Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C3JJ33

Protein Details
Accession A0A0C3JJ33    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-75VLNSKQFARRWRECNRRISSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-404PLRRGGRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MEYFSEEHSKLLLSKEWLVKVDAQTAKPYLFKFHSSSVDLTCCFMITDTKCIWAEVLNSKQFARRWRECNRRISSPLLDDDAEEAWRTRNLDLLSRAHTLGGVSDVSFEPVESKIADLAFELECDTFKWRWDTIFVGHKASADILSQHLIMPLISVNHLAFSSPNAVGDFSGDELEKAIDKIGRTARRTVDTHIKNAMSKPRLATTLRRMTAVFNFISDLPKVTIANDVTPLQPREPAPKLSTGTKLSKSTGSYVTDKTTDIRGDLKSEAITLGVQSPITADVDMGSATESESDSHPHASMSRESANKRPVTESQHGTTAAKFPVPSKAPSPAPSGPQSRNAIKPPPVSSDTDSSPIRPAKKSRPSPASDEDSEEERKKLAAQIKSGATSVRGTRQPLRRGGRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.36
4 0.37
5 0.37
6 0.39
7 0.37
8 0.42
9 0.4
10 0.36
11 0.37
12 0.38
13 0.37
14 0.36
15 0.34
16 0.32
17 0.31
18 0.34
19 0.34
20 0.37
21 0.4
22 0.4
23 0.42
24 0.38
25 0.39
26 0.34
27 0.32
28 0.26
29 0.21
30 0.18
31 0.16
32 0.19
33 0.17
34 0.22
35 0.21
36 0.26
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.21
41 0.24
42 0.26
43 0.33
44 0.32
45 0.33
46 0.34
47 0.39
48 0.4
49 0.44
50 0.46
51 0.46
52 0.52
53 0.61
54 0.71
55 0.74
56 0.81
57 0.79
58 0.77
59 0.72
60 0.7
61 0.64
62 0.58
63 0.52
64 0.45
65 0.38
66 0.31
67 0.28
68 0.23
69 0.18
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.12
76 0.16
77 0.17
78 0.22
79 0.26
80 0.28
81 0.3
82 0.3
83 0.31
84 0.26
85 0.25
86 0.19
87 0.15
88 0.13
89 0.09
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.12
113 0.11
114 0.13
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.19
119 0.21
120 0.21
121 0.29
122 0.29
123 0.28
124 0.27
125 0.27
126 0.25
127 0.23
128 0.19
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.12
169 0.18
170 0.23
171 0.25
172 0.29
173 0.31
174 0.34
175 0.36
176 0.35
177 0.39
178 0.35
179 0.36
180 0.35
181 0.33
182 0.3
183 0.32
184 0.35
185 0.27
186 0.26
187 0.24
188 0.22
189 0.25
190 0.25
191 0.28
192 0.29
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.33
197 0.32
198 0.32
199 0.3
200 0.21
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.12
206 0.11
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.17
219 0.14
220 0.16
221 0.17
222 0.21
223 0.23
224 0.26
225 0.24
226 0.28
227 0.3
228 0.3
229 0.33
230 0.31
231 0.33
232 0.34
233 0.34
234 0.31
235 0.32
236 0.3
237 0.29
238 0.28
239 0.27
240 0.26
241 0.25
242 0.26
243 0.24
244 0.23
245 0.22
246 0.21
247 0.17
248 0.15
249 0.17
250 0.16
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.16
287 0.17
288 0.19
289 0.23
290 0.27
291 0.3
292 0.37
293 0.43
294 0.42
295 0.42
296 0.42
297 0.42
298 0.45
299 0.49
300 0.47
301 0.42
302 0.43
303 0.42
304 0.38
305 0.34
306 0.3
307 0.25
308 0.21
309 0.19
310 0.17
311 0.24
312 0.26
313 0.28
314 0.27
315 0.32
316 0.34
317 0.37
318 0.43
319 0.37
320 0.4
321 0.43
322 0.47
323 0.43
324 0.47
325 0.5
326 0.48
327 0.51
328 0.52
329 0.53
330 0.52
331 0.55
332 0.51
333 0.52
334 0.5
335 0.48
336 0.47
337 0.44
338 0.41
339 0.41
340 0.38
341 0.32
342 0.36
343 0.37
344 0.38
345 0.4
346 0.45
347 0.5
348 0.6
349 0.68
350 0.71
351 0.75
352 0.75
353 0.76
354 0.76
355 0.73
356 0.64
357 0.6
358 0.53
359 0.48
360 0.49
361 0.44
362 0.37
363 0.3
364 0.29
365 0.25
366 0.29
367 0.33
368 0.32
369 0.35
370 0.41
371 0.44
372 0.45
373 0.44
374 0.38
375 0.32
376 0.3
377 0.3
378 0.31
379 0.32
380 0.35
381 0.44
382 0.52
383 0.58
384 0.64
385 0.69