Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PCF8

Protein Details
Accession A0A0C3PCF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-412LSRECPDKGKAPQKKVKKIRKIVEVEESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-404KGKAPQKKVKKIRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032549  DUF4939  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16297  DUF4939  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MPTQTHTQAAQIRATTNPDSASAIDLHHTAALVSLGTARRSTTPTSNQPPTPTNDLDDEPDLDKPDDFNPSGDDPSDDGPGHDRLGDDLDNDEDPLPEDDIEPGESTVTDTSSNEPEQLDRGFTSGILLNLFSQSLASLGTPIQPIPLPLFPTHPPTPLNTMSGSSSKAPVGNATKATELKIGAPSDFDGNQKNAMSWLYSVQTYLLVNEELYDTDTKKVVYALSYMKKDVAHSWAATFQKTSLEKNPPSFSTFANFIKDFKASFTSTDATGTAIAKLRILKQKDSFFSQGLKPFIANRIHMMETTPTKITEWYTQAQKFDAKWRKVNETFGRKEKKMFHPRNSFAEEKDPNAMDVDGVRLSKEERDCHIKEGRCFGCGNKGHLSRECPDKGKAPQKKVKKIRKIVEVEESDDDEKVAGPSIALVNIARALGKDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.29
4 0.26
5 0.23
6 0.24
7 0.22
8 0.22
9 0.18
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.06
21 0.1
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.17
27 0.21
28 0.25
29 0.29
30 0.36
31 0.44
32 0.53
33 0.58
34 0.59
35 0.61
36 0.6
37 0.58
38 0.56
39 0.48
40 0.42
41 0.39
42 0.37
43 0.36
44 0.33
45 0.3
46 0.24
47 0.24
48 0.24
49 0.21
50 0.2
51 0.18
52 0.18
53 0.22
54 0.21
55 0.2
56 0.21
57 0.23
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.18
62 0.19
63 0.21
64 0.17
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.17
69 0.16
70 0.14
71 0.12
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.11
99 0.14
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.17
138 0.18
139 0.25
140 0.26
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.29
145 0.27
146 0.27
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.2
151 0.2
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.15
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.21
163 0.2
164 0.21
165 0.19
166 0.15
167 0.14
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.09
210 0.14
211 0.18
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.18
223 0.19
224 0.18
225 0.17
226 0.13
227 0.17
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.29
232 0.32
233 0.36
234 0.38
235 0.33
236 0.35
237 0.33
238 0.27
239 0.22
240 0.23
241 0.21
242 0.22
243 0.21
244 0.19
245 0.19
246 0.2
247 0.17
248 0.15
249 0.17
250 0.14
251 0.14
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.14
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.13
265 0.18
266 0.24
267 0.27
268 0.31
269 0.35
270 0.41
271 0.42
272 0.46
273 0.43
274 0.38
275 0.38
276 0.37
277 0.36
278 0.31
279 0.29
280 0.24
281 0.23
282 0.28
283 0.27
284 0.24
285 0.21
286 0.23
287 0.23
288 0.23
289 0.23
290 0.2
291 0.2
292 0.22
293 0.2
294 0.17
295 0.17
296 0.18
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.24
301 0.31
302 0.33
303 0.34
304 0.34
305 0.35
306 0.32
307 0.38
308 0.44
309 0.42
310 0.46
311 0.49
312 0.57
313 0.56
314 0.64
315 0.63
316 0.64
317 0.65
318 0.68
319 0.72
320 0.64
321 0.67
322 0.66
323 0.67
324 0.69
325 0.72
326 0.72
327 0.74
328 0.78
329 0.79
330 0.76
331 0.67
332 0.58
333 0.58
334 0.5
335 0.42
336 0.42
337 0.35
338 0.29
339 0.28
340 0.25
341 0.16
342 0.14
343 0.14
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.12
349 0.17
350 0.22
351 0.24
352 0.27
353 0.36
354 0.37
355 0.43
356 0.49
357 0.49
358 0.48
359 0.54
360 0.5
361 0.44
362 0.43
363 0.39
364 0.41
365 0.39
366 0.4
367 0.4
368 0.43
369 0.46
370 0.5
371 0.54
372 0.48
373 0.53
374 0.54
375 0.48
376 0.47
377 0.49
378 0.54
379 0.6
380 0.64
381 0.66
382 0.7
383 0.77
384 0.84
385 0.88
386 0.89
387 0.89
388 0.9
389 0.89
390 0.9
391 0.86
392 0.81
393 0.8
394 0.73
395 0.66
396 0.59
397 0.53
398 0.44
399 0.37
400 0.31
401 0.21
402 0.18
403 0.14
404 0.13
405 0.09
406 0.08
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.12
414 0.12
415 0.1