Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3JSU5

Protein Details
Accession A0A0C3JSU5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-350GGPSHCPDKCPKKAGKAKAHAMATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, cyto 6, cyto_pero 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MPHHPIAPIPNDDPRDDGPSDDSPSNDNPDDNDLEDNQPDFPDLDAKPGITVFNSLAKAIKLLAHNAHSSPESSSRTKLHKPDTFDGTNPKKLHAFLIQCELNFQDQPQAFKTNHAKLDLLRVEDPDDQPLWMDSWREFVLELQTTFSPHGLGADAEGQLDHLHMKDNQHINKYIVDFNQLASQVQGYRDGVLHHHCHARLPDQIKDEVCQVGKPQTLHELCHLVQEIDVCYWECKEEVQRASKHQASSSSNKSANPGSSGQPKTSQDKSKPSSSNNNSGSSSKLASSNPGNSNLSKPEPSKLSKDRKLTPEECKHHIEGNLCIFCGGPSHCPDKCPKKAGKAKAHAMATTKAALALGWGSTPETKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.33
4 0.31
5 0.29
6 0.3
7 0.34
8 0.31
9 0.29
10 0.27
11 0.3
12 0.34
13 0.3
14 0.27
15 0.24
16 0.28
17 0.29
18 0.27
19 0.26
20 0.22
21 0.23
22 0.25
23 0.23
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.16
30 0.15
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.19
37 0.13
38 0.15
39 0.12
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.19
48 0.14
49 0.18
50 0.21
51 0.23
52 0.25
53 0.25
54 0.26
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.23
59 0.25
60 0.26
61 0.29
62 0.33
63 0.39
64 0.45
65 0.5
66 0.54
67 0.53
68 0.59
69 0.6
70 0.63
71 0.58
72 0.54
73 0.56
74 0.53
75 0.56
76 0.48
77 0.45
78 0.39
79 0.37
80 0.38
81 0.35
82 0.32
83 0.27
84 0.33
85 0.32
86 0.3
87 0.3
88 0.28
89 0.23
90 0.2
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.2
95 0.22
96 0.25
97 0.23
98 0.3
99 0.37
100 0.37
101 0.38
102 0.38
103 0.36
104 0.32
105 0.41
106 0.36
107 0.32
108 0.26
109 0.24
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.21
114 0.18
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.12
119 0.1
120 0.11
121 0.08
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.06
151 0.08
152 0.09
153 0.15
154 0.22
155 0.25
156 0.27
157 0.29
158 0.28
159 0.29
160 0.3
161 0.26
162 0.19
163 0.2
164 0.17
165 0.16
166 0.17
167 0.15
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.18
183 0.17
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.26
190 0.25
191 0.28
192 0.26
193 0.26
194 0.24
195 0.21
196 0.18
197 0.15
198 0.14
199 0.15
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.22
204 0.23
205 0.23
206 0.24
207 0.23
208 0.21
209 0.23
210 0.23
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.09
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.12
224 0.18
225 0.22
226 0.29
227 0.31
228 0.36
229 0.42
230 0.45
231 0.42
232 0.37
233 0.39
234 0.37
235 0.41
236 0.42
237 0.42
238 0.4
239 0.4
240 0.41
241 0.37
242 0.33
243 0.3
244 0.26
245 0.23
246 0.3
247 0.32
248 0.31
249 0.34
250 0.36
251 0.38
252 0.44
253 0.48
254 0.45
255 0.54
256 0.57
257 0.6
258 0.61
259 0.62
260 0.65
261 0.63
262 0.66
263 0.6
264 0.59
265 0.52
266 0.48
267 0.45
268 0.36
269 0.31
270 0.22
271 0.22
272 0.19
273 0.21
274 0.24
275 0.29
276 0.3
277 0.33
278 0.34
279 0.32
280 0.36
281 0.36
282 0.36
283 0.33
284 0.32
285 0.32
286 0.36
287 0.39
288 0.44
289 0.5
290 0.56
291 0.59
292 0.66
293 0.69
294 0.7
295 0.75
296 0.73
297 0.73
298 0.73
299 0.71
300 0.69
301 0.66
302 0.61
303 0.56
304 0.54
305 0.46
306 0.41
307 0.44
308 0.4
309 0.34
310 0.32
311 0.27
312 0.23
313 0.24
314 0.2
315 0.16
316 0.2
317 0.27
318 0.27
319 0.31
320 0.41
321 0.47
322 0.54
323 0.58
324 0.61
325 0.66
326 0.74
327 0.82
328 0.83
329 0.82
330 0.82
331 0.8
332 0.76
333 0.68
334 0.62
335 0.55
336 0.46
337 0.38
338 0.3
339 0.22
340 0.19
341 0.16
342 0.13
343 0.11
344 0.09
345 0.07
346 0.08
347 0.1