Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9EDN6

Protein Details
Accession E9EDN6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-54LEPAVAPKRRQTKKTKKAQEKDQSQEPEEHydrophilic
134-159EEEAERKKKKGGRRGKGKRGSDSKDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-42KRRQTKKTKK
122-194EKPWEARRKAHEEEEAERKKKKGGRRGKGKRGSDSKDELEKDGKAKAKASPAPEPASKDKREPASKQGKRKVR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.833, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG maw:MAC_07984  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS01359  ZF_PHD_1  
CDD cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MSIGEAEPRRSVRATKGQHTKSFDELEPAVAPKRRQTKKTKKAQEKDQSQEPEEVIRCVCGATEQDEDSGEAWISCETCYAWQHNVCVGVSSFEDEIPDNYWCEQCRPEDHKELLAGIARGEKPWEARRKAHEEEEAERKKKKGGRRGKGKRGSDSKDELEKDGKAKAKASPAPEPASKDKREPASKQGKRKVREESQDTDGKAAKQRRVSERDVVPGAAKYTKPDDLALAISELAASRSGPAKALKKSIAHVLATLAKDGELKVPDGKTEDSMSEEYALQIERAVYDTHPASKGQKEYNHQIKSLTFNLKNNPEVMRGLLHGVHSPTTLAVMTSEQLASAELQKQTAEMRAKAEKQSILYTQETGPRVRRTRKGEEVVEDETALDEAPLPMAGGPRKGGSQHPPLVKRESTGGDHGESKARSPSQSEAQHSPSQSNFDINKVFSTVKSPTLSHNRRPSAPVLNTNGPGFDPDVDRMLQDETESPPYSPTEESQDPDVIWKGSLAMSSIADFQATAKHVGGANFASFGPWSKLIPKRMTVAGRIPQQSAIEYLCSLRYSNLTDIVVVSITPTSAESQPDFRALVDYFISKGRYGVVGNKVAGNVRDTYLVPVPAGDDGHPEFMLNLVDNYIPKTRTEPMLLAVFVYRNEPDQLKQTKDELTPVATPQPPSVTASPTPAPGGQRSNSTSGPAFSPSTPQGSFGQQHHGGPPQSTTPVPIPQPPHMQRPPPQTAVPPPSHSPPAGGQLTEAQKYQAQQAGQAVAAQVLGDLIGVPTVQFLLPQAFQMSRREWEVIRSIYEKDPRARQDLQYLGALLEKEGSEKRAQGNVVGGSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.55
3 0.64
4 0.68
5 0.73
6 0.76
7 0.7
8 0.66
9 0.64
10 0.55
11 0.5
12 0.42
13 0.37
14 0.33
15 0.31
16 0.31
17 0.31
18 0.32
19 0.34
20 0.44
21 0.5
22 0.57
23 0.67
24 0.72
25 0.78
26 0.87
27 0.9
28 0.9
29 0.91
30 0.93
31 0.93
32 0.91
33 0.88
34 0.87
35 0.82
36 0.74
37 0.68
38 0.58
39 0.54
40 0.46
41 0.4
42 0.31
43 0.25
44 0.22
45 0.18
46 0.17
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.17
56 0.17
57 0.13
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.12
66 0.16
67 0.2
68 0.25
69 0.27
70 0.29
71 0.31
72 0.33
73 0.29
74 0.27
75 0.24
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.13
81 0.14
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.18
90 0.21
91 0.23
92 0.25
93 0.33
94 0.39
95 0.44
96 0.49
97 0.5
98 0.5
99 0.47
100 0.44
101 0.37
102 0.33
103 0.26
104 0.19
105 0.22
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.31
112 0.4
113 0.4
114 0.47
115 0.55
116 0.61
117 0.64
118 0.65
119 0.63
120 0.57
121 0.57
122 0.61
123 0.62
124 0.58
125 0.57
126 0.52
127 0.53
128 0.54
129 0.58
130 0.58
131 0.6
132 0.66
133 0.74
134 0.83
135 0.87
136 0.91
137 0.88
138 0.87
139 0.86
140 0.81
141 0.77
142 0.73
143 0.67
144 0.65
145 0.6
146 0.53
147 0.47
148 0.43
149 0.37
150 0.37
151 0.36
152 0.31
153 0.31
154 0.32
155 0.38
156 0.4
157 0.43
158 0.45
159 0.45
160 0.48
161 0.48
162 0.5
163 0.5
164 0.54
165 0.51
166 0.48
167 0.5
168 0.54
169 0.59
170 0.57
171 0.59
172 0.62
173 0.67
174 0.72
175 0.75
176 0.75
177 0.72
178 0.74
179 0.73
180 0.71
181 0.73
182 0.69
183 0.65
184 0.62
185 0.62
186 0.56
187 0.5
188 0.43
189 0.36
190 0.37
191 0.38
192 0.37
193 0.39
194 0.46
195 0.52
196 0.56
197 0.58
198 0.59
199 0.56
200 0.57
201 0.51
202 0.44
203 0.36
204 0.31
205 0.28
206 0.23
207 0.2
208 0.17
209 0.19
210 0.21
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.17
215 0.18
216 0.16
217 0.12
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.16
230 0.22
231 0.25
232 0.3
233 0.32
234 0.32
235 0.34
236 0.38
237 0.36
238 0.3
239 0.27
240 0.25
241 0.26
242 0.24
243 0.23
244 0.16
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.1
250 0.11
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.17
255 0.18
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.2
281 0.25
282 0.27
283 0.32
284 0.35
285 0.43
286 0.52
287 0.51
288 0.47
289 0.44
290 0.41
291 0.4
292 0.4
293 0.38
294 0.32
295 0.32
296 0.38
297 0.4
298 0.39
299 0.37
300 0.32
301 0.26
302 0.24
303 0.22
304 0.17
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.07
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.16
335 0.17
336 0.15
337 0.18
338 0.22
339 0.24
340 0.26
341 0.28
342 0.24
343 0.23
344 0.25
345 0.23
346 0.23
347 0.21
348 0.2
349 0.19
350 0.23
351 0.23
352 0.22
353 0.25
354 0.28
355 0.34
356 0.39
357 0.45
358 0.48
359 0.54
360 0.6
361 0.61
362 0.57
363 0.54
364 0.51
365 0.45
366 0.38
367 0.3
368 0.22
369 0.16
370 0.13
371 0.09
372 0.05
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.13
387 0.17
388 0.23
389 0.28
390 0.33
391 0.36
392 0.38
393 0.41
394 0.38
395 0.33
396 0.29
397 0.26
398 0.22
399 0.21
400 0.2
401 0.16
402 0.17
403 0.17
404 0.18
405 0.16
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.18
412 0.22
413 0.26
414 0.29
415 0.29
416 0.33
417 0.35
418 0.34
419 0.32
420 0.25
421 0.24
422 0.21
423 0.22
424 0.18
425 0.17
426 0.19
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.16
431 0.11
432 0.15
433 0.14
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.21
438 0.32
439 0.37
440 0.41
441 0.48
442 0.47
443 0.47
444 0.49
445 0.47
446 0.44
447 0.42
448 0.4
449 0.36
450 0.36
451 0.36
452 0.33
453 0.3
454 0.21
455 0.19
456 0.14
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.13
470 0.14
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.14
477 0.16
478 0.17
479 0.18
480 0.19
481 0.19
482 0.17
483 0.18
484 0.18
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.12
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.09
513 0.07
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.16
519 0.22
520 0.28
521 0.31
522 0.32
523 0.33
524 0.37
525 0.39
526 0.35
527 0.36
528 0.35
529 0.39
530 0.39
531 0.36
532 0.33
533 0.31
534 0.28
535 0.23
536 0.18
537 0.12
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.1
545 0.13
546 0.14
547 0.16
548 0.15
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.12
553 0.09
554 0.08
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.07
560 0.08
561 0.11
562 0.11
563 0.15
564 0.16
565 0.17
566 0.17
567 0.14
568 0.16
569 0.14
570 0.15
571 0.13
572 0.12
573 0.12
574 0.14
575 0.15
576 0.12
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.13
581 0.18
582 0.21
583 0.23
584 0.24
585 0.25
586 0.24
587 0.24
588 0.24
589 0.2
590 0.15
591 0.13
592 0.14
593 0.14
594 0.16
595 0.17
596 0.17
597 0.14
598 0.13
599 0.13
600 0.12
601 0.12
602 0.09
603 0.1
604 0.11
605 0.13
606 0.13
607 0.12
608 0.11
609 0.11
610 0.11
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.11
617 0.14
618 0.14
619 0.14
620 0.18
621 0.2
622 0.23
623 0.25
624 0.23
625 0.23
626 0.25
627 0.24
628 0.21
629 0.19
630 0.16
631 0.14
632 0.15
633 0.12
634 0.11
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.24
639 0.29
640 0.31
641 0.33
642 0.34
643 0.37
644 0.36
645 0.38
646 0.31
647 0.29
648 0.27
649 0.25
650 0.29
651 0.26
652 0.26
653 0.24
654 0.25
655 0.22
656 0.25
657 0.25
658 0.24
659 0.22
660 0.26
661 0.26
662 0.25
663 0.25
664 0.23
665 0.24
666 0.24
667 0.28
668 0.24
669 0.29
670 0.31
671 0.34
672 0.32
673 0.32
674 0.29
675 0.26
676 0.26
677 0.23
678 0.22
679 0.18
680 0.23
681 0.22
682 0.25
683 0.24
684 0.25
685 0.24
686 0.27
687 0.31
688 0.28
689 0.34
690 0.32
691 0.33
692 0.33
693 0.37
694 0.33
695 0.3
696 0.3
697 0.25
698 0.25
699 0.24
700 0.25
701 0.23
702 0.27
703 0.28
704 0.31
705 0.33
706 0.37
707 0.47
708 0.48
709 0.54
710 0.55
711 0.6
712 0.62
713 0.66
714 0.68
715 0.62
716 0.6
717 0.56
718 0.58
719 0.59
720 0.56
721 0.52
722 0.48
723 0.49
724 0.5
725 0.45
726 0.39
727 0.34
728 0.37
729 0.33
730 0.3
731 0.25
732 0.29
733 0.33
734 0.31
735 0.29
736 0.23
737 0.23
738 0.25
739 0.29
740 0.26
741 0.21
742 0.23
743 0.25
744 0.25
745 0.23
746 0.23
747 0.18
748 0.14
749 0.13
750 0.1
751 0.07
752 0.05
753 0.05
754 0.04
755 0.03
756 0.03
757 0.03
758 0.04
759 0.04
760 0.04
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.07
765 0.1
766 0.11
767 0.12
768 0.15
769 0.16
770 0.19
771 0.25
772 0.27
773 0.27
774 0.3
775 0.32
776 0.3
777 0.33
778 0.38
779 0.35
780 0.36
781 0.35
782 0.35
783 0.39
784 0.46
785 0.47
786 0.46
787 0.53
788 0.53
789 0.58
790 0.6
791 0.56
792 0.58
793 0.56
794 0.51
795 0.45
796 0.4
797 0.33
798 0.31
799 0.27
800 0.18
801 0.16
802 0.13
803 0.14
804 0.16
805 0.19
806 0.2
807 0.24
808 0.28
809 0.32
810 0.33
811 0.31
812 0.35