Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3NDD0

Protein Details
Accession A0A0C3NDD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
477-504RRNPISASTRRPRARRSRGRARGRAVTVHydrophilic
515-546ESSSVKPAKTRSRIRSRAKPRGRITEKDKDKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
484-500STRRPRARRSRGRARGR
520-538KPAKTRSRIRSRAKPRGRI
Subcellular Location(s) cyto_mito 10.166, mito 10, cyto 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MVRASQATTFSSSAYFDDRGPHGTAQPITERVNPHSRPIVSYFFPKGVGEFHYGERHPMKPHRLTLTNALVMGYGLDKQIHHMYNPRPATQVELEMYHDHDYIEFLSRVTPNNQNEMRHLIDTFNCVEDCPIFAEMYDFCRMYAGASLAGARKLCSGTCDTAINWSGGLHHAKRGEASGFCYVNDIVLAILELLRYHPRVLYIDIDIHHGDGVELAFYHSNRVMTVSFHKYTGEFFPGTGKLDDNGASLGKHFCLNVPLQDGVDDEMYLTVFKTVIEDTVTAFRPTAIVLQCGADSLGCDRLGAFNLSIAAHGECVNFVRKFNVPLLVLGGGGYTIKNVSRCWTYETAVLVGAEIPDELPATAYDPFFRDSEWKLHPPLTGRVENQNTPASLQKITISIRNKLRYLQGAPSVAMQEIPPDLEGLLADEDKNQEERDEERGTAFAGESRSDRCIARHEYFEGDNDVDHDDCAPPSATRRNPISASTRRPRARRSRGRARGRAVTVNGREDGEEVDESSSVKPAKTRSRIRSRAKPRGRITEKDKDKDVEDMDADVGGEPESGVEPVTPVDVDIDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.17
4 0.22
5 0.23
6 0.26
7 0.28
8 0.28
9 0.26
10 0.3
11 0.31
12 0.29
13 0.31
14 0.32
15 0.32
16 0.35
17 0.37
18 0.38
19 0.46
20 0.44
21 0.45
22 0.49
23 0.47
24 0.46
25 0.47
26 0.46
27 0.39
28 0.44
29 0.42
30 0.35
31 0.35
32 0.31
33 0.27
34 0.24
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.25
39 0.3
40 0.31
41 0.36
42 0.38
43 0.38
44 0.4
45 0.46
46 0.52
47 0.52
48 0.59
49 0.61
50 0.6
51 0.61
52 0.61
53 0.6
54 0.53
55 0.45
56 0.38
57 0.3
58 0.26
59 0.23
60 0.15
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.12
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.28
70 0.32
71 0.41
72 0.44
73 0.42
74 0.38
75 0.37
76 0.41
77 0.35
78 0.35
79 0.27
80 0.24
81 0.26
82 0.24
83 0.26
84 0.22
85 0.2
86 0.16
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.16
91 0.14
92 0.12
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.23
97 0.29
98 0.28
99 0.36
100 0.4
101 0.38
102 0.4
103 0.42
104 0.41
105 0.34
106 0.32
107 0.25
108 0.23
109 0.24
110 0.23
111 0.19
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.11
122 0.11
123 0.14
124 0.16
125 0.14
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.21
149 0.22
150 0.2
151 0.16
152 0.13
153 0.12
154 0.14
155 0.18
156 0.15
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.2
163 0.16
164 0.19
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.19
170 0.16
171 0.15
172 0.11
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.16
191 0.16
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.13
196 0.11
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.17
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.2
218 0.21
219 0.22
220 0.19
221 0.14
222 0.13
223 0.15
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.14
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.12
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.15
312 0.15
313 0.16
314 0.14
315 0.13
316 0.11
317 0.09
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.18
330 0.2
331 0.2
332 0.22
333 0.23
334 0.2
335 0.18
336 0.17
337 0.12
338 0.1
339 0.08
340 0.06
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.13
357 0.14
358 0.2
359 0.25
360 0.27
361 0.27
362 0.29
363 0.3
364 0.3
365 0.35
366 0.35
367 0.33
368 0.32
369 0.38
370 0.4
371 0.4
372 0.4
373 0.35
374 0.29
375 0.27
376 0.28
377 0.22
378 0.19
379 0.18
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.23
384 0.23
385 0.28
386 0.35
387 0.39
388 0.39
389 0.38
390 0.41
391 0.4
392 0.4
393 0.37
394 0.35
395 0.32
396 0.31
397 0.3
398 0.27
399 0.21
400 0.18
401 0.13
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.11
417 0.12
418 0.11
419 0.1
420 0.12
421 0.14
422 0.19
423 0.2
424 0.19
425 0.18
426 0.19
427 0.18
428 0.17
429 0.15
430 0.12
431 0.11
432 0.12
433 0.13
434 0.15
435 0.16
436 0.18
437 0.18
438 0.17
439 0.23
440 0.29
441 0.31
442 0.32
443 0.32
444 0.34
445 0.34
446 0.34
447 0.3
448 0.23
449 0.2
450 0.18
451 0.18
452 0.14
453 0.13
454 0.12
455 0.1
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.16
461 0.24
462 0.27
463 0.33
464 0.38
465 0.41
466 0.42
467 0.46
468 0.5
469 0.5
470 0.56
471 0.58
472 0.64
473 0.66
474 0.71
475 0.76
476 0.78
477 0.81
478 0.82
479 0.83
480 0.85
481 0.88
482 0.92
483 0.91
484 0.87
485 0.85
486 0.79
487 0.75
488 0.69
489 0.67
490 0.61
491 0.56
492 0.5
493 0.41
494 0.36
495 0.3
496 0.27
497 0.2
498 0.16
499 0.13
500 0.13
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.16
505 0.14
506 0.15
507 0.17
508 0.25
509 0.35
510 0.44
511 0.54
512 0.6
513 0.7
514 0.8
515 0.86
516 0.89
517 0.9
518 0.91
519 0.91
520 0.9
521 0.88
522 0.89
523 0.86
524 0.84
525 0.82
526 0.82
527 0.82
528 0.78
529 0.75
530 0.67
531 0.61
532 0.58
533 0.51
534 0.45
535 0.36
536 0.31
537 0.26
538 0.23
539 0.21
540 0.15
541 0.13
542 0.09
543 0.08
544 0.06
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.09
553 0.08
554 0.07