Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3IGE3

Protein Details
Accession A0A0C3IGE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-81EYDRCQTRMKRGNSRNSRNSHydrophilic
85-105AYSAKDRKKSTCKNCGKKGHVHydrophilic
119-138QVPKWFQNKGKGKKKEKGSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-139WFQNKGKGKKKEKGSGK
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto_nucl 8.166, mito_nucl 8.166, cyto_mito 6.666, mito 6, cyto 6, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MHTLCKQLATLGQSITDDDFTAIILSSLPTSYDSNLAAMTSSALVMQKDLSLDLIIKVISDEYDRCQTRMKRGNSRNSRNSEDAAYSAKDRKKSTCKNCGKKGHVQDQCWEEGGRKAGQVPKWFQNKGKGKKKEKGSGKEATVAKDTYMNTFNHALLTGESLNSAEETILFDSGASCHMSSYCSKFLDYKPIIPKPITAANNHTFHAIGKGDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.16
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.08
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.1
25 0.09
26 0.08
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.1
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.28
54 0.3
55 0.39
56 0.47
57 0.51
58 0.54
59 0.61
60 0.71
61 0.74
62 0.81
63 0.79
64 0.76
65 0.74
66 0.66
67 0.59
68 0.5
69 0.4
70 0.32
71 0.25
72 0.2
73 0.17
74 0.21
75 0.22
76 0.25
77 0.26
78 0.32
79 0.4
80 0.49
81 0.56
82 0.61
83 0.69
84 0.73
85 0.81
86 0.83
87 0.78
88 0.77
89 0.75
90 0.74
91 0.69
92 0.61
93 0.56
94 0.49
95 0.44
96 0.37
97 0.3
98 0.21
99 0.17
100 0.18
101 0.14
102 0.12
103 0.14
104 0.17
105 0.2
106 0.24
107 0.26
108 0.31
109 0.38
110 0.4
111 0.4
112 0.46
113 0.53
114 0.58
115 0.65
116 0.67
117 0.69
118 0.75
119 0.8
120 0.79
121 0.79
122 0.76
123 0.73
124 0.69
125 0.62
126 0.62
127 0.55
128 0.48
129 0.41
130 0.34
131 0.27
132 0.25
133 0.23
134 0.19
135 0.21
136 0.19
137 0.19
138 0.21
139 0.21
140 0.17
141 0.17
142 0.14
143 0.11
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.11
167 0.14
168 0.19
169 0.22
170 0.22
171 0.23
172 0.27
173 0.3
174 0.38
175 0.38
176 0.41
177 0.45
178 0.5
179 0.53
180 0.49
181 0.48
182 0.43
183 0.49
184 0.43
185 0.38
186 0.41
187 0.44
188 0.46
189 0.44
190 0.4
191 0.32
192 0.29
193 0.31