Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3JDN7

Protein Details
Accession A0A0C3JDN7    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-167WTEVVHKKSRERRAHSMLRPDQHydrophilic
286-320REDERIPKRSKLKHSKKNKKRVTKPSREPPNPIKEBasic
342-371AFKRLEKDEKRSKRSKNKRKAKHTSDSSSDBasic
425-462SSGSSHRRGRSRRRKSGKGKKCKSKKHLKSHRRMTLKPBasic
628-659AESPEPHKSGHKRRRKRKRKFKGEGYRKEAAMBasic
662-689NHNLGGKHTKRQDKRKRDTPKLSKEEQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-332RIPKRSKLKHSKKNKKRVTKPSREPPNPIKEMKMPRAMEPVKQ
335-336PK
340-363GLAFKRLEKDEKRSKRSKNKRKAK
430-459HRRGRSRRRKSGKGKKCKSKKHLKSHRRMT
634-684HKSGHKRRRKRKRKFKGEGYRKEAAMPDNHNLGGKHTKRQDKRKRDTPKLS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MVNTHSTACRGTRARASSLPQSPTTQPGTEIIGVSPLPKLTPLGSQYSTPIEKPAASNIRSYSDVVRSGSRSPSPVPQGATIDVPGLRTSSPVYPGDIGVPEASQARTVRVRVATHSTNNVLPDNVHCDSLSIFPMSDMEAEQNDWTEVVHKKSRERRAHSMLRPDQTNAVRRAEWQLTLDEREKIRRRSLSMTRDNPEVTSSESDEPSAKGECKGKGPNPRNWGNLKLSENEIDPDAQRAALASWNAANRLANESDGDQTRPSKGNDLEGTAQPTEDELLEPHGREDERIPKRSKLKHSKKNKKRVTKPSREPPNPIKEMKMPRAMEPVKQINPKSYIGLAFKRLEKDEKRSKRSKNKRKAKHTSDSSSDNTSSSKSASTTSESSNDDSISSNSSSDPSSYSGMSDDDSSSTTSESSLSLGGLSSGSSHRRGRSRRRKSGKGKKCKSKKHLKSHRRMTLKPIPPNKYDGSDDIHAFQRFITEGAVYVTDGRVEPKKCAFILSHYLTGKAHEFYVWEVSGDPYKWRLSDFFTQLFNYCFPIDFRMWQREKLQSCYQNSKTVRNYLYELNELWNMIGETDKCTKVHKFWSGLRKELQRDLWKEKLNLEVSSLKKISASAEILEIAQTVAESPEPHKSGHKRRRKRKRKFKGEGYRKEAAMPDNHNLGGKHTKRQDKRKRDTPKLSKEEQERHKAEGLCFICHKSGHFSRNCPDRQTVLNASKSSGVTSFGVGVDFRDIECQRQLASLSRHSPEVSLNFIQARGPTIQEDDGVPDDDLPDLESISDDEDYWTSDSTIPEEEAPNDGIHVYTYRSNQAHGIWEDKTTIDILDYHLAARLVLLLERISRSDFDVVHWHAKRLFRACVALMSSDPLEEEDLGICTLFKSAGNDETNGIADQLKDAPYDMIQLNGVKVRDEDKLTLQRNSSIAKDFTQKIPKPLVVIVHVNGHPARTLWDTTSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.54
4 0.54
5 0.58
6 0.57
7 0.52
8 0.52
9 0.48
10 0.48
11 0.47
12 0.39
13 0.33
14 0.3
15 0.32
16 0.29
17 0.27
18 0.22
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.18
29 0.21
30 0.26
31 0.27
32 0.28
33 0.3
34 0.35
35 0.36
36 0.3
37 0.3
38 0.26
39 0.26
40 0.26
41 0.34
42 0.35
43 0.34
44 0.37
45 0.36
46 0.38
47 0.38
48 0.39
49 0.34
50 0.3
51 0.33
52 0.31
53 0.33
54 0.31
55 0.33
56 0.37
57 0.35
58 0.34
59 0.33
60 0.39
61 0.41
62 0.43
63 0.42
64 0.39
65 0.4
66 0.38
67 0.36
68 0.29
69 0.24
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.15
78 0.19
79 0.19
80 0.22
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.21
85 0.19
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.15
93 0.18
94 0.22
95 0.23
96 0.28
97 0.3
98 0.32
99 0.32
100 0.39
101 0.4
102 0.4
103 0.44
104 0.41
105 0.39
106 0.39
107 0.36
108 0.29
109 0.24
110 0.22
111 0.24
112 0.23
113 0.21
114 0.19
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.19
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.12
135 0.15
136 0.2
137 0.26
138 0.29
139 0.38
140 0.48
141 0.59
142 0.64
143 0.69
144 0.72
145 0.76
146 0.83
147 0.8
148 0.82
149 0.79
150 0.74
151 0.68
152 0.6
153 0.58
154 0.54
155 0.55
156 0.48
157 0.44
158 0.39
159 0.38
160 0.43
161 0.38
162 0.34
163 0.28
164 0.28
165 0.27
166 0.31
167 0.31
168 0.29
169 0.29
170 0.37
171 0.44
172 0.45
173 0.5
174 0.51
175 0.53
176 0.57
177 0.64
178 0.65
179 0.67
180 0.69
181 0.64
182 0.63
183 0.59
184 0.5
185 0.42
186 0.33
187 0.26
188 0.22
189 0.22
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.2
195 0.19
196 0.19
197 0.16
198 0.18
199 0.22
200 0.24
201 0.29
202 0.36
203 0.4
204 0.49
205 0.55
206 0.59
207 0.62
208 0.65
209 0.65
210 0.61
211 0.61
212 0.56
213 0.55
214 0.49
215 0.44
216 0.41
217 0.36
218 0.33
219 0.28
220 0.23
221 0.18
222 0.16
223 0.16
224 0.13
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.16
239 0.16
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.17
248 0.2
249 0.22
250 0.22
251 0.25
252 0.25
253 0.3
254 0.3
255 0.32
256 0.32
257 0.3
258 0.32
259 0.25
260 0.24
261 0.17
262 0.16
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.06
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.15
272 0.14
273 0.15
274 0.19
275 0.24
276 0.31
277 0.38
278 0.41
279 0.45
280 0.54
281 0.62
282 0.69
283 0.7
284 0.73
285 0.76
286 0.84
287 0.89
288 0.9
289 0.93
290 0.92
291 0.92
292 0.91
293 0.93
294 0.92
295 0.92
296 0.92
297 0.91
298 0.92
299 0.86
300 0.83
301 0.8
302 0.79
303 0.73
304 0.64
305 0.57
306 0.54
307 0.57
308 0.55
309 0.55
310 0.46
311 0.42
312 0.51
313 0.48
314 0.43
315 0.42
316 0.43
317 0.4
318 0.45
319 0.43
320 0.39
321 0.41
322 0.4
323 0.34
324 0.29
325 0.27
326 0.25
327 0.27
328 0.27
329 0.26
330 0.27
331 0.28
332 0.29
333 0.33
334 0.33
335 0.4
336 0.46
337 0.53
338 0.59
339 0.65
340 0.73
341 0.77
342 0.84
343 0.86
344 0.87
345 0.87
346 0.9
347 0.92
348 0.93
349 0.91
350 0.89
351 0.86
352 0.81
353 0.75
354 0.69
355 0.61
356 0.53
357 0.45
358 0.35
359 0.28
360 0.23
361 0.19
362 0.15
363 0.13
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.15
368 0.16
369 0.17
370 0.2
371 0.21
372 0.21
373 0.2
374 0.19
375 0.16
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.06
414 0.08
415 0.12
416 0.15
417 0.18
418 0.26
419 0.34
420 0.45
421 0.54
422 0.63
423 0.7
424 0.77
425 0.84
426 0.88
427 0.91
428 0.9
429 0.9
430 0.89
431 0.89
432 0.9
433 0.9
434 0.88
435 0.89
436 0.88
437 0.88
438 0.9
439 0.9
440 0.9
441 0.9
442 0.89
443 0.85
444 0.75
445 0.73
446 0.72
447 0.69
448 0.66
449 0.64
450 0.6
451 0.55
452 0.58
453 0.5
454 0.43
455 0.37
456 0.3
457 0.26
458 0.23
459 0.22
460 0.19
461 0.22
462 0.19
463 0.17
464 0.15
465 0.12
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.07
479 0.11
480 0.12
481 0.14
482 0.16
483 0.18
484 0.17
485 0.19
486 0.18
487 0.17
488 0.23
489 0.24
490 0.27
491 0.25
492 0.25
493 0.23
494 0.24
495 0.22
496 0.15
497 0.13
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.11
502 0.1
503 0.08
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.11
511 0.11
512 0.12
513 0.12
514 0.15
515 0.21
516 0.23
517 0.23
518 0.24
519 0.24
520 0.24
521 0.24
522 0.2
523 0.16
524 0.13
525 0.11
526 0.1
527 0.13
528 0.13
529 0.16
530 0.19
531 0.27
532 0.28
533 0.31
534 0.34
535 0.37
536 0.39
537 0.41
538 0.45
539 0.42
540 0.45
541 0.51
542 0.5
543 0.51
544 0.51
545 0.52
546 0.47
547 0.47
548 0.44
549 0.38
550 0.38
551 0.33
552 0.33
553 0.27
554 0.25
555 0.2
556 0.19
557 0.16
558 0.14
559 0.11
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.09
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.17
569 0.19
570 0.22
571 0.28
572 0.3
573 0.32
574 0.38
575 0.47
576 0.48
577 0.5
578 0.51
579 0.5
580 0.48
581 0.47
582 0.48
583 0.46
584 0.48
585 0.51
586 0.52
587 0.5
588 0.48
589 0.45
590 0.45
591 0.4
592 0.34
593 0.31
594 0.31
595 0.28
596 0.32
597 0.3
598 0.23
599 0.21
600 0.21
601 0.2
602 0.16
603 0.16
604 0.11
605 0.12
606 0.12
607 0.12
608 0.11
609 0.1
610 0.06
611 0.05
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.07
618 0.13
619 0.14
620 0.15
621 0.22
622 0.31
623 0.42
624 0.52
625 0.61
626 0.66
627 0.76
628 0.87
629 0.91
630 0.93
631 0.93
632 0.95
633 0.95
634 0.95
635 0.95
636 0.95
637 0.95
638 0.94
639 0.9
640 0.82
641 0.71
642 0.62
643 0.54
644 0.45
645 0.39
646 0.33
647 0.28
648 0.26
649 0.26
650 0.26
651 0.23
652 0.24
653 0.29
654 0.27
655 0.32
656 0.38
657 0.47
658 0.54
659 0.66
660 0.73
661 0.74
662 0.82
663 0.85
664 0.87
665 0.89
666 0.91
667 0.91
668 0.91
669 0.87
670 0.81
671 0.78
672 0.76
673 0.75
674 0.72
675 0.71
676 0.63
677 0.59
678 0.6
679 0.56
680 0.48
681 0.47
682 0.4
683 0.33
684 0.33
685 0.31
686 0.26
687 0.24
688 0.24
689 0.24
690 0.28
691 0.34
692 0.37
693 0.4
694 0.46
695 0.54
696 0.56
697 0.52
698 0.49
699 0.43
700 0.42
701 0.44
702 0.44
703 0.42
704 0.44
705 0.4
706 0.38
707 0.39
708 0.35
709 0.3
710 0.23
711 0.19
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.11
716 0.11
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.08
722 0.14
723 0.14
724 0.16
725 0.18
726 0.18
727 0.17
728 0.18
729 0.2
730 0.2
731 0.24
732 0.28
733 0.31
734 0.32
735 0.33
736 0.32
737 0.31
738 0.29
739 0.26
740 0.25
741 0.21
742 0.22
743 0.21
744 0.21
745 0.21
746 0.18
747 0.18
748 0.14
749 0.14
750 0.14
751 0.15
752 0.16
753 0.15
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.16
758 0.14
759 0.12
760 0.12
761 0.11
762 0.11
763 0.09
764 0.08
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.06
769 0.08
770 0.08
771 0.07
772 0.08
773 0.09
774 0.1
775 0.11
776 0.11
777 0.11
778 0.13
779 0.13
780 0.14
781 0.15
782 0.14
783 0.15
784 0.16
785 0.16
786 0.16
787 0.17
788 0.15
789 0.13
790 0.13
791 0.11
792 0.1
793 0.1
794 0.1
795 0.13
796 0.16
797 0.22
798 0.23
799 0.24
800 0.26
801 0.27
802 0.31
803 0.29
804 0.3
805 0.24
806 0.25
807 0.24
808 0.22
809 0.21
810 0.15
811 0.13
812 0.1
813 0.1
814 0.11
815 0.13
816 0.13
817 0.13
818 0.14
819 0.14
820 0.13
821 0.12
822 0.11
823 0.08
824 0.09
825 0.09
826 0.08
827 0.1
828 0.12
829 0.13
830 0.13
831 0.14
832 0.16
833 0.19
834 0.18
835 0.19
836 0.26
837 0.29
838 0.37
839 0.38
840 0.38
841 0.39
842 0.43
843 0.47
844 0.45
845 0.45
846 0.38
847 0.41
848 0.39
849 0.38
850 0.35
851 0.3
852 0.25
853 0.23
854 0.2
855 0.17
856 0.16
857 0.12
858 0.12
859 0.11
860 0.11
861 0.09
862 0.1
863 0.1
864 0.09
865 0.08
866 0.07
867 0.08
868 0.08
869 0.08
870 0.11
871 0.13
872 0.21
873 0.23
874 0.24
875 0.24
876 0.25
877 0.25
878 0.22
879 0.2
880 0.14
881 0.12
882 0.13
883 0.14
884 0.14
885 0.13
886 0.13
887 0.14
888 0.13
889 0.18
890 0.16
891 0.14
892 0.16
893 0.16
894 0.18
895 0.21
896 0.21
897 0.17
898 0.18
899 0.2
900 0.23
901 0.26
902 0.27
903 0.31
904 0.4
905 0.44
906 0.47
907 0.46
908 0.46
909 0.45
910 0.45
911 0.4
912 0.37
913 0.34
914 0.33
915 0.39
916 0.38
917 0.43
918 0.51
919 0.51
920 0.52
921 0.57
922 0.55
923 0.51
924 0.5
925 0.46
926 0.4
927 0.41
928 0.36
929 0.36
930 0.35
931 0.36
932 0.33
933 0.3
934 0.25
935 0.21
936 0.24
937 0.2
938 0.23