Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3JTV1

Protein Details
Accession A0A0C3JTV1    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-262LLPSEEKSKKDKRPKQHSAVGCHydrophilic
382-404IEYMRAKKREQGKREREEQRMIKBasic
446-465DGMPRIGYGRKNPNEKKKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-253KKDKR
450-465RIGYGRKNPNEKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 11.666, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039907  NOB1  
IPR017117  Nob1_euk  
IPR036283  NOB1_Zf-like_sf  
IPR014881  NOB1_Zn-bd  
IPR033411  Ribonuclease_PIN  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004521  F:RNA endonuclease activity  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF08772  NOB1_Zn_bind  
PF17146  PIN_6  
CDD cd09876  PIN_Nob1-like  
Amino Acid Sequences MAEGNKRCKYLVLDSGPLLSLSTLRGLADTYLTVPQVLDELKDKRAREHFEQLGLSAGVQVSVTNPAAASLSQVIHFAKKTGDYAVLSHADICVLALTHTLHEQEKASRDTPQEVIPDQEKVSSIQPPSEGSKDQSSTSSPAQPVGSSESSETNEQIPSSDPSHVLQNDFFDIPQPSGIGTNVEGQVEGEDSASLPPSSDDEATPSDNEPLYADPSSEDDDEGEWITPGNVELHKARALHLLPSEEKSKKDKRPKQHSAVGCMTADFAMQNVLLQMGLHLISTDGRRIQKVKSWVLRCHACFKICKDNSKQFCPSCGNPTLIRTSVTVSSPDADGGAPVMEVHLKKNFQYRVRGTKYPIPAPKPGSAKTGTGEGLILREDQIEYMRAKKREQGKREREEQRMIKSLVESDGKSGVAVGSWADPDWIPDILSGTRSKSRSTQSGRPDGMPRIGYGRKNPNEKKKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.41
4 0.35
5 0.27
6 0.18
7 0.13
8 0.1
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.16
27 0.19
28 0.26
29 0.32
30 0.32
31 0.38
32 0.46
33 0.51
34 0.52
35 0.59
36 0.56
37 0.55
38 0.55
39 0.48
40 0.42
41 0.35
42 0.27
43 0.19
44 0.15
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.06
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.2
70 0.17
71 0.18
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.18
76 0.16
77 0.13
78 0.12
79 0.1
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.13
90 0.15
91 0.17
92 0.22
93 0.25
94 0.25
95 0.28
96 0.3
97 0.32
98 0.32
99 0.31
100 0.29
101 0.25
102 0.28
103 0.25
104 0.25
105 0.21
106 0.21
107 0.18
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.18
114 0.2
115 0.23
116 0.24
117 0.23
118 0.21
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.25
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.28
127 0.23
128 0.24
129 0.23
130 0.21
131 0.21
132 0.22
133 0.2
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.18
138 0.19
139 0.18
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.23
232 0.2
233 0.22
234 0.27
235 0.35
236 0.42
237 0.52
238 0.58
239 0.64
240 0.73
241 0.8
242 0.81
243 0.8
244 0.74
245 0.7
246 0.65
247 0.56
248 0.45
249 0.35
250 0.28
251 0.19
252 0.16
253 0.09
254 0.06
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.08
271 0.11
272 0.13
273 0.15
274 0.17
275 0.19
276 0.23
277 0.3
278 0.36
279 0.41
280 0.45
281 0.48
282 0.52
283 0.57
284 0.53
285 0.53
286 0.49
287 0.43
288 0.41
289 0.42
290 0.47
291 0.44
292 0.49
293 0.5
294 0.56
295 0.59
296 0.62
297 0.65
298 0.54
299 0.56
300 0.55
301 0.49
302 0.46
303 0.43
304 0.39
305 0.33
306 0.35
307 0.33
308 0.28
309 0.27
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.19
314 0.18
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.07
328 0.08
329 0.11
330 0.15
331 0.16
332 0.18
333 0.27
334 0.33
335 0.35
336 0.44
337 0.49
338 0.55
339 0.61
340 0.63
341 0.61
342 0.61
343 0.63
344 0.62
345 0.62
346 0.56
347 0.56
348 0.56
349 0.58
350 0.55
351 0.51
352 0.47
353 0.42
354 0.39
355 0.34
356 0.33
357 0.26
358 0.21
359 0.2
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.12
370 0.13
371 0.2
372 0.27
373 0.29
374 0.31
375 0.38
376 0.47
377 0.54
378 0.63
379 0.66
380 0.69
381 0.75
382 0.84
383 0.86
384 0.82
385 0.82
386 0.79
387 0.75
388 0.72
389 0.64
390 0.56
391 0.49
392 0.44
393 0.39
394 0.36
395 0.28
396 0.23
397 0.24
398 0.22
399 0.2
400 0.18
401 0.13
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.11
415 0.13
416 0.13
417 0.16
418 0.17
419 0.19
420 0.26
421 0.27
422 0.3
423 0.34
424 0.41
425 0.48
426 0.54
427 0.58
428 0.6
429 0.69
430 0.69
431 0.67
432 0.66
433 0.61
434 0.59
435 0.51
436 0.43
437 0.41
438 0.44
439 0.44
440 0.47
441 0.53
442 0.55
443 0.65
444 0.74
445 0.78