Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3JIS5

Protein Details
Accession A0A0C3JIS5    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-68LERQRNEEMKRKKQEECLRKEREEQDKLRKKHFEEEKKQQELBasic
450-469ALLEEKRHEEEKRRRKREKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-388K
455-469KRHEEEKRRRKREKE
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MTRWETLMALSASQTKEAQSAAQTALLERQRNEEMKRKKQEECLRKEREEQDKLRKKHFEEEKKQQELEAKRAADLARLGAEAARREEEARNALLYGPKKTKWPTSNGTAKDEIRKRRLPSDDEGNSRSGSPAMALTREEKRQRRLEAEMRRSYSAKRSSTTAGYRKAGRPLPGGAIDATSAPSADSGSSAQSVKERLASLPNTLTKLNVNKRDTRTIDEILQDRAKAKHSVLDGDEAREFNDWFGKSKKMEHVPGSSQSSSGQGSGLASGAASPLPSSAKSTSQPTSKASTTSKVATVPSAGKSASSGAQPRAVIPAKTGVSAAKSARDDIRGASSPGAKPAHLKGSSTSIKPQPPKSMSASRPVTTPVLPKKRTQSSSRSASPPPKRRAESPADAIRSEIWKLFGRDRAAYVTRDIDSDDDDMEADASAVMKEELRSSRLAKREDDVALLEEKRHEEEKRRRKREKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.17
3 0.18
4 0.19
5 0.19
6 0.16
7 0.19
8 0.18
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.25
13 0.29
14 0.3
15 0.28
16 0.32
17 0.36
18 0.42
19 0.47
20 0.49
21 0.54
22 0.61
23 0.71
24 0.71
25 0.71
26 0.76
27 0.81
28 0.81
29 0.81
30 0.81
31 0.79
32 0.77
33 0.8
34 0.78
35 0.78
36 0.77
37 0.76
38 0.76
39 0.78
40 0.79
41 0.8
42 0.78
43 0.72
44 0.72
45 0.74
46 0.74
47 0.74
48 0.8
49 0.81
50 0.79
51 0.75
52 0.68
53 0.65
54 0.59
55 0.56
56 0.53
57 0.43
58 0.37
59 0.4
60 0.38
61 0.32
62 0.28
63 0.22
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.16
69 0.15
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.19
74 0.21
75 0.24
76 0.25
77 0.23
78 0.21
79 0.2
80 0.21
81 0.24
82 0.24
83 0.26
84 0.28
85 0.28
86 0.34
87 0.38
88 0.46
89 0.46
90 0.51
91 0.5
92 0.54
93 0.62
94 0.59
95 0.61
96 0.56
97 0.53
98 0.55
99 0.57
100 0.56
101 0.56
102 0.59
103 0.57
104 0.6
105 0.64
106 0.6
107 0.58
108 0.6
109 0.58
110 0.57
111 0.55
112 0.48
113 0.42
114 0.37
115 0.32
116 0.22
117 0.15
118 0.1
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.15
124 0.19
125 0.26
126 0.34
127 0.38
128 0.45
129 0.51
130 0.54
131 0.55
132 0.59
133 0.61
134 0.63
135 0.66
136 0.65
137 0.61
138 0.59
139 0.56
140 0.5
141 0.49
142 0.47
143 0.4
144 0.35
145 0.35
146 0.36
147 0.4
148 0.46
149 0.44
150 0.41
151 0.41
152 0.44
153 0.44
154 0.48
155 0.45
156 0.4
157 0.36
158 0.32
159 0.32
160 0.28
161 0.26
162 0.2
163 0.16
164 0.14
165 0.11
166 0.1
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.2
189 0.21
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.18
194 0.25
195 0.3
196 0.35
197 0.37
198 0.42
199 0.46
200 0.53
201 0.52
202 0.49
203 0.46
204 0.39
205 0.38
206 0.34
207 0.32
208 0.27
209 0.26
210 0.21
211 0.19
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.18
219 0.17
220 0.2
221 0.18
222 0.18
223 0.19
224 0.15
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.08
229 0.12
230 0.11
231 0.12
232 0.14
233 0.17
234 0.18
235 0.21
236 0.27
237 0.28
238 0.32
239 0.34
240 0.36
241 0.35
242 0.38
243 0.39
244 0.33
245 0.28
246 0.24
247 0.22
248 0.18
249 0.16
250 0.11
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.08
266 0.1
267 0.13
268 0.15
269 0.19
270 0.22
271 0.25
272 0.27
273 0.27
274 0.3
275 0.28
276 0.3
277 0.28
278 0.27
279 0.27
280 0.26
281 0.25
282 0.22
283 0.21
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.23
301 0.24
302 0.21
303 0.19
304 0.23
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.15
309 0.15
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.19
315 0.21
316 0.22
317 0.21
318 0.19
319 0.24
320 0.2
321 0.21
322 0.21
323 0.23
324 0.22
325 0.27
326 0.27
327 0.21
328 0.23
329 0.25
330 0.31
331 0.28
332 0.28
333 0.24
334 0.32
335 0.35
336 0.34
337 0.37
338 0.35
339 0.42
340 0.47
341 0.51
342 0.52
343 0.51
344 0.53
345 0.54
346 0.57
347 0.53
348 0.56
349 0.56
350 0.47
351 0.45
352 0.43
353 0.39
354 0.32
355 0.38
356 0.38
357 0.43
358 0.45
359 0.49
360 0.55
361 0.62
362 0.66
363 0.64
364 0.63
365 0.62
366 0.68
367 0.69
368 0.65
369 0.62
370 0.66
371 0.7
372 0.71
373 0.71
374 0.72
375 0.7
376 0.7
377 0.71
378 0.7
379 0.66
380 0.65
381 0.65
382 0.58
383 0.54
384 0.5
385 0.44
386 0.38
387 0.32
388 0.25
389 0.21
390 0.22
391 0.26
392 0.3
393 0.34
394 0.35
395 0.36
396 0.36
397 0.39
398 0.38
399 0.36
400 0.34
401 0.32
402 0.28
403 0.27
404 0.25
405 0.2
406 0.19
407 0.18
408 0.16
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.13
423 0.16
424 0.18
425 0.22
426 0.26
427 0.33
428 0.39
429 0.43
430 0.4
431 0.4
432 0.44
433 0.42
434 0.4
435 0.34
436 0.29
437 0.3
438 0.28
439 0.27
440 0.24
441 0.25
442 0.27
443 0.3
444 0.33
445 0.39
446 0.49
447 0.58
448 0.67
449 0.75