Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BMG6

Protein Details
Accession Q6BMG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-485TIYEEDKNGNNKKRKKEIESAKDSDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
472-474KRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046938  DNA_clamp_sf  
IPR016587  Rad17  
IPR003021  Rad1_Rec1_Rad17  
Gene Ontology GO:0030896  C:checkpoint clamp complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0000077  P:DNA damage checkpoint signaling  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
KEGG dha:DEHA2F05610g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02144  Rad1  
Amino Acid Sequences MSDESLDFQKSSGTSGNGVSSSPFTFTASTNQVSHLADVFSSITSINSQALMIITTNGIIIYSEYNHICNVQLSIDPSLFGTYNFYSENNTSSSQNNEELRLGVDISLISDAFIAAASSSVSKSKTKATANNGNTVTANGSVDNQVCYITYNGEGYPLVIEFEDSLMSEKIEFLTFYLDMTYPYDVSNSQEEEEEEQYNLVINHSEIQFEVILKSDVFTNLLKDLQQINTIDLFMFISNEMRQLGSNRQNSKKSRKSGPLYLDKQFNFISKGPIGHSKLIFPNEKTILEKLNIYGMDHDDSEMKPINTSLISCYNFGNFSKIFKAVKLSIKCKIMKDLSGILSIQLLCKNPQLTNYSGTLITFNMLESTTIVDKFDKNEEPEEFERFHLNNIFEDESYEYIKDYNDKNPKRVPMPNIESTNIQEYEELGNEKDEPPILSYASFRNNSKSATSNNVQINETIYEEDKNGNNKKRKKEIESAKDSDKDVKTVGSAIEIPLFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.24
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.18
14 0.23
15 0.25
16 0.28
17 0.26
18 0.27
19 0.29
20 0.29
21 0.29
22 0.23
23 0.19
24 0.15
25 0.16
26 0.15
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.09
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.13
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.14
69 0.12
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.18
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.24
81 0.23
82 0.28
83 0.28
84 0.27
85 0.26
86 0.24
87 0.24
88 0.2
89 0.17
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.05
106 0.06
107 0.08
108 0.1
109 0.12
110 0.14
111 0.2
112 0.27
113 0.32
114 0.38
115 0.45
116 0.53
117 0.54
118 0.6
119 0.54
120 0.49
121 0.43
122 0.36
123 0.29
124 0.19
125 0.17
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.16
181 0.15
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.08
188 0.06
189 0.05
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.12
212 0.11
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.09
231 0.15
232 0.22
233 0.29
234 0.34
235 0.39
236 0.46
237 0.52
238 0.6
239 0.61
240 0.59
241 0.61
242 0.64
243 0.64
244 0.64
245 0.65
246 0.65
247 0.61
248 0.58
249 0.57
250 0.48
251 0.45
252 0.39
253 0.32
254 0.26
255 0.22
256 0.22
257 0.17
258 0.18
259 0.17
260 0.22
261 0.24
262 0.24
263 0.23
264 0.23
265 0.25
266 0.29
267 0.3
268 0.24
269 0.26
270 0.25
271 0.26
272 0.25
273 0.23
274 0.21
275 0.19
276 0.19
277 0.14
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.12
289 0.14
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.15
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.2
305 0.14
306 0.15
307 0.16
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.22
312 0.23
313 0.31
314 0.35
315 0.37
316 0.39
317 0.46
318 0.48
319 0.45
320 0.47
321 0.41
322 0.37
323 0.37
324 0.35
325 0.3
326 0.28
327 0.27
328 0.2
329 0.19
330 0.17
331 0.15
332 0.13
333 0.12
334 0.12
335 0.16
336 0.18
337 0.16
338 0.21
339 0.23
340 0.23
341 0.25
342 0.25
343 0.23
344 0.21
345 0.21
346 0.18
347 0.14
348 0.12
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.15
362 0.2
363 0.21
364 0.22
365 0.27
366 0.27
367 0.32
368 0.33
369 0.34
370 0.31
371 0.28
372 0.3
373 0.26
374 0.28
375 0.25
376 0.24
377 0.22
378 0.25
379 0.25
380 0.2
381 0.21
382 0.2
383 0.17
384 0.17
385 0.16
386 0.13
387 0.12
388 0.13
389 0.16
390 0.17
391 0.25
392 0.35
393 0.39
394 0.45
395 0.51
396 0.57
397 0.59
398 0.63
399 0.6
400 0.6
401 0.63
402 0.65
403 0.62
404 0.57
405 0.52
406 0.47
407 0.46
408 0.36
409 0.3
410 0.22
411 0.2
412 0.2
413 0.2
414 0.19
415 0.14
416 0.15
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.15
425 0.15
426 0.16
427 0.19
428 0.26
429 0.29
430 0.28
431 0.32
432 0.34
433 0.35
434 0.37
435 0.37
436 0.33
437 0.38
438 0.39
439 0.4
440 0.43
441 0.44
442 0.41
443 0.37
444 0.36
445 0.29
446 0.28
447 0.22
448 0.18
449 0.17
450 0.17
451 0.21
452 0.22
453 0.3
454 0.38
455 0.45
456 0.54
457 0.62
458 0.71
459 0.77
460 0.82
461 0.82
462 0.83
463 0.85
464 0.86
465 0.87
466 0.83
467 0.79
468 0.73
469 0.67
470 0.66
471 0.56
472 0.48
473 0.4
474 0.35
475 0.28
476 0.27
477 0.25
478 0.19
479 0.18
480 0.17