Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3IVU6

Protein Details
Accession A0A0C3IVU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-295NSNLSKPKPSKLRKDGKLTPEECHydrophilic
308-334GSPGHFAEKCPKKTRKAKARAMATTEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-323RK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 15, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTAGISGCPSSHEGYGNDDDNNPDDDDPSNGPGDDGPSDDNLEENDLEDELDFPDPDTKPTITVLDNLTEAIKLLAHNAHTSPESSGWTKLHEPNTFDGTDPKKLHAFFIQCELNFQDQPQAFRTNHAKVIFMQSYLKGMALEWFKPDLLRLNDPDDQPLWMDSWREFVLELQTTFGPPDPVADPKNWIKGEVCRVGKPQTLHKLHHLAQEIDVCYWEHKEEVQRASKHQGSSNSSNNKSTGSGNNNQAKTSNNNNSGSSPKPASSKLGNNNNSNLSKPKPSKLRKDGKLTPEECKHRIEGNLCMFCGSPGHFAEKCPKKTRKAKARAMATTEATLASGLGSTPETKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.3
4 0.28
5 0.27
6 0.27
7 0.26
8 0.27
9 0.23
10 0.18
11 0.17
12 0.17
13 0.19
14 0.19
15 0.19
16 0.18
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.12
29 0.14
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.14
42 0.14
43 0.16
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.2
48 0.22
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.13
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.06
61 0.08
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.13
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.17
72 0.17
73 0.2
74 0.18
75 0.21
76 0.25
77 0.29
78 0.35
79 0.35
80 0.36
81 0.36
82 0.4
83 0.36
84 0.32
85 0.33
86 0.3
87 0.34
88 0.32
89 0.31
90 0.31
91 0.31
92 0.33
93 0.32
94 0.31
95 0.24
96 0.29
97 0.3
98 0.26
99 0.27
100 0.28
101 0.25
102 0.22
103 0.21
104 0.22
105 0.2
106 0.22
107 0.23
108 0.26
109 0.23
110 0.28
111 0.33
112 0.3
113 0.34
114 0.32
115 0.3
116 0.26
117 0.33
118 0.29
119 0.24
120 0.22
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.09
126 0.08
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.15
136 0.17
137 0.19
138 0.19
139 0.23
140 0.27
141 0.27
142 0.28
143 0.22
144 0.19
145 0.17
146 0.15
147 0.11
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.07
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.16
172 0.17
173 0.24
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.24
178 0.3
179 0.33
180 0.33
181 0.28
182 0.3
183 0.32
184 0.34
185 0.32
186 0.33
187 0.36
188 0.38
189 0.38
190 0.41
191 0.44
192 0.43
193 0.47
194 0.42
195 0.33
196 0.3
197 0.32
198 0.28
199 0.21
200 0.2
201 0.15
202 0.12
203 0.13
204 0.11
205 0.08
206 0.09
207 0.14
208 0.19
209 0.24
210 0.31
211 0.32
212 0.35
213 0.41
214 0.43
215 0.4
216 0.39
217 0.4
218 0.39
219 0.43
220 0.49
221 0.5
222 0.49
223 0.48
224 0.45
225 0.4
226 0.34
227 0.31
228 0.3
229 0.28
230 0.32
231 0.39
232 0.46
233 0.45
234 0.44
235 0.42
236 0.38
237 0.36
238 0.4
239 0.4
240 0.38
241 0.4
242 0.41
243 0.42
244 0.43
245 0.4
246 0.36
247 0.29
248 0.25
249 0.26
250 0.27
251 0.29
252 0.31
253 0.37
254 0.42
255 0.5
256 0.54
257 0.54
258 0.56
259 0.58
260 0.54
261 0.48
262 0.43
263 0.37
264 0.4
265 0.41
266 0.46
267 0.5
268 0.58
269 0.66
270 0.73
271 0.79
272 0.78
273 0.83
274 0.84
275 0.82
276 0.83
277 0.75
278 0.73
279 0.72
280 0.71
281 0.63
282 0.58
283 0.52
284 0.46
285 0.49
286 0.43
287 0.43
288 0.45
289 0.45
290 0.42
291 0.4
292 0.36
293 0.3
294 0.29
295 0.23
296 0.18
297 0.16
298 0.23
299 0.23
300 0.25
301 0.35
302 0.43
303 0.49
304 0.55
305 0.61
306 0.65
307 0.75
308 0.84
309 0.85
310 0.86
311 0.87
312 0.87
313 0.89
314 0.85
315 0.81
316 0.76
317 0.67
318 0.58
319 0.48
320 0.38
321 0.28
322 0.21
323 0.15
324 0.09
325 0.07
326 0.05
327 0.06
328 0.07