Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3IRM9

Protein Details
Accession A0A0C3IRM9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-519RELAKGSKAKKLTKKKAKTKEKGSDDEDDBasic
521-544DGEKTKKASAKPKAKPAKPKEDDDBasic
546-573MDVDDERPKPKPKPKPKVKSTAKDDEDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-512AKGSKAKKLTKKKAKTKEK
524-540KTKKASAKPKAKPAKPK
552-580RPKPKPKPKPKVKSTAKDDEDGPAKKKQK
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13.5, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR035417  SSRP1/POB3_N  
IPR024954  SSRP1_DD  
IPR038167  SSRP1_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF17292  POB3_N  
PF08512  Rtt106  
PF03531  SSrecog  
CDD cd13231  PH2_SSRP1-like  
Amino Acid Sequences MSTTQFDKIYHGLSPEVGSVYSPEFRIANSGMAWKGEENEKVIALPSGDIKWAQWFRVARNFQLRVGLKDRRRETFDGFMREDHDKLANLLKQYFAVTLEVKDVTFKGWNWGVTDIQGQDLAFLVSNKTAFELPLNQVANSNIAGKTEVSLEFASSASPGKKSSRNAPDEMTEIRFHVPGTHKSDDEEGEEMSAAQAFHDAIKEKAEIGQVAGDLVLSFEEVLVLTPRGRYDLDMSIEFLRLRGKTQGQTRYQYLVMQFAREEETTAELNLSEEEIAKYDKLKKHYEDPTFEVVSGVFRALSKKKIIGSGAFQSRGGHPGIKANFKAVQGDLFMLEKYIFFVSKQPMLIELSDIHQCVFSRVGASMGATAARTFDLKIITKSGPEYTFTSINKEEHEPVESYLKDKKIKLKNEMVPDVDLLAAGAGDSDEEMQSVASSGDEQPRPRIGGDDDDSEEDEDFEASSSDEGSPTESESESSGGGVTASDASGDRELAKGSKAKKLTKKKAKTKEKGSDDEDDDDGEKTKKASAKPKAKPAKPKEDDDAMDVDDERPKPKPKPKPKVKSTAKDDEDGPAKKKQKTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.17
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.16
8 0.17
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.17
17 0.21
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.18
22 0.2
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.22
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.19
31 0.15
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.22
39 0.23
40 0.23
41 0.27
42 0.29
43 0.34
44 0.44
45 0.46
46 0.44
47 0.51
48 0.53
49 0.48
50 0.55
51 0.51
52 0.47
53 0.52
54 0.54
55 0.5
56 0.57
57 0.61
58 0.58
59 0.62
60 0.61
61 0.59
62 0.59
63 0.61
64 0.58
65 0.54
66 0.49
67 0.46
68 0.45
69 0.39
70 0.32
71 0.27
72 0.2
73 0.21
74 0.26
75 0.25
76 0.25
77 0.26
78 0.24
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.16
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.15
93 0.15
94 0.19
95 0.21
96 0.23
97 0.23
98 0.25
99 0.23
100 0.21
101 0.24
102 0.18
103 0.16
104 0.16
105 0.13
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.15
120 0.16
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.23
125 0.23
126 0.22
127 0.18
128 0.19
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.13
147 0.17
148 0.23
149 0.27
150 0.36
151 0.43
152 0.47
153 0.49
154 0.49
155 0.46
156 0.43
157 0.42
158 0.35
159 0.26
160 0.22
161 0.21
162 0.19
163 0.16
164 0.19
165 0.21
166 0.25
167 0.32
168 0.33
169 0.32
170 0.33
171 0.35
172 0.31
173 0.28
174 0.22
175 0.15
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.02
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.12
219 0.15
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.12
230 0.15
231 0.17
232 0.22
233 0.29
234 0.37
235 0.39
236 0.42
237 0.43
238 0.41
239 0.39
240 0.35
241 0.29
242 0.27
243 0.23
244 0.19
245 0.17
246 0.15
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.09
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.15
267 0.18
268 0.22
269 0.27
270 0.29
271 0.36
272 0.44
273 0.47
274 0.44
275 0.45
276 0.45
277 0.4
278 0.38
279 0.3
280 0.22
281 0.17
282 0.13
283 0.09
284 0.05
285 0.05
286 0.08
287 0.1
288 0.13
289 0.14
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.21
294 0.19
295 0.2
296 0.24
297 0.25
298 0.24
299 0.23
300 0.21
301 0.2
302 0.21
303 0.18
304 0.13
305 0.11
306 0.16
307 0.19
308 0.22
309 0.21
310 0.21
311 0.24
312 0.23
313 0.24
314 0.18
315 0.16
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.11
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.12
340 0.12
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.19
369 0.2
370 0.18
371 0.19
372 0.2
373 0.2
374 0.24
375 0.24
376 0.27
377 0.26
378 0.26
379 0.26
380 0.26
381 0.26
382 0.22
383 0.24
384 0.2
385 0.19
386 0.23
387 0.21
388 0.21
389 0.24
390 0.28
391 0.3
392 0.33
393 0.4
394 0.44
395 0.51
396 0.57
397 0.62
398 0.63
399 0.66
400 0.67
401 0.59
402 0.51
403 0.44
404 0.36
405 0.26
406 0.19
407 0.11
408 0.07
409 0.05
410 0.03
411 0.03
412 0.02
413 0.02
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.06
425 0.08
426 0.15
427 0.18
428 0.2
429 0.23
430 0.26
431 0.27
432 0.26
433 0.27
434 0.22
435 0.26
436 0.27
437 0.27
438 0.26
439 0.26
440 0.27
441 0.24
442 0.22
443 0.15
444 0.13
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.13
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.11
480 0.12
481 0.15
482 0.18
483 0.21
484 0.28
485 0.35
486 0.43
487 0.52
488 0.63
489 0.71
490 0.76
491 0.84
492 0.87
493 0.91
494 0.94
495 0.93
496 0.93
497 0.92
498 0.9
499 0.87
500 0.81
501 0.78
502 0.7
503 0.63
504 0.53
505 0.43
506 0.35
507 0.29
508 0.26
509 0.2
510 0.17
511 0.14
512 0.19
513 0.23
514 0.29
515 0.39
516 0.47
517 0.57
518 0.64
519 0.74
520 0.8
521 0.83
522 0.86
523 0.86
524 0.87
525 0.82
526 0.8
527 0.76
528 0.73
529 0.67
530 0.59
531 0.52
532 0.41
533 0.36
534 0.31
535 0.25
536 0.24
537 0.23
538 0.23
539 0.27
540 0.33
541 0.42
542 0.51
543 0.61
544 0.66
545 0.76
546 0.84
547 0.89
548 0.92
549 0.94
550 0.94
551 0.94
552 0.91
553 0.91
554 0.83
555 0.76
556 0.67
557 0.63
558 0.61
559 0.55
560 0.5
561 0.48
562 0.52
563 0.55