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.04
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.19
214 0.21
215 0.2
216 0.23
217 0.25
218 0.23
219 0.24
220 0.24
221 0.22
222 0.22
223 0.3
224 0.32
225 0.34
226 0.35
227 0.34
228 0.32
229 0.33
230 0.32
231 0.24
232 0.22
233 0.18
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.07
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.18
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.18
247 0.16
248 0.17
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.14
256 0.15
257 0.19
258 0.23
259 0.27
260 0.37
261 0.47
262 0.58
263 0.65
264 0.73
265 0.79
266 0.86
267 0.93
268 0.94
269 0.95
270 0.95
271 0.94
272 0.91
273 0.86
274 0.8
275 0.73
276 0.62
277 0.52
278 0.4
279 0.3
280 0.21
281 0.15
282 0.1
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.13
300 0.17
301 0.17
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.26
306 0.28
307 0.34
308 0.31
309 0.31
310 0.29
311 0.28
312 0.27
313 0.22
314 0.2
315 0.12
316 0.1
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.15
322 0.22
323 0.29
324 0.36
325 0.46
326 0.53
327 0.63
328 0.72
329 0.78
330 0.81
331 0.83
332 0.87
333 0.87
334 0.88
335 0.82