Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PX41

Protein Details
Accession A0A0C3PX41    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-107KSSAETKPLKIRKKPNPNSSASHydrophilic
204-226QTQHHNGKKTPRKTNERFQRVKPHydrophilic
258-284IVTRGSGFRKEKNKKKRGSYRGGEITLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-275FRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.499, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MDGGIAKTYTLIYHFLKKQSHVKAAKAVKKAAKGVVILRDDVDLDGPQLGEIVSNWEAQSEKSKSGDGKHPKTSKKTVDHNANATKSSAETKPLKIRKKPNPNSSASESSCCEEEVGPKDSTKEIATQNVQPPRLSPSLSSSDSGSKSDAQVFKETESEKLTKSSLIDLVQKEDGARVTKRQKVSESGPAVATAVEIPGNADLQTQHHNGKKTPRKTNERFQRVKPQNVAPNLLVDNGYEAKARPKNDYGERAHQDLIVTRGSGFRKEKNKKKRGSYRGGEITLENHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.4
4 0.45
5 0.52
6 0.55
7 0.62
8 0.58
9 0.58
10 0.6
11 0.66
12 0.68
13 0.65
14 0.64
15 0.6
16 0.61
17 0.61
18 0.55
19 0.49
20 0.44
21 0.42
22 0.43
23 0.39
24 0.34
25 0.3
26 0.27
27 0.24
28 0.21
29 0.18
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.06
38 0.05
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.22
47 0.19
48 0.21
49 0.21
50 0.24
51 0.26
52 0.31
53 0.39
54 0.42
55 0.46
56 0.53
57 0.6
58 0.64
59 0.69
60 0.73
61 0.72
62 0.7
63 0.72
64 0.72
65 0.74
66 0.72
67 0.72
68 0.7
69 0.62
70 0.55
71 0.46
72 0.38
73 0.28
74 0.27
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.26
79 0.36
80 0.44
81 0.51
82 0.55
83 0.65
84 0.69
85 0.77
86 0.82
87 0.82
88 0.82
89 0.78
90 0.76
91 0.72
92 0.68
93 0.58
94 0.51
95 0.41
96 0.35
97 0.3
98 0.24
99 0.18
100 0.12
101 0.15
102 0.16
103 0.19
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.17
110 0.17
111 0.14
112 0.18
113 0.2
114 0.23
115 0.29
116 0.32
117 0.32
118 0.27
119 0.27
120 0.28
121 0.27
122 0.23
123 0.18
124 0.18
125 0.22
126 0.23
127 0.23
128 0.19
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.18
133 0.14
134 0.13
135 0.18
136 0.19
137 0.17
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.21
142 0.21
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.18
155 0.17
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.14
164 0.18
165 0.25
166 0.3
167 0.34
168 0.36
169 0.37
170 0.39
171 0.42
172 0.44
173 0.4
174 0.36
175 0.33
176 0.3
177 0.27
178 0.22
179 0.18
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.08
191 0.13
192 0.15
193 0.2
194 0.23
195 0.26
196 0.29
197 0.4
198 0.47
199 0.52
200 0.6
201 0.65
202 0.72
203 0.76
204 0.84
205 0.84
206 0.85
207 0.82
208 0.78
209 0.79
210 0.77
211 0.78
212 0.73
213 0.69
214 0.67
215 0.64
216 0.62
217 0.51
218 0.46
219 0.38
220 0.33
221 0.25
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.19
229 0.24
230 0.26
231 0.29
232 0.33
233 0.4
234 0.47
235 0.55
236 0.53
237 0.58
238 0.61
239 0.58
240 0.54
241 0.47
242 0.4
243 0.35
244 0.3
245 0.22
246 0.18
247 0.15
248 0.2
249 0.2
250 0.27
251 0.29
252 0.35
253 0.44
254 0.55
255 0.65
256 0.71
257 0.79
258 0.81
259 0.88
260 0.91
261 0.9
262 0.9
263 0.87
264 0.86
265 0.85
266 0.78
267 0.69
268 0.59
269 0.51
270 0.44
271 0.4
272 0.3
273 0.22