Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3NNH0

Protein Details
Accession A0A0C3NNH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-53PLPSLRTKKAGKERERDRVREYBasic
811-838RLDWLGQYSKQRKRRKSEVEKQHLPPVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 3, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
Amino Acid Sequences MNDNPTPIALHRCRFVDYSPSPITALAFPPLPLPSLRTKKAGKERERDRVREYGTLVVGHANGNIDLLEWTGEDDELQARQAWQLRKTLPGPNPSKVDTLALTIRFPDTFPSNKTPSLSDLRLFSCGGGSELLEWDTARGCVRRTVPSQGGSIWSMAANPASTMLALGCEDGTIRLLSLAADTLEHFRRFDRVKGRLLCIAWGPPVPRLSKRAAAEKSDPRDDDADAESDDDDEEEWSDSWLVTGGSNSCLQKWDVRTGRPIDRMITDKMKGERTLVWTVGVLADGTIVSGDSLGTVKFWDSMTCTQSHSFSAHAADVLCLTIGPEGTTVFTSGVDQKIVQFSYVSGTPDAPSPAKWIQSASRRVHSHDVRSLAMWPPHMPLAASYRRMPSPGSPYIAPVLVSGGLDMSITLIPALPAHLTTSNVAARVINPIASGVATTFEDSYYRRIPYHTTMCVARKARLVLCMYETGLRIWRILDIPNASTVIDGMDNTTDPETRVGWENLLEMELNVHTNLISSALSDDGRWLVASDLYETKLFKLTTTPTGVVKPKRVRLFTPLLQQQLSVAGSKEPPSTGGNKFVFTPDSTKMIMASASTSIIVVIDLGPAEPTVLRQFEHHRKISSLSGGRVIRGSSRGKATYASHQDEEHDDTDGMSNSGTLPSILQMAVSPDGQWLASSDEWCRTFIYNLDSIQYHITIPSLPHPPNAMAFVPNKPQILFSILPSNTIHVYDVETGEVPSWAHDLNSRIPQQIFSTPDPVLGVIFEPVESPQPLANGDVIMTDSSQDSPRSTSALPPTTILWGSSWLCKLRLDWLGQYSKQRKRRKSEVEKQHLPPVSDIQNSASEARNLRIVTHYRAILAMDFLKSREFVLVEQPLVNVLSKLPPAFFKPKYGRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.4
4 0.36
5 0.41
6 0.39
7 0.39
8 0.36
9 0.34
10 0.33
11 0.26
12 0.25
13 0.19
14 0.17
15 0.16
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.18
21 0.26
22 0.34
23 0.37
24 0.43
25 0.47
26 0.55
27 0.66
28 0.72
29 0.72
30 0.73
31 0.79
32 0.83
33 0.87
34 0.82
35 0.77
36 0.75
37 0.69
38 0.64
39 0.57
40 0.52
41 0.44
42 0.39
43 0.34
44 0.27
45 0.24
46 0.19
47 0.18
48 0.13
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.15
68 0.22
69 0.26
70 0.28
71 0.35
72 0.36
73 0.42
74 0.45
75 0.5
76 0.5
77 0.54
78 0.56
79 0.56
80 0.58
81 0.54
82 0.52
83 0.44
84 0.41
85 0.31
86 0.3
87 0.28
88 0.25
89 0.23
90 0.21
91 0.22
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.22
97 0.27
98 0.33
99 0.36
100 0.38
101 0.4
102 0.37
103 0.38
104 0.41
105 0.38
106 0.34
107 0.33
108 0.33
109 0.33
110 0.31
111 0.26
112 0.19
113 0.17
114 0.15
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.2
129 0.23
130 0.3
131 0.33
132 0.4
133 0.42
134 0.43
135 0.43
136 0.38
137 0.37
138 0.31
139 0.28
140 0.2
141 0.15
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.11
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.24
176 0.26
177 0.33
178 0.37
179 0.39
180 0.47
181 0.51
182 0.54
183 0.52
184 0.5
185 0.45
186 0.37
187 0.33
188 0.26
189 0.24
190 0.22
191 0.2
192 0.24
193 0.25
194 0.27
195 0.29
196 0.32
197 0.36
198 0.38
199 0.44
200 0.43
201 0.46
202 0.5
203 0.55
204 0.56
205 0.55
206 0.52
207 0.46
208 0.44
209 0.38
210 0.33
211 0.26
212 0.21
213 0.16
214 0.16
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.19
240 0.22
241 0.3
242 0.31
243 0.33
244 0.39
245 0.43
246 0.48
247 0.48
248 0.46
249 0.38
250 0.37
251 0.38
252 0.36
253 0.35
254 0.3
255 0.3
256 0.32
257 0.34
258 0.31
259 0.3
260 0.29
261 0.29
262 0.31
263 0.27
264 0.23
265 0.2
266 0.19
267 0.17
268 0.14
269 0.08
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.1
289 0.14
290 0.17
291 0.17
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.21
296 0.18
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.14
338 0.12
339 0.1
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.21
346 0.29
347 0.38
348 0.36
349 0.41
350 0.41
351 0.44
352 0.51
353 0.49
354 0.46
355 0.41
356 0.4
357 0.33
358 0.33
359 0.31
360 0.26
361 0.24
362 0.19
363 0.16
364 0.15
365 0.14
366 0.14
367 0.12
368 0.1
369 0.15
370 0.18
371 0.2
372 0.2
373 0.22
374 0.22
375 0.23
376 0.23
377 0.2
378 0.23
379 0.24
380 0.25
381 0.22
382 0.23
383 0.23
384 0.22
385 0.19
386 0.12
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.1
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.03
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.1
432 0.12
433 0.13
434 0.13
435 0.14
436 0.17
437 0.22
438 0.26
439 0.23
440 0.23
441 0.25
442 0.27
443 0.32
444 0.31
445 0.27
446 0.24
447 0.26
448 0.25
449 0.26
450 0.25
451 0.19
452 0.19
453 0.18
454 0.16
455 0.16
456 0.15
457 0.11
458 0.13
459 0.12
460 0.11
461 0.1
462 0.11
463 0.1
464 0.11
465 0.13
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.05
495 0.06
496 0.05
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.06
517 0.06
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.11
522 0.11
523 0.11
524 0.14
525 0.14
526 0.12
527 0.14
528 0.16
529 0.19
530 0.22
531 0.22
532 0.2
533 0.24
534 0.3
535 0.3
536 0.37
537 0.39
538 0.43
539 0.47
540 0.49
541 0.46
542 0.47
543 0.51
544 0.47
545 0.49
546 0.46
547 0.42
548 0.4
549 0.38
550 0.31
551 0.26
552 0.22
553 0.14
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.12
558 0.13
559 0.1
560 0.12
561 0.13
562 0.18
563 0.18
564 0.25
565 0.25
566 0.25
567 0.25
568 0.24
569 0.24
570 0.2
571 0.22
572 0.16
573 0.18
574 0.18
575 0.18
576 0.16
577 0.15
578 0.14
579 0.1
580 0.09
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.08
599 0.09
600 0.09
601 0.12
602 0.21
603 0.3
604 0.38
605 0.4
606 0.39
607 0.4
608 0.42
609 0.43
610 0.42
611 0.35
612 0.29
613 0.33
614 0.31
615 0.3
616 0.29
617 0.26
618 0.2
619 0.22
620 0.24
621 0.2
622 0.24
623 0.25
624 0.25
625 0.27
626 0.28
627 0.32
628 0.37
629 0.38
630 0.35
631 0.34
632 0.35
633 0.35
634 0.36
635 0.27
636 0.21
637 0.17
638 0.16
639 0.17
640 0.16
641 0.13
642 0.09
643 0.08
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.08
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.08
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.07
663 0.09
664 0.1
665 0.11
666 0.13
667 0.18
668 0.19
669 0.2
670 0.2
671 0.18
672 0.18
673 0.2
674 0.23
675 0.2
676 0.2
677 0.21
678 0.2
679 0.2
680 0.2
681 0.18
682 0.14
683 0.1
684 0.11
685 0.1
686 0.11
687 0.14
688 0.2
689 0.2
690 0.21
691 0.23
692 0.24
693 0.24
694 0.26
695 0.22
696 0.19
697 0.21
698 0.23
699 0.27
700 0.29
701 0.29
702 0.26
703 0.26
704 0.23
705 0.27
706 0.24
707 0.2
708 0.26
709 0.25
710 0.27
711 0.26
712 0.27
713 0.22
714 0.21
715 0.2
716 0.12
717 0.14
718 0.14
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.12
723 0.12
724 0.12
725 0.09
726 0.08
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.11
731 0.14
732 0.19
733 0.27
734 0.28
735 0.3
736 0.31
737 0.32
738 0.32
739 0.35
740 0.35
741 0.3
742 0.32
743 0.28
744 0.28
745 0.27
746 0.24
747 0.18
748 0.13
749 0.11
750 0.08
751 0.08
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.11
756 0.11
757 0.11
758 0.11
759 0.12
760 0.13
761 0.14
762 0.14
763 0.11
764 0.1
765 0.09
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.07
770 0.08
771 0.1
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.16
776 0.17
777 0.2
778 0.2
779 0.24
780 0.3
781 0.34
782 0.33
783 0.32
784 0.32
785 0.32
786 0.31
787 0.26
788 0.18
789 0.18
790 0.19
791 0.22
792 0.25
793 0.24
794 0.25
795 0.25
796 0.26
797 0.28
798 0.32
799 0.31
800 0.32
801 0.37
802 0.42
803 0.45
804 0.54
805 0.57
806 0.61
807 0.67
808 0.73
809 0.75
810 0.78
811 0.85
812 0.86
813 0.88
814 0.89
815 0.91
816 0.91
817 0.91
818 0.86
819 0.84
820 0.76
821 0.67
822 0.58
823 0.53
824 0.48
825 0.41
826 0.38
827 0.32
828 0.31
829 0.31
830 0.31
831 0.27
832 0.26
833 0.26
834 0.26
835 0.28
836 0.25
837 0.25
838 0.3
839 0.32
840 0.34
841 0.38
842 0.37
843 0.33
844 0.33
845 0.32
846 0.26
847 0.24
848 0.2
849 0.17
850 0.17
851 0.17
852 0.18
853 0.17
854 0.17
855 0.17
856 0.16
857 0.15
858 0.22
859 0.26
860 0.26
861 0.26
862 0.25
863 0.24
864 0.23
865 0.23
866 0.15
867 0.12
868 0.15
869 0.17
870 0.18
871 0.18
872 0.2
873 0.27
874 0.35
875 0.36
876 0.43