Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3JWQ0

Protein Details
Accession A0A0C3JWQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-208PPDVQPTAKRPRGRPKGSKNRGSKVATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-205AKRPRGRPKGSKNRGSK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MAATNPAGVAGNAGTTAPSPLHQKPQPLVATGDWASELVHLAKTAELKKHSLTLQLHTAHIVSAHATLEQKDKAIQDIREQKNKLDSERIRLLNCLAEINADRDKADLMEASLARECAELRQQVGALQEGEYAVAKRDVDRLRVELGQPPLPPLQTTLDEKTSQYLRERRMNGEKRITSDTPPDVQPTAKRPRGRPKGSKNRGSKVATGSGGSSATLGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.08
4 0.07
5 0.09
6 0.15
7 0.19
8 0.28
9 0.31
10 0.37
11 0.38
12 0.45
13 0.45
14 0.41
15 0.41
16 0.32
17 0.34
18 0.29
19 0.27
20 0.19
21 0.17
22 0.14
23 0.12
24 0.13
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.14
31 0.17
32 0.21
33 0.23
34 0.25
35 0.26
36 0.3
37 0.29
38 0.33
39 0.31
40 0.3
41 0.34
42 0.33
43 0.32
44 0.29
45 0.28
46 0.2
47 0.18
48 0.14
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.21
62 0.21
63 0.26
64 0.36
65 0.41
66 0.47
67 0.47
68 0.45
69 0.48
70 0.49
71 0.43
72 0.42
73 0.38
74 0.37
75 0.44
76 0.44
77 0.37
78 0.36
79 0.34
80 0.26
81 0.25
82 0.18
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.06
95 0.05
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.14
125 0.16
126 0.19
127 0.21
128 0.22
129 0.23
130 0.25
131 0.25
132 0.23
133 0.25
134 0.24
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.21
139 0.2
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.21
144 0.22
145 0.24
146 0.25
147 0.25
148 0.27
149 0.25
150 0.25
151 0.29
152 0.32
153 0.35
154 0.42
155 0.45
156 0.49
157 0.57
158 0.63
159 0.63
160 0.66
161 0.62
162 0.58
163 0.62
164 0.57
165 0.49
166 0.47
167 0.44
168 0.38
169 0.37
170 0.35
171 0.29
172 0.3
173 0.32
174 0.34
175 0.41
176 0.44
177 0.5
178 0.55
179 0.65
180 0.73
181 0.79
182 0.81
183 0.82
184 0.87
185 0.9
186 0.91
187 0.89
188 0.87
189 0.86
190 0.79
191 0.73
192 0.67
193 0.64
194 0.55
195 0.47
196 0.39
197 0.32
198 0.28
199 0.22
200 0.17