Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3JYX2

Protein Details
Accession A0A0C3JYX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MEIPFRHRKFRTKLCRNFVIGKCHydrophilic
113-132SPPSWQTGKKKYPCRHFSRTHydrophilic
343-362SEFPYRPPKHQQIGHVRRISHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MEIPFRHRKFRTKLCRNFVIGKCEYGERCTFIHPPVALSPPQSWSFFTAQSYPTWNASPPQPELMYPTQASPLGPLQSFAAHPQELSPFGDEPSPTSLLLSTPGTVNLGYTASPPSWQTGKKKYPCRHFSRTGGWCPVGNRCKFIHDYSLVKSGNDRSSVMPHNPDAYYEDGRTISGGVRMAIPPALHHYSQMSRDNQEPWYTSTDTEESWREQTTASGLYWPVPHYVPYLPPINTTHPPLAPGTGSAQYPSTANAHQLPAGTYEIDGTTYFPIAIAQPFCYNREAPPPGYYQPRTNFPGFPSGAPPSAYRPPEDHDPVNQIGSDPAPTQEPQVAKESTIDESEFPYRPPKHQQIGHVRRISVIVKKVNGPSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.87
3 0.83
4 0.83
5 0.78
6 0.75
7 0.66
8 0.58
9 0.51
10 0.48
11 0.44
12 0.39
13 0.36
14 0.3
15 0.29
16 0.31
17 0.32
18 0.28
19 0.33
20 0.29
21 0.29
22 0.29
23 0.32
24 0.29
25 0.29
26 0.29
27 0.27
28 0.3
29 0.28
30 0.26
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.27
35 0.26
36 0.24
37 0.25
38 0.29
39 0.27
40 0.26
41 0.26
42 0.25
43 0.24
44 0.28
45 0.31
46 0.28
47 0.3
48 0.28
49 0.27
50 0.32
51 0.33
52 0.32
53 0.28
54 0.26
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.2
59 0.2
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.18
81 0.18
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.15
87 0.14
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.12
103 0.16
104 0.21
105 0.27
106 0.35
107 0.45
108 0.53
109 0.62
110 0.68
111 0.74
112 0.79
113 0.81
114 0.79
115 0.76
116 0.73
117 0.73
118 0.71
119 0.66
120 0.61
121 0.53
122 0.46
123 0.41
124 0.44
125 0.42
126 0.36
127 0.34
128 0.3
129 0.33
130 0.34
131 0.35
132 0.31
133 0.27
134 0.29
135 0.28
136 0.35
137 0.31
138 0.28
139 0.28
140 0.27
141 0.26
142 0.25
143 0.23
144 0.17
145 0.22
146 0.25
147 0.25
148 0.23
149 0.21
150 0.22
151 0.2
152 0.2
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.16
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.11
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.2
179 0.25
180 0.22
181 0.21
182 0.23
183 0.25
184 0.24
185 0.24
186 0.21
187 0.18
188 0.2
189 0.2
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.16
194 0.17
195 0.17
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.15
217 0.19
218 0.17
219 0.19
220 0.21
221 0.24
222 0.25
223 0.27
224 0.27
225 0.23
226 0.24
227 0.22
228 0.2
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.1
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.16
266 0.18
267 0.2
268 0.22
269 0.22
270 0.21
271 0.29
272 0.31
273 0.28
274 0.3
275 0.33
276 0.34
277 0.42
278 0.43
279 0.41
280 0.42
281 0.46
282 0.48
283 0.47
284 0.45
285 0.39
286 0.44
287 0.38
288 0.35
289 0.33
290 0.31
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.26
295 0.32
296 0.32
297 0.3
298 0.29
299 0.32
300 0.4
301 0.44
302 0.4
303 0.37
304 0.41
305 0.4
306 0.39
307 0.34
308 0.25
309 0.21
310 0.19
311 0.18
312 0.13
313 0.12
314 0.14
315 0.14
316 0.16
317 0.2
318 0.2
319 0.21
320 0.26
321 0.25
322 0.23
323 0.26
324 0.25
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.17
329 0.2
330 0.24
331 0.22
332 0.22
333 0.29
334 0.31
335 0.36
336 0.45
337 0.51
338 0.55
339 0.6
340 0.68
341 0.7
342 0.77
343 0.81
344 0.76
345 0.67
346 0.59
347 0.58
348 0.53
349 0.49
350 0.47
351 0.43
352 0.42
353 0.47