Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3NPF2

Protein Details
Accession A0A0C3NPF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-39ESDGTKPTRRRSCKPGPPAELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-49AKRRK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MKRTSASLVSYSSSSSDESDGTKPTRRRSCKPGPPAELAAAGPSAKRRKLPPLAASLAPPVPADDPAKHQGRIRSFPHIEGQYATYVYVPLVLGPGEALYDLVTEVISTAKKEVKGLWGVGEAEKEDAQRQKHECEDRDENKSMGRGERKNAKLELHISLSRPIFLRAHQREDFKRAVKKIAESVSPFSASFSTFSELTNDERTRTFLTMEVGAGHVEFCQILNFLVPTLRSLRQKEFYGDPKFHASIAWALLDCSRTTTPLPSTSATPDTARSSSVPLQVSQSLRVSQERPPSETVTSASGLPSQSRIPSNTPTPSDSMSTVDLDRFPRIPHLPPTLVSTLNATYAPRLSAARTGGFLADKIAVRIGKEVVVWCLSGIGQAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.18
6 0.19
7 0.23
8 0.26
9 0.33
10 0.37
11 0.45
12 0.54
13 0.6
14 0.65
15 0.7
16 0.77
17 0.79
18 0.85
19 0.85
20 0.81
21 0.78
22 0.74
23 0.66
24 0.57
25 0.46
26 0.37
27 0.27
28 0.21
29 0.16
30 0.2
31 0.25
32 0.26
33 0.31
34 0.35
35 0.44
36 0.53
37 0.61
38 0.59
39 0.61
40 0.62
41 0.58
42 0.55
43 0.49
44 0.4
45 0.32
46 0.26
47 0.19
48 0.15
49 0.17
50 0.19
51 0.16
52 0.22
53 0.29
54 0.33
55 0.33
56 0.36
57 0.4
58 0.44
59 0.5
60 0.48
61 0.5
62 0.48
63 0.49
64 0.52
65 0.47
66 0.41
67 0.35
68 0.33
69 0.24
70 0.23
71 0.2
72 0.13
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.03
92 0.04
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.09
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.16
101 0.19
102 0.22
103 0.22
104 0.2
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.17
115 0.18
116 0.24
117 0.26
118 0.28
119 0.35
120 0.41
121 0.4
122 0.43
123 0.51
124 0.49
125 0.53
126 0.51
127 0.44
128 0.39
129 0.38
130 0.33
131 0.29
132 0.32
133 0.28
134 0.32
135 0.41
136 0.43
137 0.45
138 0.46
139 0.41
140 0.37
141 0.37
142 0.34
143 0.28
144 0.27
145 0.24
146 0.26
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.17
153 0.26
154 0.26
155 0.33
156 0.35
157 0.4
158 0.4
159 0.45
160 0.47
161 0.42
162 0.44
163 0.39
164 0.41
165 0.37
166 0.36
167 0.36
168 0.33
169 0.31
170 0.26
171 0.27
172 0.23
173 0.22
174 0.2
175 0.16
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.17
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.07
216 0.1
217 0.14
218 0.19
219 0.23
220 0.28
221 0.31
222 0.33
223 0.35
224 0.36
225 0.41
226 0.42
227 0.4
228 0.37
229 0.38
230 0.36
231 0.33
232 0.28
233 0.2
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.16
247 0.17
248 0.2
249 0.22
250 0.2
251 0.22
252 0.23
253 0.25
254 0.23
255 0.22
256 0.21
257 0.22
258 0.21
259 0.2
260 0.18
261 0.2
262 0.22
263 0.27
264 0.25
265 0.22
266 0.25
267 0.28
268 0.28
269 0.27
270 0.25
271 0.22
272 0.23
273 0.25
274 0.25
275 0.26
276 0.34
277 0.34
278 0.35
279 0.37
280 0.38
281 0.36
282 0.35
283 0.31
284 0.25
285 0.23
286 0.2
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.17
294 0.19
295 0.22
296 0.24
297 0.28
298 0.34
299 0.37
300 0.38
301 0.37
302 0.37
303 0.36
304 0.34
305 0.3
306 0.26
307 0.22
308 0.22
309 0.2
310 0.19
311 0.2
312 0.2
313 0.22
314 0.21
315 0.2
316 0.25
317 0.27
318 0.31
319 0.35
320 0.4
321 0.39
322 0.39
323 0.44
324 0.4
325 0.37
326 0.33
327 0.29
328 0.22
329 0.22
330 0.22
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.19
339 0.22
340 0.21
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.19
351 0.18
352 0.18
353 0.21
354 0.2
355 0.17
356 0.19
357 0.2
358 0.19
359 0.19
360 0.19
361 0.16
362 0.16
363 0.14