FuNGI

A0A0C3NWK2

Protein Details

Accession

A0A0C3NWK2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
200-222	FSSQRSCTRPPSRTGKKIRFAEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10.5, cyto_mito 10.333, cyto 9, cyto_nucl 6.833, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MIGSVVERKLASQPSTTPRFTAKPGIGFPAVQHRSKSAFARAREETKVNNADIRSNEVPVVVTTQPPVTAETKTISTDVEDLRHHISRANEQQLASMTSEEIEKERKSILDQLGNDAPDLLKRVREARERKLAREAAQETEAERNVMNSEQTERPPIHHPKPTLLSLGARPGILRVRSLESVPQSGKVVTLSLCPTPPTFSSQRSCTRPPSRTGKKIRFAEVTPKDIYVYESAPVSPKRQVFALPPPPDKPDSSIVSLGTFKGSIPSKRPHPIDSPSDDKESAATATGDSKLEEGTPEHIRRRYFPDAPENDPNLEWMQASTSPDSSELRFDLNGAPIPPPLSETLPSHLGLHHHAEGNRAGYTLDDIFLLSRSTVPAQRASMLGVLAKVVHRLGTQFKDGNSPDKIAEFVGKEGELRKQALAAGLSAISERGSVGAMAVEVVWECLVVWDDRTADVEGIELHLAPDVISSTHPEQLLPIIAGMLVQPSLPRETLEQLLAIVYRFAQESNELANSIMTAPHLVSAIIQTFLLTPIPPREDSFLPDPMALRLLIILASASRSNASTLLEPADALLRFATLLPDSSPFPTPLATSLLIQTLRFYRILASYGLYSHIATSASFYFSALGSYVLSPPPLAPKTLSQLRAAWSSLLEVWIVCATDPHATTPPHEILWSQVTAWGWESEVRLLRKDLTEAEQDWEVWSVVWNVEAAWLEGARINGVKGGEKERAEVLDSVQPGFEAEDGLEHKVVRAALEAVKQRLGTLATDSPGMKQALRLIVAPTRALSSAIRLWLACLPPLKDVPLGSPPFTLPFGELSKLCAELVTHPVWSLPQKRGMYLQVHLRPLSSLLVYFHRLSRHIPGTGPDLWLAQGLSMITRLIPGDESAAIAIEENCILPVTPQITGFHVQLPSVATDILKPFFEHTIRPSQNVYFGPLHVTTESISRSATLRLPGGAPDLPEEAKTGLPLPRDWLTAPLTHLLRSGTSPVFRNLPTGWDASEVEVVRATLLLLHVSSGVLRRWGLGVYALGPAEVVFACMKVCMLEHGVGGGASGMDSSVEVFRDSVVEKLMQWLLHPFTPKQLPTPPPSPPTTATCSEPTSASLPRFTPQNYLEIASQTYLSQTHTPFYQFYTDLVALYTSVSFAHPIFGALLIPVLAMRYPSDYRRLVWCEAGDGSRASSGVGGDVREYLYPVERDGRILGAYLQALLAGSNAPQGFLRLVAVHHVACSVWPDLQKLARAAEDETRPTLLRLLLNRGDAPAVRDVLLYRQSPRSGFLWPPSCFECDLAETDKAERVEYVRDVISGDMAERVKVIFGWKED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.48
3	0.48
4	0.44
5	0.44
6	0.45
7	0.46
8	0.48
9	0.44
10	0.44
11	0.45
12	0.48
13	0.44
14	0.4
15	0.38
16	0.4
17	0.4
18	0.36
19	0.35
20	0.34
21	0.36
22	0.41
23	0.44
24	0.43
25	0.46
26	0.47
27	0.53
28	0.56
29	0.57
30	0.58
31	0.57
32	0.5
33	0.52
34	0.53
35	0.47
36	0.46
37	0.41
38	0.41
39	0.39
40	0.43
41	0.36
42	0.32
43	0.3
44	0.26
45	0.25
46	0.2
47	0.23
48	0.16
49	0.16
50	0.16
51	0.16
52	0.16
53	0.16
54	0.19
55	0.17
56	0.17
57	0.19
58	0.2
59	0.21
60	0.22
61	0.22
62	0.19
63	0.18
64	0.21
65	0.21
66	0.22
67	0.22
68	0.23
69	0.28
70	0.3
71	0.28
72	0.28
73	0.29
74	0.35
75	0.43
76	0.47
77	0.45
78	0.43
79	0.45
80	0.44
81	0.42
82	0.33
83	0.25
84	0.18
85	0.15
86	0.15
87	0.14
88	0.14
89	0.17
90	0.17
91	0.18
92	0.2
93	0.21
94	0.23
95	0.3
96	0.34
97	0.36
98	0.36
99	0.41
100	0.43
101	0.42
102	0.39
103	0.31
104	0.25
105	0.19
106	0.22
107	0.17
108	0.16
109	0.18
110	0.25
111	0.32
112	0.42
113	0.48
114	0.53
115	0.63
116	0.65
117	0.66
118	0.69
119	0.67
120	0.61
121	0.62
122	0.55
123	0.49
124	0.46
125	0.43
126	0.35
127	0.35
128	0.32
129	0.23
130	0.2
131	0.17
132	0.17
133	0.17
134	0.17
135	0.13
136	0.18
137	0.21
138	0.23
139	0.27
140	0.27
141	0.29
142	0.37
143	0.45
144	0.47
145	0.51
146	0.52
147	0.54
148	0.59
149	0.58
150	0.52
151	0.45
152	0.4
153	0.35
154	0.39
155	0.32
156	0.27
157	0.24
158	0.24
159	0.28
160	0.25
161	0.24
162	0.21
163	0.25
164	0.26
165	0.28
166	0.3
167	0.27
168	0.33
169	0.32
170	0.31
171	0.27
172	0.25
173	0.25
174	0.2
175	0.18
176	0.13
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.17
181	0.18
182	0.18
183	0.2
184	0.21
185	0.24
186	0.26
187	0.31
188	0.36
189	0.41
190	0.49
191	0.52
192	0.56
193	0.6
194	0.65
195	0.63
196	0.66
197	0.7
198	0.71
199	0.75
200	0.8
201	0.8
202	0.8
203	0.81
204	0.79
205	0.73
206	0.66
207	0.67
208	0.62
209	0.57
210	0.48
211	0.43
212	0.37
213	0.33
214	0.32
215	0.24
216	0.19
217	0.15
218	0.14
219	0.14
220	0.19
221	0.2
222	0.21
223	0.25
224	0.25
225	0.26
226	0.26
227	0.29
228	0.29
229	0.37
230	0.44
231	0.45
232	0.47
233	0.48
234	0.51
235	0.51
236	0.47
237	0.41
238	0.37
239	0.34
240	0.34
241	0.33
242	0.29
243	0.28
244	0.28
245	0.24
246	0.19
247	0.15
248	0.11
249	0.15
250	0.19
251	0.21
252	0.26
253	0.33
254	0.39
255	0.47
256	0.51
257	0.5
258	0.52
259	0.54
260	0.55
261	0.55
262	0.55
263	0.5
264	0.51
265	0.46
266	0.39
267	0.33
268	0.27
269	0.21
270	0.16
271	0.13
272	0.09
273	0.11
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.13
283	0.2
284	0.24
285	0.3
286	0.34
287	0.35
288	0.38
289	0.45
290	0.48
291	0.45
292	0.46
293	0.51
294	0.52
295	0.57
296	0.61
297	0.55
298	0.48
299	0.44
300	0.4
301	0.3
302	0.26
303	0.2
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.13
311	0.15
312	0.17
313	0.15
314	0.16
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.15
319	0.15
320	0.16
321	0.17
322	0.15
323	0.15
324	0.14
325	0.15
326	0.14
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.15
331	0.16
332	0.18
333	0.2
334	0.2
335	0.19
336	0.19
337	0.18
338	0.19
339	0.21
340	0.2
341	0.21
342	0.21
343	0.23
344	0.23
345	0.23
346	0.21
347	0.17
348	0.14
349	0.11
350	0.13
351	0.11
352	0.09
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.1
362	0.13
363	0.14
364	0.17
365	0.18
366	0.19
367	0.18
368	0.18
369	0.17
370	0.14
371	0.12
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.1
381	0.15
382	0.17
383	0.21
384	0.22
385	0.22
386	0.28
387	0.29
388	0.33
389	0.29
390	0.28
391	0.24
392	0.23
393	0.23
394	0.16
395	0.18
396	0.14
397	0.12
398	0.12
399	0.11
400	0.12
401	0.13
402	0.16
403	0.16
404	0.16
405	0.15
406	0.15
407	0.15
408	0.16
409	0.15
410	0.11
411	0.09
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.1
441	0.1
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.05
457	0.08
458	0.1
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.13
464	0.14
465	0.1
466	0.08
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.04
472	0.03
473	0.03
474	0.04
475	0.05
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.09
480	0.11
481	0.13
482	0.13
483	0.12
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.08
488	0.06
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.07
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.05
520	0.06
521	0.09
522	0.11
523	0.12
524	0.13
525	0.16
526	0.16
527	0.2
528	0.22
529	0.22
530	0.2
531	0.2
532	0.19
533	0.16
534	0.16
535	0.12
536	0.09
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.07
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.08
556	0.08
557	0.1
558	0.09
559	0.08
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.04
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.08
570	0.1
571	0.11
572	0.1
573	0.11
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.12
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.12
585	0.11
586	0.12
587	0.11
588	0.11
589	0.1
590	0.1
591	0.12
592	0.11
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.1
597	0.09
598	0.08
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.06
603	0.08
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.13
625	0.18
626	0.23
627	0.25
628	0.21
629	0.23
630	0.24
631	0.24
632	0.23
633	0.18
634	0.13
635	0.11
636	0.1
637	0.09
638	0.07
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.06
647	0.07
648	0.08
649	0.11
650	0.12
651	0.13
652	0.17
653	0.17
654	0.15
655	0.15
656	0.13
657	0.12
658	0.14
659	0.13
660	0.09
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.11
665	0.09
666	0.07
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.13
671	0.13
672	0.14
673	0.14
674	0.15
675	0.14
676	0.15
677	0.14
678	0.13
679	0.15
680	0.15
681	0.16
682	0.15
683	0.14
684	0.13
685	0.13
686	0.1
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.05
693	0.04
694	0.06
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.06
701	0.06
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.07
706	0.07
707	0.09
708	0.09
709	0.12
710	0.16
711	0.16
712	0.17
713	0.17
714	0.17
715	0.17
716	0.15
717	0.14
718	0.13
719	0.13
720	0.12
721	0.11
722	0.1
723	0.09
724	0.09
725	0.07
726	0.04
727	0.04
728	0.05
729	0.06
730	0.07
731	0.08
732	0.07
733	0.07
734	0.09
735	0.09
736	0.07
737	0.07
738	0.08
739	0.09
740	0.14
741	0.16
742	0.15
743	0.17
744	0.16
745	0.16
746	0.15
747	0.14
748	0.1
749	0.11
750	0.11
751	0.1
752	0.12
753	0.12
754	0.12
755	0.14
756	0.15
757	0.12
758	0.11
759	0.14
760	0.14
761	0.15
762	0.15
763	0.13
764	0.14
765	0.15
766	0.15
767	0.12
768	0.11
769	0.11
770	0.11
771	0.1
772	0.1
773	0.11
774	0.12
775	0.12
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.14
780	0.13
781	0.13
782	0.14
783	0.15
784	0.16
785	0.16
786	0.14
787	0.14
788	0.14
789	0.19
790	0.2
791	0.18
792	0.19
793	0.18
794	0.18
795	0.19
796	0.16
797	0.1
798	0.11
799	0.12
800	0.13
801	0.13
802	0.13
803	0.13
804	0.13
805	0.13
806	0.1
807	0.09
808	0.1
809	0.14
810	0.12
811	0.12
812	0.11
813	0.11
814	0.13
815	0.17
816	0.2
817	0.19
818	0.26
819	0.26
820	0.27
821	0.3
822	0.33
823	0.31
824	0.29
825	0.35
826	0.32
827	0.34
828	0.33
829	0.31
830	0.26
831	0.25
832	0.23
833	0.14
834	0.1
835	0.09
836	0.12
837	0.14
838	0.15
839	0.16
840	0.17
841	0.18
842	0.19
843	0.24
844	0.25
845	0.23
846	0.23
847	0.23
848	0.26
849	0.26
850	0.25
851	0.18
852	0.15
853	0.14
854	0.14
855	0.12
856	0.07
857	0.06
858	0.05
859	0.05
860	0.05
861	0.05
862	0.04
863	0.05
864	0.05
865	0.05
866	0.05
867	0.05
868	0.06
869	0.06
870	0.07
871	0.06
872	0.06
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.05
877	0.05
878	0.04
879	0.05
880	0.04
881	0.05
882	0.04
883	0.07
884	0.08
885	0.08
886	0.09
887	0.1
888	0.13
889	0.15
890	0.16
891	0.16
892	0.15
893	0.14
894	0.15
895	0.15
896	0.12
897	0.11
898	0.1
899	0.07
900	0.09
901	0.11
902	0.11
903	0.1
904	0.1
905	0.11
906	0.15
907	0.16
908	0.16
909	0.18
910	0.28
911	0.29
912	0.3
913	0.31
914	0.28
915	0.32
916	0.31
917	0.32
918	0.23
919	0.22
920	0.23
921	0.21
922	0.21
923	0.16
924	0.16
925	0.12
926	0.13
927	0.14
928	0.11
929	0.11
930	0.1
931	0.11
932	0.13
933	0.15
934	0.14
935	0.14
936	0.15
937	0.15
938	0.15
939	0.17
940	0.15
941	0.13
942	0.13
943	0.14
944	0.14
945	0.13
946	0.14
947	0.12
948	0.11
949	0.11
950	0.12
951	0.13
952	0.14
953	0.14
954	0.17
955	0.18
956	0.2
957	0.19
958	0.2
959	0.2
960	0.2
961	0.21
962	0.22
963	0.21
964	0.2
965	0.21
966	0.18
967	0.16
968	0.16
969	0.19
970	0.16
971	0.18
972	0.19
973	0.2
974	0.23
975	0.23
976	0.25
977	0.21
978	0.21
979	0.21
980	0.2
981	0.18
982	0.17
983	0.17
984	0.16
985	0.2
986	0.17
987	0.15
988	0.14
989	0.14
990	0.11
991	0.1
992	0.09
993	0.05
994	0.06
995	0.06
996	0.05
997	0.06
998	0.06
999	0.06
1000	0.07
1001	0.08
1002	0.09
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.11
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.09
1012	0.11
1013	0.1
1014	0.09
1015	0.08
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.07
1019	0.07
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.07
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.07
1028	0.09
1029	0.1
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.09
1034	0.09
1035	0.07
1036	0.04
1037	0.03
1038	0.03
1039	0.03
1040	0.03
1041	0.03
1042	0.04
1043	0.05
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.07
1047	0.07
1048	0.09
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.14
1055	0.16
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.18
1059	0.19
1060	0.21
1061	0.24
1062	0.2
1063	0.25
1064	0.31
1065	0.31
1066	0.32
1067	0.37
1068	0.4
1069	0.44
1070	0.48
1071	0.48
1072	0.47
1073	0.49
1074	0.48
1075	0.44
1076	0.43
1077	0.43
1078	0.4
1079	0.38
1080	0.37
1081	0.36
1082	0.33
1083	0.3
1084	0.27
1085	0.25
1086	0.26
1087	0.24
1088	0.24
1089	0.23
1090	0.23
1091	0.27
1092	0.26
1093	0.29
1094	0.26
1095	0.29
1096	0.27
1097	0.28
1098	0.28
1099	0.25
1100	0.25
1101	0.19
1102	0.18
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.12
1106	0.14
1107	0.16
1108	0.16
1109	0.18
1110	0.19
1111	0.21
1112	0.21
1113	0.22
1114	0.23
1115	0.19
1116	0.19
1117	0.23
1118	0.22
1119	0.2
1120	0.19
1121	0.17
1122	0.13
1123	0.13
1124	0.12
1125	0.06
1126	0.06
1127	0.07
1128	0.08
1129	0.08
1130	0.09
1131	0.09
1132	0.09
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.09
1136	0.08
1137	0.08
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.06
1145	0.11
1146	0.14
1147	0.17
1148	0.24
1149	0.26
1150	0.28
1151	0.36
1152	0.4
1153	0.38
1154	0.39
1155	0.37
1156	0.33
1157	0.33
1158	0.32
1159	0.25
1160	0.21
1161	0.19
1162	0.16
1163	0.15
1164	0.12
1165	0.11
1166	0.1
1167	0.1
1168	0.11
1169	0.11
1170	0.1
1171	0.11
1172	0.12
1173	0.12
1174	0.12
1175	0.11
1176	0.15
1177	0.15
1178	0.17
1179	0.21
1180	0.21
1181	0.22
1182	0.23
1183	0.23
1184	0.18
1185	0.18
1186	0.17
1187	0.13
1188	0.13
1189	0.12
1190	0.1
1191	0.09
1192	0.08
1193	0.07
1194	0.07
1195	0.05
1196	0.05
1197	0.09
1198	0.09
1199	0.1
1200	0.1
1201	0.12
1202	0.12
1203	0.12
1204	0.13
1205	0.1
1206	0.11
1207	0.14
1208	0.17
1209	0.15
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.13
1213	0.13
1214	0.16
1215	0.13
1216	0.14
1217	0.15
1218	0.17
1219	0.21
1220	0.25
1221	0.28
1222	0.28
1223	0.28
1224	0.27
1225	0.27
1226	0.27
1227	0.3
1228	0.31
1229	0.31
1230	0.31
1231	0.31
1232	0.3
1233	0.29
1234	0.29
1235	0.25
1236	0.26
1237	0.26
1238	0.32
1239	0.33
1240	0.36
1241	0.36
1242	0.34
1243	0.33
1244	0.29
1245	0.28
1246	0.24
1247	0.22
1248	0.19
1249	0.19
1250	0.19
1251	0.23
1252	0.28
1253	0.27
1254	0.27
1255	0.32
1256	0.35
1257	0.35
1258	0.37
1259	0.33
1260	0.32
1261	0.35
1262	0.4
1263	0.42
1264	0.41
1265	0.44
1266	0.44
1267	0.44
1268	0.4
1269	0.37
1270	0.31
1271	0.25
1272	0.27
1273	0.27
1274	0.26
1275	0.25
1276	0.26
1277	0.29
1278	0.27
1279	0.25
1280	0.23
1281	0.2
1282	0.23
1283	0.24
1284	0.26
1285	0.21
1286	0.21
1287	0.21
1288	0.2
1289	0.19
1290	0.14
1291	0.13
1292	0.15
1293	0.14
1294	0.14
1295	0.14
1296	0.14
1297	0.13
1298	0.13
1299	0.17

A0A0C3NWK2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer